Heatmap: Cluster_198 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo100946	0.72	0.51	0.44	0.56	0.38	0.54	0.66	0.78	0.72	0.79	0.8	0.78	0.41	0.4	0.3	0.51	0.32	0.16	0.56	0.03	0.48	0.06	0.4	0.47	0.65	1.0	0.57	0.55	0.45	0.44	0.4	0.38
Smo111897	0.74	0.63	0.52	0.71	0.67	0.65	0.64	0.75	0.81	0.84	0.79	0.89	0.34	0.5	0.55	0.39	0.29	0.02	0.39	0.12	0.54	0.27	0.33	0.38	0.69	1.0	0.73	0.62	0.28	0.29	0.31	0.32
Smo115320	0.51	0.7	1.0	0.59	0.37	0.36	0.62	0.42	0.58	0.8	0.86	0.87	0.16	0.12	0.09	0.31	0.39	0.68	0.82	0.01	0.56	0.0	0.75	0.72	0.6	0.79	0.28	0.32	0.53	0.48	0.79	0.63
Smo146738	0.76	0.6	0.68	0.65	0.82	0.69	0.61	0.7	0.88	0.9	1.0	0.7	0.11	0.06	0.92	0.18	0.37	0.22	0.2	0.12	0.01	0.0	0.57	0.27	0.01	0.42	0.25	0.33	0.34	0.35	0.4	0.42
Smo150347	1.0	0.91	0.78	0.76	0.73	0.74	0.78	0.7	0.79	0.77	0.72	0.82	0.58	0.79	0.62	0.56	0.61	0.64	0.49	0.13	0.22	0.01	0.54	0.47	0.2	0.58	0.75	0.73	0.55	0.59	0.5	0.57
Smo159119	0.92	0.81	0.69	0.66	0.63	0.57	0.51	0.55	0.56	0.59	0.6	0.65	0.53	1.0	0.67	0.49	0.4	0.34	0.46	0.03	0.07	0.04	0.37	0.37	0.15	0.44	0.53	0.54	0.39	0.41	0.46	0.49
Smo166606	0.96	0.74	0.75	0.78	0.73	0.67	0.69	0.82	0.84	1.0	0.96	0.91	0.65	0.53	0.55	0.51	0.39	0.36	0.51	0.28	0.57	0.26	0.4	0.49	0.68	0.74	0.7	0.68	0.47	0.49	0.67	0.71
Smo175034	0.61	0.58	0.42	0.56	0.5	0.5	0.47	0.62	0.62	0.71	0.79	0.69	0.42	0.62	0.37	0.46	0.27	0.05	0.39	0.0	0.15	0.28	0.34	0.35	0.82	1.0	0.76	0.77	0.34	0.32	0.33	0.41
Smo229723	0.72	0.56	0.45	0.57	0.6	0.64	0.84	0.88	1.0	0.96	0.86	0.99	0.09	0.17	0.17	0.19	0.43	0.08	0.31	0.21	0.29	0.29	0.39	0.31	0.7	0.86	0.61	0.61	0.46	0.48	0.47	0.34
Smo233530	0.7	0.48	0.56	0.55	0.46	0.55	0.49	0.51	0.52	0.67	0.78	0.74	0.29	0.5	0.33	0.33	0.32	0.08	0.3	0.28	0.22	0.1	0.3	0.26	0.51	1.0	0.52	0.52	0.29	0.33	0.37	0.48
Smo234577	0.9	0.59	0.58	0.58	0.6	0.55	0.49	0.56	0.63	0.76	0.85	0.88	0.5	0.61	0.38	0.49	0.44	0.04	0.5	0.34	0.3	0.07	0.41	0.4	0.54	1.0	0.48	0.47	0.45	0.45	0.48	0.69
Smo270132	0.78	0.61	0.5	0.6	0.69	0.58	0.55	0.73	0.71	0.75	0.67	0.74	0.32	0.43	0.36	0.41	0.32	0.07	0.43	0.27	0.25	0.28	0.31	0.31	1.0	0.48	0.39	0.4	0.33	0.33	0.29	0.28
