1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_204 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.18 0.19 0.22 0.2 0.26 0.23 0.26 0.24 0.24 0.22 0.22 0.19 0.15 0.14 0.77 0.18 0.17 0.15 0.18 1.0 0.22 0.46 0.17 0.18 0.16 0.15 0.19 0.19 0.17 0.2 0.12 0.13
0.22 0.18 0.19 0.18 0.24 0.21 0.25 0.28 0.31 0.3 0.27 0.26 0.2 0.22 0.27 0.21 0.15 0.17 0.21 1.0 0.38 0.22 0.18 0.2 0.19 0.32 0.2 0.17 0.17 0.17 0.18 0.21
0.2 0.19 0.19 0.21 0.19 0.24 0.25 0.13 0.22 0.16 0.18 0.13 0.07 0.02 0.59 0.09 0.61 0.28 0.13 1.0 0.07 0.58 0.08 0.07 0.08 0.02 0.06 0.11 0.31 0.31 0.09 0.06
0.25 0.25 0.25 0.25 0.26 0.33 0.32 0.29 0.35 0.32 0.28 0.27 0.2 0.22 0.41 0.24 0.15 0.11 0.2 1.0 0.1 0.51 0.2 0.24 0.15 0.24 0.22 0.22 0.19 0.2 0.16 0.16
0.07 0.07 0.12 0.11 0.12 0.11 0.15 0.05 0.1 0.1 0.1 0.08 0.14 0.12 1.0 0.16 0.13 0.06 0.15 0.41 0.13 0.3 0.08 0.05 0.12 0.07 0.11 0.09 0.12 0.16 0.11 0.11
0.16 0.15 0.17 0.15 0.15 0.18 0.14 0.14 0.15 0.16 0.15 0.14 0.36 0.51 0.71 0.35 0.19 0.24 0.29 1.0 0.44 0.92 0.2 0.23 0.19 0.09 0.07 0.07 0.17 0.18 0.14 0.19
0.13 0.13 0.14 0.13 0.14 0.14 0.13 0.13 0.15 0.12 0.14 0.12 0.36 0.48 0.75 0.32 0.16 0.17 0.23 1.0 0.27 0.64 0.19 0.21 0.25 0.22 0.14 0.13 0.14 0.15 0.13 0.14
0.17 0.21 0.22 0.22 0.23 0.24 0.26 0.23 0.27 0.23 0.25 0.23 0.14 0.11 1.0 0.15 0.24 0.19 0.29 0.85 0.39 0.84 0.21 0.2 0.38 0.14 0.26 0.26 0.19 0.19 0.19 0.24
0.27 0.24 0.27 0.3 0.3 0.28 0.31 0.37 0.38 0.41 0.37 0.34 0.43 0.59 0.85 0.48 0.27 0.21 0.42 1.0 0.59 0.8 0.27 0.31 0.35 0.63 0.32 0.32 0.32 0.34 0.28 0.27
0.28 0.35 0.39 0.43 0.46 0.44 0.47 0.49 0.43 0.43 0.37 0.33 0.34 0.44 0.7 0.36 0.23 0.16 0.3 1.0 0.13 0.34 0.27 0.28 0.34 0.4 0.51 0.53 0.23 0.25 0.23 0.23
0.29 0.28 0.31 0.29 0.28 0.33 0.28 0.25 0.26 0.26 0.28 0.23 0.24 0.23 0.65 0.19 0.26 0.17 0.18 1.0 0.21 0.49 0.23 0.25 0.25 0.22 0.23 0.26 0.21 0.24 0.17 0.13
0.18 0.22 0.17 0.18 0.18 0.15 0.14 0.17 0.21 0.21 0.19 0.18 0.09 0.1 1.0 0.06 0.14 0.09 0.16 0.36 0.23 0.06 0.07 0.03 0.09 0.11 0.11 0.15 0.09 0.1 0.11 0.12
