1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_187 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.29 0.3 0.31 0.33 0.42 0.49 0.31 0.38 0.21 0.24 0.21 0.2 0.36 1.0 0.34 0.56 0.42 0.42 0.59 0.26 0.73 0.27 0.5 0.56 0.46 0.51 0.83 0.69 0.41 0.4 0.17 0.18
0.34 0.39 0.38 0.47 0.44 0.44 0.49 0.49 0.56 0.5 0.46 0.41 0.59 1.0 0.85 0.63 0.46 0.43 0.43 0.58 0.36 0.56 0.66 0.62 0.43 0.58 0.56 0.51 0.41 0.46 0.63 0.66
0.23 0.33 0.34 0.32 0.26 0.32 0.27 0.27 0.23 0.27 0.29 0.23 0.93 0.95 1.0 0.82 0.37 0.22 0.45 0.44 0.33 0.44 0.41 0.47 0.8 0.95 0.93 0.91 0.29 0.34 0.19 0.16
0.36 0.33 0.24 0.29 0.28 0.28 0.4 0.36 0.34 0.36 0.37 0.44 0.6 0.57 1.0 0.9 0.68 0.48 0.75 0.49 0.3 0.2 0.73 0.73 0.38 0.54 0.43 0.38 0.64 0.75 0.44 0.45
0.21 0.3 0.27 0.36 0.37 0.42 0.33 0.35 0.29 0.44 0.25 0.25 0.88 0.43 0.4 0.77 0.52 0.63 0.93 1.0 0.16 0.17 0.68 0.57 0.62 0.54 0.37 0.4 0.65 0.67 0.4 0.3
0.28 0.21 0.12 0.19 0.36 0.28 0.06 0.21 0.21 0.17 0.37 0.18 0.38 0.2 0.34 0.48 0.27 0.23 0.5 0.0 0.0 0.0 0.27 0.2 0.04 0.37 0.42 0.44 0.25 0.21 0.62 1.0
0.38 0.45 0.33 0.4 0.4 0.38 0.31 0.31 0.39 0.44 0.3 0.34 0.7 0.63 1.0 0.78 0.38 0.25 0.64 0.99 0.4 0.22 0.43 0.54 0.84 0.57 0.69 0.65 0.35 0.36 0.48 0.54
0.48 0.66 0.61 0.57 0.61 0.6 0.67 0.5 0.63 0.62 0.61 0.54 0.53 0.9 0.75 0.7 0.37 0.63 0.8 0.48 0.89 0.2 0.97 1.0 0.41 0.48 0.55 0.64 0.38 0.43 0.3 0.42
0.25 0.28 0.38 0.27 0.45 0.39 0.43 0.43 0.32 0.3 0.43 0.22 0.55 0.87 1.0 0.64 0.34 0.03 0.4 0.86 0.3 0.5 0.38 0.43 0.49 0.53 0.43 0.45 0.33 0.34 0.36 0.43
0.2 0.19 0.17 0.17 0.18 0.2 0.19 0.22 0.3 0.3 0.28 0.26 0.55 1.0 0.56 0.75 0.27 0.5 0.52 0.11 0.35 0.2 0.31 0.4 0.29 0.33 0.18 0.17 0.35 0.37 0.31 0.32
0.07 0.1 0.08 0.07 0.09 0.1 0.11 0.05 0.08 0.13 0.07 0.12 0.93 0.57 0.53 1.0 0.44 0.8 0.73 0.52 0.13 0.26 0.55 0.65 0.16 0.15 0.15 0.16 0.51 0.45 0.33 0.38
0.27 0.28 0.23 0.26 0.32 0.25 0.28 0.27 0.24 0.23 0.3 0.27 0.91 0.9 1.0 0.96 0.23 0.04 0.74 0.33 0.07 0.63 0.33 0.36 0.34 0.91 0.82 0.94 0.26 0.33 0.16 0.12
0.7 0.81 0.9 0.81 0.61 0.88 0.8 0.69 0.69 0.64 0.62 0.49 0.44 0.31 0.69 0.5 0.69 1.0 0.56 0.0 0.03 0.15 0.69 0.53 0.13 0.43 0.81 0.83 0.55 0.61 0.37 0.4
0.32 0.34 0.36 0.34 0.39 0.41 0.41 0.36 0.34 0.32 0.3 0.25 0.55 0.39 0.54 0.6 0.43 0.4 0.58 1.0 0.43 0.32 0.49 0.47 0.49 0.54 0.79 0.82 0.45 0.46 0.33 0.33
0.33 0.27 0.26 0.27 0.31 0.3 0.27 0.32 0.36 0.34 0.39 0.3 0.57 1.0 0.9 0.51 0.24 0.2 0.44 0.1 0.13 0.1 0.54 0.73 0.57 0.82 0.65 0.59 0.27 0.32 0.31 0.42
