Heatmap: Cluster_203 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo102153	0.0	0.01	0.0	0.0	0.21	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.74	0.53	0.71	0.0	0.0	1.0	0.4	0.48	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo102690	0.24	0.23	0.19	0.23	0.19	0.27	0.27	0.24	0.32	0.32	0.27	0.27	0.31	0.22	0.24	0.44	0.25	0.33	0.29	0.61	0.38	0.6	0.35	0.32	1.0	0.2	0.16	0.24	0.31	0.31	0.17	0.18
Smo105740	0.29	0.26	0.31	0.29	0.32	0.33	0.29	0.39	0.38	0.37	0.4	0.32	0.63	0.37	0.4	0.61	0.44	0.49	0.55	0.27	0.57	1.0	0.59	0.63	0.78	0.69	0.59	0.55	0.39	0.45	0.54	0.55
Smo109785	0.11	0.17	0.14	0.24	0.27	0.33	0.25	0.25	0.22	0.14	0.14	0.16	0.15	0.19	0.23	0.19	0.2	0.16	0.23	0.52	0.73	0.7	0.28	0.27	1.0	0.7	0.74	0.75	0.18	0.19	0.16	0.13
Smo110192	0.19	0.16	0.18	0.2	0.21	0.19	0.2	0.22	0.27	0.25	0.26	0.23	0.33	0.23	0.35	0.31	0.15	0.09	0.29	0.45	0.28	0.73	0.23	0.31	0.25	1.0	0.64	0.62	0.17	0.2	0.22	0.23
Smo113284	0.04	0.03	0.03	0.05	0.06	0.05	0.09	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.21	0.1	0.1	0.24	0.08	0.18	0.35	0.22	0.58	0.33	0.09	0.12	1.0	0.67	0.29	0.23	0.18	0.21	0.4	0.48
Smo140411	0.34	0.43	0.51	0.67	0.84	0.82	0.57	0.58	0.42	0.4	0.39	0.29	0.59	0.64	0.67	0.65	0.43	0.34	0.54	0.82	0.76	0.36	0.59	0.55	0.93	0.91	0.94	1.0	0.26	0.29	0.34	0.38
Smo141796	0.31	0.36	0.35	0.4	0.41	0.39	0.41	0.45	0.38	0.42	0.37	0.37	0.51	0.45	0.46	0.6	0.32	0.28	0.56	0.44	0.6	0.49	0.48	0.54	0.61	1.0	0.92	0.9	0.39	0.38	0.31	0.32
Smo167775	0.39	0.47	0.53	0.55	0.66	0.77	0.57	0.62	0.5	0.48	0.47	0.42	0.4	0.46	0.65	0.52	0.39	0.3	0.57	0.3	0.77	0.45	0.37	0.41	0.97	0.65	0.89	1.0	0.31	0.31	0.31	0.34
Smo172623	0.4	0.38	0.35	0.38	0.4	0.42	0.48	0.54	0.55	0.53	0.49	0.43	0.27	0.27	0.26	0.32	0.35	0.31	0.32	0.33	0.75	0.58	0.31	0.3	1.0	0.69	0.64	0.55	0.34	0.36	0.32	0.43
Smo175895	0.12	0.15	0.16	0.17	0.15	0.2	0.2	0.16	0.15	0.15	0.14	0.12	0.33	0.21	0.36	0.38	0.23	0.19	0.25	0.46	0.1	0.47	0.21	0.26	0.32	1.0	0.59	0.95	0.21	0.21	0.13	0.05
Smo227538	0.17	0.16	0.22	0.19	0.23	0.2	0.21	0.26	0.27	0.23	0.25	0.24	0.41	0.3	0.39	0.37	0.22	0.23	0.29	0.43	0.94	0.8	0.23	0.28	0.64	1.0	0.71	0.59	0.24	0.25	0.3	0.31
Smo230763	0.12	0.14	0.14	0.13	0.13	0.19	0.16	0.21	0.14	0.1	0.12	0.09	0.11	0.11	0.12	0.16	0.18	0.29	0.18	0.57	0.42	1.0	0.15	0.16	0.41	0.48	1.0	0.79	0.18	0.15	0.26	0.25
Smo403651	0.09	0.09	0.23	0.06	0.14	0.08	0.18	0.14	0.11	0.26	0.12	0.2	0.2	0.44	0.38	0.19	0.24	0.14	0.22	0.0	0.13	0.11	0.17	0.18	0.53	0.76	1.0	0.8	0.18	0.26	0.24	0.23
Smo404625	0.2	0.2	0.13	0.19	0.15	0.17	0.15	0.23	0.18	0.24	0.16	0.18	0.09	0.2	0.15	0.11	0.08	0.02	0.13	0.45	0.46	0.51	0.08	0.1	0.67	1.0	0.89	0.82	0.1	0.07	0.05	0.06
Smo407063	0.18	0.23	0.24	0.29	0.31	0.35	0.29	0.29	0.28	0.24	0.21	0.17	0.24	0.35	0.33	0.31	0.14	0.16	0.31	0.04	0.51	1.0	0.2	0.22	0.53	0.43	0.68	0.53	0.12	0.13	0.12	0.14