0.22 0.23 0.21 0.24 0.29 0.32 0.31 0.26 0.32 0.21 0.23 0.19 0.08 0.29 1.0 0.31 0.22 0.24 0.14 0.57 0.28 0.58 0.12 0.12 0.31 0.12 0.23 0.26 0.2 0.23 0.1 0.1
0.04 0.07 0.05 0.16 0.02 0.11 0.07 0.08 0.04 0.02 0.06 0.07 0.05 0.02 1.0 0.08 0.1 0.0 0.03 0.34 0.07 0.92 0.01 0.01 0.06 0.03 0.07 0.03 0.06 0.08 0.01 0.0
0.4 0.47 0.41 0.44 0.41 0.44 0.33 0.32 0.33 0.38 0.34 0.35 0.67 0.78 0.85 0.51 0.33 0.43 0.34 0.99 0.64 1.0 0.49 0.54 0.35 0.19 0.2 0.24 0.28 0.3 0.28 0.34
0.22 0.2 0.19 0.22 0.3 0.3 0.24 0.26 0.27 0.22 0.23 0.18 0.24 0.16 1.0 0.21 0.14 0.3 0.27 0.83 0.17 0.29 0.15 0.21 0.17 0.23 0.28 0.24 0.16 0.19 0.22 0.32
0.14 0.15 0.15 0.17 0.17 0.2 0.18 0.11 0.16 0.16 0.14 0.13 0.11 0.06 1.0 0.15 0.21 0.15 0.06 0.65 0.18 0.48 0.02 0.02 0.03 0.03 0.06 0.07 0.1 0.13 0.08 0.07
0.18 0.17 0.1 0.13 0.11 0.21 0.19 0.07 0.06 0.08 0.2 0.1 0.14 0.04 0.9 0.31 0.09 0.04 0.1 1.0 0.27 0.53 0.02 0.03 0.08 0.03 0.04 0.13 0.04 0.04 0.06 0.05
0.16 0.17 0.19 0.17 0.21 0.21 0.19 0.18 0.19 0.15 0.18 0.14 0.25 0.24 1.0 0.25 0.08 0.09 0.26 0.45 0.4 0.77 0.12 0.13 0.17 0.13 0.21 0.31 0.09 0.11 0.05 0.06
0.06 0.07 0.08 0.06 0.06 0.08 0.09 0.07 0.11 0.09 0.07 0.05 0.1 0.07 1.0 0.11 0.12 0.14 0.03 0.68 0.15 0.36 0.03 0.02 0.05 0.04 0.03 0.05 0.08 0.05 0.04 0.03
0.18 0.19 0.22 0.21 0.24 0.23 0.28 0.26 0.3 0.26 0.21 0.21 0.32 0.34 0.7 0.33 0.22 0.22 0.32 1.0 0.36 0.6 0.31 0.36 0.15 0.29 0.38 0.33 0.22 0.25 0.23 0.32
0.12 0.09 0.12 0.19 0.18 0.19 0.17 0.09 0.18 0.15 0.12 0.08 0.11 0.06 1.0 0.13 0.14 0.04 0.16 0.3 0.1 0.01 0.02 0.05 0.0 0.02 0.03 0.1 0.06 0.07 0.05 0.04
0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.22 0.07 1.0 0.13 0.02 0.0 0.18 0.21 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.02
0.05 0.06 0.07 0.06 0.07 0.08 0.1 0.06 0.09 0.07 0.08 0.06 0.07 0.04 1.0 0.07 0.1 0.08 0.04 0.99 0.08 0.37 0.01 0.01 0.05 0.02 0.04 0.06 0.04 0.05 0.02 0.02
0.23 0.23 0.26 0.26 0.35 0.39 0.36 0.39 0.32 0.32 0.27 0.24 0.31 0.25 0.51 0.32 0.19 0.18 0.31 1.0 0.28 0.41 0.22 0.25 0.24 0.38 0.51 0.51 0.2 0.23 0.18 0.18
