1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_64 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.08 0.71 0.0 0.3 0.1 0.4 0.29 0.08 0.09 0.12 0.0 0.15 0.15 0.17 1.0 0.44 0.16 0.38 0.44 0.21 0.25 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.74 1.0 0.39 0.11 0.0 0.09 0.0 0.12 0.07 0.15 0.38 0.91 0.38 0.14 0.02 0.57 0.02 0.11 0.07 0.0 0.0 0.0 0.18 0.43 0.5 0.71 0.37 0.24 0.32 0.15 0.02 0.0
0.45 0.44 0.43 0.36 0.54 0.56 0.38 0.51 0.41 0.41 0.5 0.28 0.91 0.29 0.5 0.87 0.4 0.63 1.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.83 0.02 0.15 0.39 0.5 0.41 0.45 0.41 0.46
0.23 1.0 0.3 0.15 0.24 0.15 0.41 0.0 0.13 0.0 0.3 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.22 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.25 0.06 0.18
0.1 0.0 0.0 0.03 0.05 0.15 0.0 1.0 0.71 0.16 0.0 0.51 0.0 0.04 0.4 0.0 0.35 0.29 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.28 0.04
0.26 1.0 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.45 0.45 0.25 0.79 0.0 0.0 0.0 0.28 0.32 0.0 0.32 0.0 0.0 0.76 0.54 0.6 0.2
0.0 0.12 0.0 0.0 0.32 0.0 0.54 0.61 0.78 0.0 0.0 0.26 0.0 0.5 0.0 1.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.28
0.42 1.0 0.71 0.76 0.72 0.64 0.58 0.57 0.29 0.86 0.45 0.39 0.77 0.85 0.43 0.66 0.49 0.03 0.63 0.0 0.2 0.0 0.42 0.31 0.0 0.37 0.27 0.34 0.31 0.31 0.31 0.33
0.09 0.78 0.0 0.18 0.0 0.59 0.22 0.87 0.0 1.0 0.0 0.22 0.52 0.24 0.15 0.91 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.69 0.0 0.51 0.83 0.16 0.0
0.41 1.0 0.06 0.11 0.42 0.04 0.0 0.05 0.47 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 1.0 0.22 0.6 0.61 0.23 0.05 0.37 0.3 0.26 0.15 0.09 0.03 0.13 0.06 0.03 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.11 0.0 0.46 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.09 0.09 0.0
0.56 1.0 0.76 0.32 0.39 0.55 0.38 0.5 0.43 0.5 0.52 0.61 0.76 0.62 0.81 0.46 0.5 0.21 0.41 0.11 0.0 0.0 0.37 0.39 0.33 0.22 0.32 0.23 0.39 0.45 0.17 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 1.0 0.26 0.38 0.0 0.26 0.18 0.16 0.19 0.27 0.12 0.38 0.85 0.43 0.43 0.89 0.22 0.07 0.84 0.14 0.68 0.0 0.15 0.07 0.86 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.3 1.0 0.44 0.34 0.0 0.16 0.31 0.06 0.0 0.14 0.07 0.23 0.09 0.54 0.54 0.18 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.43 0.38 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.72 0.24 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.27 0.0 0.12 0.0 0.21 0.0 0.0 0.1 0.0 0.31 0.12 0.0 0.0 0.27 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.21
0.05 0.73 0.15 0.3 0.14 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.11 0.06 0.67 0.24 0.32 1.0 0.0 0.08 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.92 0.06 0.0 0.06 0.0
0.5 0.75 0.35 0.2 0.22 0.22 0.36 0.33 0.21 0.15 0.29 0.53 0.94 0.28 0.4 0.98 0.46 0.39 1.0 0.04 0.35 0.0 0.58 0.52 0.54 0.59 0.43 0.12 0.73 0.84 0.43 0.53
0.53 1.0 0.52 0.6 0.45 0.7 0.07 0.81 0.61 0.5 0.57 0.32 0.34 0.13 0.15 0.48 0.03 0.04 0.81 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.27 0.52 0.87 0.69 0.07 0.09 0.02 0.04
0.68 1.0 0.0 0.18 0.08 0.16 0.07 0.29 0.19 0.06 0.27 0.43 0.0 0.0 0.0 0.25 0.14 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.17 0.57 0.0 0.07 0.21 0.0 0.0
0.12 0.41 0.11 0.0 0.05 0.07 0.0 0.16 0.16 0.0 0.28 0.0 0.89 0.0 0.15 0.18 0.07 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.44 0.81 0.37 0.46 0.44 0.61 0.34 0.45 0.25 0.41 0.32 0.49 0.72 0.18 0.34 0.48 0.11 0.01 0.72 0.12 0.0 0.0 0.06 0.07 0.61 0.77 1.0 0.86 0.02 0.12 0.1 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 1.0 0.31 0.17 0.63 0.49 0.02 0.0 0.22 0.29 0.11 0.44 0.06 0.66 0.35 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.1 0.31 0.04 0.0 0.0 0.25 0.0 0.44 0.02 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.61 0.23 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.55 0.09 0.0 1.0 0.0 0.09 0.19 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.16 0.03 0.1 0.03
0.59 0.89 0.05 0.27 0.34 0.0 0.24 0.25 0.12 0.21 0.0 0.36 0.0 0.06 0.51 0.16 0.0 0.41 1.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.4 0.46 0.29 0.15 0.93 0.5 0.35 0.13 0.0
0.08 1.0 0.09 0.0 0.4 0.16 0.0 0.6 0.06 0.18 0.0 0.07 0.24 0.0 0.99 0.46 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.08 0.16 0.0 0.34 0.18 0.74 0.16 0.0 0.08 0.07