0.01 0.0 0.13 0.12 0.36 0.02 0.1 0.05 0.15 0.14 0.16 0.04 0.68 0.58 0.54 1.0 0.35 0.15 0.59 0.0 0.0 0.0 0.58 0.57 0.0 0.14 0.14 0.07 0.48 0.58 0.54 0.6
0.42 0.46 0.49 0.48 0.5 0.52 0.44 0.48 0.54 0.52 0.48 0.43 0.74 0.86 1.0 0.86 0.49 0.57 0.8 0.69 0.23 0.47 0.74 0.76 0.4 0.92 0.57 0.53 0.53 0.56 0.45 0.5
0.15 0.17 0.16 0.14 0.19 0.17 0.18 0.13 0.16 0.15 0.11 0.13 0.85 1.0 0.46 0.82 0.33 0.46 0.62 0.27 0.44 0.21 0.52 0.61 0.37 0.12 0.16 0.12 0.39 0.38 0.34 0.35
0.36 0.35 0.36 0.4 0.41 0.39 0.38 0.32 0.37 0.34 0.32 0.3 0.48 1.0 0.96 0.42 0.29 0.29 0.52 0.22 0.34 0.22 0.57 0.94 0.86 0.49 0.74 0.81 0.27 0.35 0.25 0.33
0.26 0.26 0.12 0.29 0.24 0.34 0.21 0.2 0.21 0.22 0.25 0.19 0.33 0.95 0.81 0.37 0.38 1.0 0.84 0.51 0.1 0.09 0.51 0.42 0.61 0.46 0.28 0.16 0.3 0.39 0.52 0.56
0.23 0.23 0.24 0.2 0.22 0.21 0.2 0.25 0.24 0.23 0.22 0.22 0.5 0.75 0.7 0.59 0.26 0.34 0.57 0.45 0.22 0.41 0.37 0.45 0.55 1.0 0.99 0.71 0.29 0.28 0.3 0.54
0.53 0.51 0.46 0.5 0.53 0.52 0.44 0.42 0.42 0.39 0.39 0.36 0.67 0.91 1.0 0.64 0.52 0.54 0.9 0.17 0.13 0.15 0.53 0.69 0.87 0.99 0.82 0.76 0.41 0.43 0.41 0.6
0.06 0.08 0.21 0.05 0.09 0.24 0.0 0.0 0.2 0.0 0.1 0.08 0.19 0.14 0.37 0.28 0.51 0.16 0.4 0.0 0.1 0.0 0.44 0.21 0.5 0.42 1.0 0.81 0.12 0.14 0.06 0.08
0.34 0.35 0.33 0.36 0.33 0.36 0.34 0.47 0.41 0.38 0.41 0.38 0.78 0.91 1.0 0.81 0.47 0.68 0.66 0.46 0.44 0.37 0.6 0.67 0.3 0.61 0.45 0.46 0.56 0.56 0.42 0.48
0.2 0.21 0.19 0.23 0.31 0.3 0.22 0.2 0.19 0.19 0.18 0.16 0.8 0.58 0.67 1.0 0.38 0.27 0.41 0.0 0.25 0.01 0.47 0.42 0.47 0.23 0.21 0.23 0.43 0.41 0.24 0.29
0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.57 0.89 0.06 0.29 0.03 0.13 0.11 0.01 0.02 0.0 0.24 1.0 0.08 0.04 0.03 0.02 0.09 0.13 0.08 0.11
0.36 0.35 0.56 0.39 0.49 0.46 0.48 0.32 0.28 0.3 0.32 0.22 0.73 0.47 0.88 0.87 0.7 1.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.78 0.79 0.01 0.43 0.94 0.93 0.71 0.74 0.69 0.66
0.47 0.47 0.37 0.42 0.59 0.58 0.46 0.51 0.34 0.33 0.32 0.28 0.51 0.46 0.78 0.61 0.47 0.62 0.68 0.36 0.05 0.3 0.49 0.6 0.41 0.56 0.94 0.68 0.41 0.38 0.81 1.0
0.27 0.27 0.26 0.31 0.32 0.33 0.29 0.33 0.33 0.27 0.33 0.26 0.46 1.0 0.95 0.93 0.24 0.29 0.54 0.7 0.31 0.53 0.33 0.39 0.65 0.68 0.57 0.44 0.33 0.37 0.24 0.27
0.23 0.16 0.41 0.32 0.31 0.07 0.17 0.17 0.22 0.17 0.34 0.17 0.77 0.4 0.64 0.7 0.37 0.34 1.0 0.05 0.0 0.08 0.53 0.66 0.7 0.2 0.79 0.94 0.59 0.44 0.28 0.26