0.13 0.15 0.15 0.19 0.15 0.15 0.13 0.1 0.12 0.11 0.12 0.1 0.11 0.09 1.0 0.17 0.21 0.2 0.22 0.61 0.27 0.25 0.18 0.23 0.16 0.08 0.16 0.13 0.13 0.12 0.55 0.38
0.24 0.19 0.2 0.24 0.2 0.28 0.26 0.25 0.23 0.25 0.2 0.17 0.16 0.28 0.5 0.17 0.13 0.1 0.12 1.0 0.18 0.97 0.14 0.14 0.21 0.1 0.16 0.17 0.12 0.13 0.06 0.06
0.07 0.14 0.04 0.05 0.06 0.08 0.07 0.04 0.11 0.07 0.06 0.09 0.17 0.11 0.58 0.25 0.18 0.4 0.2 1.0 0.05 0.51 0.1 0.12 0.23 0.21 0.19 0.33 0.17 0.18 0.03 0.1
0.1 0.11 0.13 0.15 0.17 0.17 0.18 0.12 0.22 0.15 0.15 0.1 0.08 0.02 1.0 0.1 0.18 0.11 0.05 0.2 0.09 0.59 0.02 0.01 0.03 0.05 0.06 0.13 0.08 0.11 0.05 0.04
0.29 0.35 0.39 0.4 0.32 0.4 0.41 0.31 0.43 0.35 0.35 0.34 0.17 0.22 1.0 0.26 0.32 0.25 0.12 1.0 0.11 0.64 0.08 0.12 0.06 0.23 0.17 0.23 0.2 0.2 0.12 0.11
0.13 0.13 0.13 0.22 0.26 0.26 0.24 0.25 0.21 0.19 0.17 0.14 0.11 0.09 0.35 0.11 0.05 0.03 0.03 1.0 0.11 0.05 0.04 0.04 0.08 0.24 0.33 0.48 0.04 0.05 0.03 0.02
0.26 0.23 0.31 0.29 0.32 0.32 0.28 0.24 0.28 0.25 0.22 0.19 0.2 0.08 1.0 0.22 0.26 0.2 0.13 0.28 0.04 0.38 0.08 0.1 0.17 0.17 0.24 0.25 0.13 0.15 0.1 0.09
0.06 0.05 0.07 0.08 0.09 0.12 0.11 0.1 0.07 0.08 0.06 0.05 0.14 0.12 0.47 0.14 0.09 0.1 0.16 1.0 0.1 0.4 0.09 0.11 0.21 0.14 0.25 0.21 0.07 0.1 0.07 0.08
0.05 0.06 0.03 0.07 0.04 0.05 0.06 0.06 0.04 0.04 0.04 0.05 0.24 0.38 1.0 0.28 0.22 0.15 0.28 0.87 0.49 0.8 0.2 0.21 0.34 0.19 0.22 0.18 0.18 0.18 0.19 0.19
0.1 0.11 0.13 0.16 0.17 0.18 0.19 0.12 0.17 0.15 0.14 0.12 0.06 0.05 1.0 0.09 0.22 0.11 0.04 0.55 0.18 0.37 0.01 0.01 0.1 0.03 0.07 0.07 0.09 0.12 0.08 0.05
0.2 0.18 0.19 0.11 0.17 0.09 0.09 0.06 0.09 0.1 0.2 0.19 0.03 0.26 0.74 0.1 0.21 0.39 0.52 1.0 0.26 0.33 0.05 0.07 0.07 0.11 0.13 0.11 0.18 0.15 0.04 0.07
0.29 0.28 0.32 0.33 0.35 0.4 0.36 0.4 0.4 0.36 0.35 0.28 0.35 0.49 0.7 0.38 0.26 0.18 0.32 1.0 0.34 0.7 0.35 0.38 0.25 0.34 0.35 0.36 0.25 0.26 0.2 0.24
0.13 0.16 0.19 0.18 0.19 0.2 0.22 0.14 0.16 0.15 0.16 0.14 0.07 0.04 0.73 0.14 0.19 0.1 0.22 1.0 0.09 0.25 0.07 0.04 0.11 0.12 0.11 0.13 0.14 0.17 0.07 0.07