Smo271464	0.75	0.74	0.71	0.75	0.71	0.67	0.82	0.78	0.81	0.88	0.83	0.86	0.57	0.47	0.36	0.62	0.44	0.33	0.58	0.45	0.35	0.15	0.47	0.5	0.97	1.0	0.77	0.86	0.52	0.53	0.42	0.41
Smo402905	1.0	0.88	0.8	0.73	0.73	0.72	0.71	0.75	0.79	0.81	0.78	0.85	0.4	0.52	0.79	0.38	0.42	0.1	0.47	0.17	0.16	0.07	0.37	0.36	0.46	0.45	0.4	0.42	0.47	0.52	0.42	0.47
Smo403494	0.58	0.74	0.88	0.84	0.51	0.78	0.96	1.0	0.76	0.84	0.82	0.89	0.39	0.2	0.15	0.37	0.47	0.9	0.51	0.01	0.32	0.0	0.47	0.44	0.8	0.44	0.41	0.27	0.37	0.47	0.48	0.41
Smo403954	0.88	0.9	0.97	1.0	0.9	0.89	0.85	0.55	0.67	0.78	0.86	0.85	0.15	0.29	0.95	0.33	0.43	0.39	0.36	0.03	0.04	0.16	0.51	0.49	0.01	0.42	0.3	0.4	0.51	0.79	0.4	0.3
Smo405004	0.53	0.81	0.71	0.74	0.47	0.43	0.75	0.48	0.52	0.64	0.64	0.94	0.12	0.12	0.1	0.18	0.44	0.31	0.68	0.04	0.18	0.01	0.64	0.73	1.0	0.36	0.31	0.4	0.31	0.33	0.27	0.24
Smo405969	0.97	1.0	0.49	0.6	0.44	0.46	0.49	0.5	0.64	0.62	0.7	0.91	0.2	0.4	0.28	0.36	0.18	0.17	0.33	0.18	0.2	0.05	0.19	0.22	0.64	0.43	0.54	0.3	0.24	0.25	0.41	0.66
Smo406712	0.52	0.67	0.64	0.63	0.59	0.54	0.61	0.77	0.84	0.95	0.91	0.83	0.6	0.47	0.3	0.46	0.27	0.26	0.37	0.01	0.11	0.11	0.44	0.43	1.0	0.99	0.58	0.66	0.39	0.34	0.3	0.35
Smo407278	1.0	0.69	0.62	0.63	0.71	0.66	0.59	0.71	0.77	0.78	0.8	0.89	0.29	0.41	0.83	0.35	0.35	0.36	0.35	0.22	0.2	0.21	0.44	0.5	0.2	0.55	0.63	0.72	0.41	0.45	0.45	0.49
Smo407341	0.54	0.52	0.54	0.57	0.77	0.7	0.94	0.84	1.0	0.96	0.9	0.76	0.25	0.26	0.99	0.24	0.34	0.15	0.92	0.3	0.26	0.35	0.32	0.34	0.66	0.88	0.57	0.79	0.41	0.45	0.17	0.2
Smo409803	0.77	0.82	0.64	0.79	0.87	0.81	0.95	0.84	0.74	0.86	0.79	0.84	0.59	0.33	0.41	0.45	0.34	0.18	0.46	0.38	0.21	0.28	0.61	0.73	1.0	0.67	0.87	0.91	0.45	0.43	0.35	0.43
Smo410948	0.49	0.36	0.63	0.66	0.16	0.5	0.68	1.0	0.66	0.81	0.96	0.61	0.0	0.0	0.03	0.23	0.22	0.52	0.26	0.0	0.11	0.0	0.24	0.27	0.0	0.23	0.06	0.3	0.21	0.37	0.23	0.08
Smo412487	0.81	0.85	0.92	0.87	0.88	0.98	0.76	0.84	0.99	0.87	0.81	0.79	0.33	0.74	0.43	0.3	0.21	0.23	0.35	0.28	0.9	0.29	0.28	0.25	1.0	0.61	0.63	0.65	0.19	0.21	0.14	0.16
Smo416278	0.6	0.85	0.93	0.75	0.61	0.91	1.0	0.78	0.79	0.94	0.96	0.8	0.37	0.57	0.14	0.43	0.85	0.63	0.46	0.03	0.03	0.0	0.36	0.33	0.29	0.48	0.13	0.4	0.5	0.52	0.44	0.4