Smo407236	0.31	0.31	0.32	0.41	0.51	0.48	0.4	0.37	0.29	0.31	0.31	0.26	0.33	0.29	0.21	0.38	0.26	0.27	0.37	0.14	0.81	0.16	0.3	0.3	1.0	0.48	0.52	0.61	0.2	0.2	0.24	0.31
Smo409557	0.3	0.27	0.25	0.32	0.36	0.35	0.36	0.34	0.39	0.32	0.31	0.31	0.21	0.24	0.61	0.29	0.18	0.2	0.26	0.63	0.88	0.56	0.3	0.36	1.0	0.75	0.87	0.72	0.22	0.23	0.18	0.17
Smo410382	0.13	0.17	0.21	0.4	0.53	0.65	0.3	0.26	0.32	0.25	0.23	0.18	0.19	0.27	0.27	0.26	0.14	0.11	0.23	0.35	0.59	0.29	0.29	0.33	1.0	0.53	0.77	0.44	0.09	0.12	0.09	0.08
Smo410451	0.42	0.39	0.31	0.33	0.31	0.29	0.37	0.38	0.41	0.45	0.38	0.39	0.23	0.27	0.33	0.22	0.16	0.08	0.27	0.54	0.59	0.62	0.26	0.28	1.0	0.76	0.74	0.68	0.2	0.2	0.82	0.48
Smo412571	0.11	0.29	0.32	0.19	0.11	0.16	0.22	0.17	0.26	0.13	0.17	0.13	0.14	0.18	0.14	0.1	0.1	0.11	0.13	0.01	0.31	1.0	0.11	0.15	0.38	0.16	0.24	0.14	0.06	0.04	0.1	0.1
Smo412614	0.1	0.1	0.11	0.11	0.11	0.09	0.14	0.15	0.13	0.19	0.14	0.13	0.11	0.17	0.39	0.14	0.06	0.07	0.08	0.16	0.2	0.32	0.07	0.08	0.03	1.0	0.13	0.14	0.05	0.05	0.08	0.08
Smo413023	0.1	0.14	0.24	0.52	0.68	0.59	0.39	0.37	0.2	0.12	0.15	0.12	1.0	0.22	0.76	0.93	0.14	0.49	0.18	0.43	0.49	0.03	0.35	0.41	0.95	0.3	0.42	0.41	0.1	0.16	0.06	0.09
Smo416326	0.08	0.02	0.02	0.03	0.1	0.12	0.08	0.13	0.12	0.18	0.11	0.08	0.04	0.07	0.08	0.07	0.14	0.13	0.23	0.58	0.32	0.62	0.06	0.08	1.0	0.28	0.28	0.37	0.19	0.24	0.15	0.11
Smo416368	0.22	0.31	0.35	0.45	0.38	0.47	0.41	0.32	0.26	0.21	0.24	0.21	0.3	0.52	0.5	0.33	0.17	0.09	0.23	0.33	0.39	0.54	0.19	0.17	1.0	0.36	0.59	0.51	0.12	0.11	0.09	0.11
Smo416917	0.09	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.07	0.0	0.0	0.64	1.0	0.0	0.0	0.02	0.34	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo417161	0.28	0.31	0.32	0.3	0.29	0.35	0.31	0.33	0.31	0.31	0.3	0.25	0.18	0.19	0.32	0.22	0.2	0.18	0.24	0.39	0.58	0.51	0.23	0.24	1.0	0.76	0.72	0.63	0.17	0.19	0.34	0.28
Smo418316	0.23	0.23	0.16	0.25	0.24	0.35	0.26	0.21	0.23	0.16	0.28	0.21	0.55	0.29	0.33	0.4	0.22	0.06	0.27	0.22	0.73	1.0	0.2	0.21	0.43	0.16	0.34	0.15	0.14	0.06	0.36	0.31
Smo419649	0.12	0.17	0.1	0.14	0.21	0.17	0.13	0.26	0.16	0.16	0.2	0.14	0.18	0.02	0.11	0.21	0.17	0.04	0.57	0.21	0.36	0.92	0.27	0.38	0.67	1.0	0.48	0.63	0.21	0.25	0.22	0.25
Smo420706	0.1	0.09	0.11	0.12	0.12	0.07	0.24	0.21	0.2	0.37	0.26	0.23	0.25	0.08	0.08	0.19	0.12	0.0	0.15	0.12	0.32	1.0	0.12	0.14	0.38	0.88	0.32	0.46	0.16	0.15	0.16	0.17
Smo421299	0.46	0.64	0.81	0.77	0.79	0.89	0.56	0.46	0.38	0.37	0.28	0.31	0.57	0.55	0.8	0.6	0.47	0.42	0.54	0.54	0.48	0.94	0.58	0.55	1.0	0.6	0.8	0.87	0.31	0.3	0.24	0.27
Smo426357	0.12	0.09	0.08	0.2	0.46	0.52	0.22	0.17	0.12	0.12	0.12	0.1	0.29	0.24	0.17	0.23	0.17	0.13	0.19	0.37	0.58	0.05	0.16	0.13	1.0	0.45	0.46	0.48	0.09	0.11	0.08	0.1