0.21 1.0 0.0 0.35 0.0 0.23 0.2 0.18 0.09 0.19 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.19 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.22 0.09 0.0 0.28 0.11 0.64 0.22 0.19 0.59 0.3
0.17 0.87 0.35 0.04 0.08 0.2 0.74 0.75 0.32 0.26 0.0 0.1 0.0 0.14 0.18 0.0 0.07 0.0 0.03 0.42 0.0 0.0 0.0 0.07 0.26 0.21 0.12 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.13 0.81 0.09 0.71 0.25 0.24 0.43 0.47 1.0 0.1 0.21 0.52 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.47 0.6 0.5 0.48 0.6 0.56 0.7 0.96 0.12 0.11
0.48 0.73 0.28 0.16 0.03 0.4 0.13 0.1 0.24 0.12 0.16 0.42 0.04 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 1.0 0.74 0.59 0.0 0.05 0.29 0.07 0.03 0.17 0.05
0.23 1.0 0.27 0.83 0.09 0.69 0.49 0.92 0.68 0.61 0.61 0.35 0.7 0.31 0.27 0.43 0.46 0.25 0.49 0.0 0.0 0.0 0.13 0.36 0.16 0.55 0.46 0.85 0.29 0.49 0.26 0.08
0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.52 0.14 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.59 0.07 0.21 0.41 0.21 0.25 0.16 0.25 0.49 0.11 0.22 0.65 0.36 0.32 0.78 0.22 0.33 1.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.45 0.0 0.18 0.42 0.46 0.36 0.5 0.45 0.45
0.14 0.6 0.28 0.06 0.23 0.16 0.0 0.26 0.35 0.0 0.35 0.2 0.24 1.0 0.54 0.17 0.14 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.08 0.26 0.62 0.28 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.73 0.08 0.41 0.11 0.11 0.1 0.09 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.8 0.36 0.12 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.23 0.57 1.0 0.1 0.0 0.0 0.2
0.05 0.99 0.16 1.0 0.99 0.0 0.56 0.19 0.0 0.0 0.42 0.11 0.0 0.11 0.36 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.63 0.13 0.14 0.62 0.11 0.0 0.04 0.0
0.22 0.74 0.18 0.21 1.0 0.35 0.31 0.19 0.74 0.13 0.09 0.28 0.09 0.09 0.41 0.25 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.26 0.28 0.43 0.0 0.03 0.0 0.03
0.12 1.0 0.0 0.47 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.37 0.0 0.17 0.0 0.16 0.0 0.0 0.13 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.57 0.18 0.2 0.73 0.37 0.56 0.4 1.0 0.53 0.54 0.57 0.68 0.28 0.91 0.63 0.38 0.18 0.36 0.0 0.25 0.0 0.35 0.42 0.05 0.23 0.46 0.71 0.41 0.46 0.36 0.46
0.28 0.86 0.43 0.77 0.37 0.58 0.32 1.0 0.21 0.13 0.09 0.32 0.07 0.4 0.17 0.07 0.03 0.61 0.31 0.15 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.15 0.53 0.5 0.03 0.06 0.16 0.12
0.05 1.0 0.0 0.13 0.02 0.24 0.18 0.0 0.0 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.69 0.61 0.82 0.27 0.9 1.0 0.19 0.44 0.94 0.29 0.1 0.41 0.79 0.49 0.06 0.16 0.01 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.16 0.54 0.89 0.42 0.03 0.08 0.03 0.01
0.03 0.95 0.37 0.13 0.08 0.08 0.28 0.18 0.07 0.07 0.14 0.0 0.07 0.0 0.1 0.0 0.28 0.57 0.2 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.16 1.0 0.0 0.14 0.35 0.0 0.07
0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 0.39 0.38 0.24 0.21 0.39 0.2 0.34 0.36 0.22 0.32 0.19 0.57 0.18 0.29 0.77 0.39 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.52 0.44 0.0 0.13 0.13 0.14 0.45 0.35 0.24 0.34
0.16 1.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.24 0.13 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.17 0.17 0.0 0.0 0.0 0.17 0.26 0.0 0.52 0.39 0.39 0.24 0.09 0.17 0.08
0.12 1.0 0.0 0.06 0.17 0.0 0.22 0.07 0.2 0.09 0.06 0.0 0.29 0.25 0.04 0.0 0.06 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.19 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 1.0 0.55 0.34 0.2 0.48 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.42 0.89 0.72 0.82 0.14 0.15 0.65 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.69 0.42 0.72 0.46 0.28 0.0 0.07 0.07
0.2 0.8 0.0 0.36 0.0 0.25 0.21 0.37 1.0 0.59 0.05 0.15 0.01 0.0 0.16 0.11 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.25 0.18 0.0 0.07 0.0 0.0 0.15 0.55 0.0 0.02
0.04 0.54 0.33 0.0 0.32 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.83 1.0 0.7 0.74 0.71 0.59 0.31 0.73 0.34 0.24 0.7 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.68 0.58 0.0 0.0 0.0 0.71 0.48 0.6 0.32 0.33 0.29 0.48 0.43 0.23 0.02
0.07 1.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.17 0.02 0.0 0.11 0.37 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)