Smo422260	1.0	0.73	0.72	0.67	0.66	0.55	0.6	0.54	0.68	0.65	0.76	0.74	0.25	0.58	0.38	0.26	0.37	0.17	0.44	0.0	0.01	0.0	0.3	0.25	0.03	0.38	0.43	0.46	0.32	0.38	0.65	0.55
Smo426366	0.63	0.79	0.43	0.7	0.6	0.53	0.58	0.91	0.84	1.0	0.76	0.81	0.39	0.3	0.46	0.41	0.26	0.24	0.43	0.01	0.29	0.02	0.28	0.25	0.83	0.55	0.46	0.31	0.35	0.28	0.23	0.34
Smo426823	0.91	0.74	0.76	0.8	0.75	0.68	0.68	0.82	0.92	0.98	1.0	0.93	0.6	0.64	0.5	0.57	0.29	0.08	0.44	0.38	0.32	0.22	0.5	0.53	0.86	0.81	0.48	0.41	0.29	0.33	0.42	0.53
Smo431631	0.49	0.43	0.34	0.45	0.45	0.45	0.51	0.6	0.59	0.58	0.53	0.55	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.16	0.52	0.23	0.03	0.01	1.0	0.73	0.46	0.54	0.03	0.03	0.04	0.03
Smo431833	0.9	0.75	0.79	0.58	0.62	0.82	0.78	0.79	0.77	1.0	0.91	0.77	0.46	0.75	0.8	0.42	0.35	0.1	0.34	0.18	0.58	0.02	0.41	0.42	0.91	0.97	0.9	0.75	0.29	0.33	0.31	0.34
Smo431933	0.42	0.42	0.43	0.55	0.42	0.35	0.5	0.51	0.47	0.35	0.52	0.38	0.02	0.07	0.07	0.09	0.21	0.24	0.35	0.12	0.0	0.0	0.35	0.24	0.84	0.3	0.48	1.0	0.17	0.17	0.12	0.11
Smo437285	1.0	0.89	0.85	0.71	0.65	0.62	0.65	0.53	0.67	0.76	0.86	0.81	0.27	0.65	0.85	0.42	0.49	0.49	0.36	0.04	0.04	0.02	0.39	0.34	0.02	0.28	0.2	0.18	0.4	0.44	0.37	0.33
Smo438056	0.77	0.78	0.79	0.86	0.66	0.64	0.86	0.86	0.76	0.78	0.73	0.84	0.64	0.46	0.39	0.57	0.39	0.19	0.55	0.25	0.57	0.35	0.64	0.65	1.0	0.47	0.48	0.41	0.48	0.48	0.44	0.51
Smo441669	0.75	0.64	0.5	0.49	0.5	0.45	0.61	0.69	0.67	0.7	0.68	0.75	0.45	0.57	0.42	0.45	0.27	0.2	0.35	0.07	0.3	0.03	0.23	0.19	1.0	0.44	0.69	0.63	0.36	0.36	0.22	0.2
Smo444430	0.7	0.6	0.54	0.57	0.53	0.57	0.69	0.83	0.88	0.97	0.88	0.92	0.29	0.22	0.18	0.34	0.29	0.03	0.27	0.13	0.36	0.17	0.34	0.36	0.91	1.0	0.55	0.51	0.38	0.35	0.25	0.2
Smo447043	1.0	0.92	0.88	0.84	0.81	0.73	0.79	0.68	0.73	0.79	0.82	0.91	0.54	0.63	0.65	0.58	0.49	0.19	0.54	0.54	0.26	0.25	0.56	0.55	0.96	0.52	0.73	0.7	0.46	0.52	0.55	0.61
Smo447461	0.95	0.86	0.6	0.73	0.56	0.52	0.54	0.59	0.68	0.68	0.83	0.93	0.32	0.52	0.32	0.57	0.25	0.01	0.36	0.31	0.69	0.21	0.29	0.3	0.89	0.6	0.72	0.42	0.3	0.32	0.68	1.0