0.12 0.16 0.17 0.19 0.25 0.25 0.25 0.25 0.23 0.21 0.17 0.14 0.12 0.12 0.37 0.14 0.11 0.06 0.2 1.0 0.24 0.19 0.1 0.11 0.18 0.23 0.25 0.28 0.12 0.13 0.05 0.04
0.28 0.25 0.29 0.24 0.28 0.3 0.29 0.29 0.26 0.23 0.24 0.21 0.5 0.48 0.38 0.79 0.42 0.4 0.62 1.0 0.59 0.99 0.31 0.52 0.39 0.11 0.14 0.13 0.41 0.46 0.4 0.4
0.28 0.29 0.32 0.3 0.36 0.35 0.31 0.28 0.24 0.24 0.23 0.22 0.39 0.35 1.0 0.46 0.29 0.26 0.5 0.68 0.14 0.41 0.29 0.31 0.4 0.38 0.38 0.38 0.3 0.31 0.22 0.23
0.35 0.38 0.32 0.41 0.33 0.37 0.35 0.37 0.34 0.36 0.36 0.33 0.32 0.67 0.7 0.29 0.25 0.23 0.35 1.0 0.58 0.73 0.28 0.29 0.47 0.31 0.27 0.26 0.22 0.23 0.19 0.19
0.12 0.13 0.12 0.12 0.15 0.14 0.16 0.18 0.24 0.21 0.2 0.18 0.46 0.51 0.66 0.59 0.16 0.2 0.31 1.0 0.47 0.98 0.45 0.71 0.16 0.22 0.16 0.14 0.28 0.32 0.4 0.45
0.03 0.06 0.08 0.06 0.12 0.06 0.04 0.03 0.06 0.02 0.04 0.05 0.03 0.01 0.32 0.05 0.08 0.06 0.03 1.0 0.07 0.17 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.04 0.06 0.02 0.01
0.25 0.22 0.21 0.22 0.21 0.29 0.27 0.3 0.24 0.31 0.25 0.26 0.12 0.2 0.38 0.14 0.1 0.04 0.19 1.0 0.34 0.21 0.09 0.11 0.19 0.21 0.26 0.2 0.11 0.12 0.13 0.13
0.27 0.2 0.31 0.27 0.24 0.2 0.18 0.23 0.22 0.22 0.21 0.18 0.6 0.55 0.49 0.66 0.26 0.46 0.48 1.0 0.29 0.65 0.34 0.45 0.83 0.65 0.5 0.64 0.25 0.31 0.18 0.23
0.35 0.36 0.38 0.43 0.49 0.42 0.35 0.36 0.3 0.41 0.32 0.35 0.51 0.48 0.91 0.57 0.31 0.31 0.54 1.0 0.69 0.42 0.39 0.37 0.74 0.47 0.5 0.6 0.33 0.37 0.28 0.32
0.16 0.16 0.2 0.2 0.16 0.22 0.21 0.14 0.16 0.14 0.16 0.12 0.08 0.02 1.0 0.14 0.2 0.09 0.03 0.6 0.16 0.62 0.02 0.02 0.11 0.02 0.07 0.16 0.09 0.13 0.08 0.06
0.06 0.1 0.09 0.12 0.1 0.14 0.11 0.09 0.06 0.08 0.06 0.09 0.15 0.35 1.0 0.11 0.05 0.03 0.27 0.56 0.03 0.15 0.05 0.05 0.14 0.1 0.16 0.19 0.04 0.05 0.04 0.04
0.38 0.41 0.41 0.39 0.41 0.41 0.37 0.33 0.44 0.42 0.39 0.38 0.07 0.04 0.9 0.18 0.23 0.17 0.22 0.95 0.24 1.0 0.06 0.06 0.02 0.1 0.1 0.14 0.15 0.23 0.16 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)