Smo428573	0.18	0.17	0.14	0.16	0.15	0.11	0.13	0.15	0.2	0.16	0.16	0.16	0.18	0.18	0.08	0.14	0.08	0.13	0.12	0.15	0.34	0.36	0.07	0.11	0.29	1.0	0.38	0.31	0.08	0.08	0.11	0.19
Smo429698	0.09	0.09	0.06	0.19	0.25	0.04	0.14	0.12	0.08	0.04	0.09	0.19	0.01	0.04	0.04	0.03	0.02	0.0	0.02	0.15	0.54	0.17	0.02	0.0	0.81	0.41	1.0	0.58	0.0	0.01	0.06	0.02
Smo430127	0.31	0.41	0.51	0.43	0.51	0.61	0.54	0.39	0.32	0.31	0.3	0.24	0.52	0.39	0.65	0.32	0.29	0.34	0.38	0.36	0.28	0.28	0.5	0.58	1.0	0.27	0.51	0.47	0.21	0.25	0.16	0.16
Smo430906	0.02	0.02	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.2	0.1	0.01	0.0	0.02	0.02	0.47	0.45	0.19	0.01	0.02	1.0	0.51	0.36	0.43	0.01	0.01	0.02	0.01
Smo431524	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.02	0.05	0.0	0.04	0.03	0.0	0.15	0.51	1.0	0.0	0.0	0.08	0.41	0.87	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo431526	0.26	0.28	0.34	0.33	0.29	0.34	0.35	0.34	0.3	0.3	0.28	0.31	0.17	0.27	0.33	0.18	0.1	0.05	0.15	0.36	0.78	0.25	0.14	0.17	1.0	0.62	0.36	0.43	0.11	0.13	0.13	0.14
Smo432613	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.0	0.03	0.26	0.27	0.08	0.02	0.01	0.03	0.23	0.4	0.26	0.02	0.03	0.8	0.82	0.95	1.0	0.04	0.03	0.02	0.01
Smo437993	0.36	0.27	0.31	0.28	0.37	0.33	0.31	0.35	0.39	0.33	0.4	0.33	0.38	0.3	0.27	0.45	0.29	0.21	0.48	1.0	0.58	0.97	0.32	0.37	0.5	0.83	0.55	0.57	0.31	0.34	0.4	0.41
Smo444197	0.28	0.22	0.2	0.24	0.3	0.22	0.26	0.29	0.34	0.35	0.35	0.33	0.44	0.2	0.18	0.41	0.23	0.17	0.62	0.69	0.72	0.92	0.3	0.54	0.56	1.0	0.81	0.58	0.24	0.26	0.4	0.64
Smo444629	0.14	0.12	0.11	0.11	0.11	0.09	0.11	0.14	0.18	0.2	0.23	0.2	0.36	0.06	0.03	0.28	0.13	0.09	0.29	0.33	0.5	0.13	0.25	0.26	1.0	0.81	0.12	0.1	0.17	0.16	0.32	0.44
Smo448972	0.08	0.08	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.14	0.18	0.12	0.15	0.33	0.13	0.13	0.25	0.1	0.15	0.18	0.1	0.7	0.67	0.16	0.19	1.0	0.83	0.5	0.25	0.14	0.17	0.17	0.26
Smo83520	0.22	0.15	0.15	0.18	0.19	0.17	0.17	0.22	0.21	0.24	0.31	0.2	0.2	0.08	0.2	0.25	0.14	0.17	0.29	0.25	0.5	0.61	0.22	0.29	0.63	1.0	0.58	0.54	0.18	0.17	0.2	0.26
Smo88718	0.66	0.6	0.5	0.63	0.59	0.72	0.58	0.71	0.64	0.71	0.67	0.57	0.45	0.4	0.61	0.57	0.64	0.28	0.62	0.51	0.86	0.67	0.52	0.58	0.93	0.92	1.0	0.99	0.57	0.58	0.79	0.7
Smo95630	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.18	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.1	0.07	0.17	0.08	0.06	0.02	0.13	0.0	0.54	0.41	0.08	0.05	1.0	0.85	0.98	0.86	0.11	0.09	0.01	0.03
Smo98368	0.52	0.36	0.31	0.32	0.27	0.34	0.28	0.31	0.38	0.41	0.48	0.5	0.31	0.33	0.35	0.35	0.25	0.27	0.53	0.39	0.66	0.64	0.3	0.33	1.0	0.94	0.58	0.49	0.31	0.31	0.78	0.76
Smo99727	0.21	0.28	0.3	0.4	0.53	0.58	0.57	0.54	0.39	0.28	0.26	0.24	0.3	0.19	0.57	0.34	0.24	0.12	0.36	0.36	0.4	0.97	0.27	0.27	1.0	0.52	0.59	0.48	0.22	0.26	0.19	0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)