Smo447658	0.75	0.58	0.45	0.63	0.62	0.67	0.63	0.87	1.0	0.97	0.92	0.91	0.27	0.23	0.35	0.31	0.35	0.13	0.33	0.22	0.45	0.44	0.39	0.42	0.86	0.68	0.55	0.49	0.38	0.37	0.36	0.3
Smo448335	0.94	0.94	0.91	0.84	0.71	0.72	0.83	0.83	0.86	0.93	0.96	0.88	0.47	0.73	0.89	0.5	0.44	0.26	0.19	0.1	0.12	0.17	0.33	0.27	0.43	0.38	0.59	0.64	0.44	0.48	1.0	0.73
Smo448886	0.72	0.78	0.77	0.75	0.78	0.68	0.64	0.8	0.78	0.84	0.85	0.81	0.51	0.48	0.47	0.51	0.41	0.21	0.53	0.38	0.42	0.36	0.47	0.46	1.0	0.72	0.63	0.55	0.42	0.42	0.45	0.45
Smo448890	0.76	0.82	0.71	0.68	0.65	0.69	0.67	0.75	0.92	0.91	0.86	0.86	0.45	0.46	0.4	0.49	0.4	0.05	0.56	0.24	0.45	0.36	0.45	0.49	0.95	1.0	0.6	0.64	0.42	0.44	0.36	0.33
Smo449239	0.62	0.49	0.35	0.48	0.45	0.57	0.61	0.7	0.77	0.78	0.83	0.78	0.14	0.17	0.12	0.24	0.22	0.13	0.18	0.32	0.27	0.46	0.25	0.32	0.67	1.0	0.44	0.46	0.24	0.27	0.25	0.23
Smo65231	0.76	0.88	0.8	0.82	0.68	0.8	0.64	0.64	0.71	0.72	0.78	0.79	0.39	0.73	0.43	0.5	0.61	0.42	0.36	0.26	0.41	0.17	0.7	0.63	1.0	0.5	0.56	0.66	0.43	0.48	0.38	0.4
Smo76541	0.84	1.0	0.67	0.66	0.66	0.61	0.67	0.63	0.65	0.63	0.64	0.77	0.38	0.3	0.1	0.9	0.33	0.06	0.37	0.17	0.06	0.11	0.32	0.22	0.8	0.68	0.57	0.37	0.43	0.42	0.25	0.18
Smo77083	0.69	0.75	0.75	0.71	0.71	0.72	0.9	1.0	0.93	0.95	0.87	0.83	0.5	0.52	0.6	0.51	0.46	0.41	0.56	0.41	0.38	0.49	0.48	0.45	0.94	0.85	0.7	0.68	0.48	0.47	0.44	0.5
Smo79938	0.94	0.93	0.88	0.8	1.0	0.84	0.75	0.73	0.8	0.77	0.77	0.76	0.52	0.65	0.96	0.63	0.55	0.59	0.7	0.09	0.15	0.27	0.49	0.43	0.05	0.37	0.51	0.53	0.51	0.51	0.42	0.52
Smo82176	0.89	0.85	0.87	0.81	0.88	0.83	0.76	0.64	0.87	0.88	0.8	0.69	0.51	0.49	0.53	0.5	0.46	0.37	0.3	0.4	0.49	0.07	0.41	0.42	1.0	0.48	0.51	0.63	0.39	0.37	0.33	0.29
Smo90221	0.74	0.76	0.84	0.72	0.81	0.74	0.77	0.64	0.74	0.91	1.0	0.74	0.46	0.51	0.72	0.44	0.61	0.5	0.47	0.26	0.06	0.29	0.55	0.58	0.1	0.48	0.41	0.56	0.53	0.65	0.45	0.5
Smo96572	0.8	0.85	0.93	0.75	0.71	0.73	0.68	0.66	0.77	0.86	0.84	0.81	0.23	0.13	0.99	0.42	0.15	0.14	0.1	0.03	0.18	0.0	0.27	0.28	0.01	1.0	0.69	0.71	0.17	0.2	0.12	0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)