0.24 0.09 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.16 0.14 0.0 0.05 0.04 0.85 0.05 0.0 0.29 0.21 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.57 0.6 1.0 0.46 0.76 0.28 0.35 0.1 0.2 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.41 0.67 0.56 0.23 0.08 0.3 0.74 0.0 0.41 0.19 0.18 1.0 0.5 0.24 0.09 0.12 0.17 0.08 0.1
0.39 0.4 0.53 0.47 0.46 0.53 0.48 0.52 0.47 0.36 0.38 0.37 0.59 0.53 0.9 0.74 0.7 0.55 0.91 0.19 0.06 0.14 0.79 0.82 0.14 0.53 0.9 1.0 0.68 0.73 0.55 0.47
0.15 0.17 0.23 0.12 0.05 0.33 0.26 0.29 0.26 0.28 0.27 0.2 0.96 0.56 0.53 0.27 0.2 0.76 0.19 0.3 0.84 0.06 0.18 0.17 1.0 0.49 0.75 0.56 0.25 0.28 0.16 0.15
0.23 0.26 0.39 0.39 0.41 0.37 0.33 0.31 0.24 0.25 0.35 0.26 0.96 0.84 0.97 0.79 0.35 0.09 1.0 0.27 0.08 0.2 0.55 0.48 0.14 0.75 0.84 0.85 0.31 0.36 0.27 0.24
0.13 0.19 0.07 0.11 0.09 0.09 0.1 0.14 0.07 0.1 0.13 0.12 0.58 0.73 0.75 0.97 0.3 0.87 0.79 0.57 0.03 0.17 0.42 0.44 0.16 1.0 0.84 0.47 0.48 0.4 0.42 0.46
0.36 0.33 0.32 0.34 0.36 0.36 0.39 0.37 0.43 0.37 0.36 0.35 0.56 0.98 0.83 0.83 0.55 0.75 0.81 0.06 0.22 0.15 0.61 0.63 0.3 0.79 1.0 0.89 0.66 0.78 0.67 0.97
0.21 0.2 0.32 0.12 0.33 0.32 0.25 0.38 0.33 0.19 0.37 0.12 0.42 0.6 0.55 0.55 0.16 0.0 0.34 0.27 0.56 0.09 0.72 1.0 0.2 0.12 0.06 0.07 0.21 0.3 0.18 0.21
0.13 0.11 0.13 0.18 0.18 0.24 0.25 0.31 0.24 0.21 0.16 0.17 1.0 0.16 0.43 0.48 0.11 0.12 0.18 0.37 0.36 0.43 0.16 0.18 0.85 0.27 0.41 0.32 0.14 0.16 0.1 0.12
0.48 0.48 0.46 0.57 0.54 0.55 0.68 0.62 0.68 0.58 0.49 0.47 0.53 0.68 0.87 0.58 0.53 0.7 0.65 0.67 0.53 0.88 0.48 0.5 0.39 0.42 1.0 0.85 0.56 0.57 0.44 0.46
0.06 0.04 0.06 0.11 0.11 0.1 0.07 0.11 0.1 0.05 0.06 0.09 0.61 0.6 0.93 0.66 0.33 0.45 0.56 0.12 0.49 0.04 0.45 0.4 0.24 0.92 1.0 0.91 0.46 0.47 0.53 0.71
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.76 0.42 0.34 0.66 0.43 0.23 0.82 0.0 0.14 0.0 0.72 1.0 0.14 0.03 0.15 0.37 0.46 0.58 0.54 0.56
0.28 0.41 0.28 0.36 0.37 0.4 0.43 0.38 0.33 0.28 0.33 0.26 0.33 0.32 0.62 0.62 0.42 0.23 0.7 0.0 0.01 0.0 0.51 0.61 0.32 0.44 0.85 1.0 0.45 0.46 0.16 0.11
0.16 0.14 0.11 0.1 0.1 0.09 0.1 0.1 0.12 0.16 0.14 0.13 0.8 1.0 0.51 0.53 0.29 0.49 0.12 0.17 0.06 0.13 0.73 0.88 0.14 0.1 0.17 0.11 0.38 0.41 0.9 0.75
0.51 0.49 0.44 0.6 0.55 0.63 0.61 0.59 0.56 0.54 0.53 0.5 0.69 0.71 1.0 0.8 0.6 0.57 0.79 0.76 0.28 0.27 0.63 0.67 0.98 0.55 0.58 0.59 0.64 0.6 0.55 0.55
0.24 0.31 0.31 0.3 0.34 0.35 0.33 0.35 0.29 0.28 0.26 0.25 1.0 0.39 0.65 0.77 0.18 0.17 0.38 0.46 0.13 0.28 0.27 0.35 0.64 0.4 0.42 0.46 0.21 0.23 0.17 0.19
0.32 0.31 0.35 0.43 0.52 0.67 0.76 0.62 0.64 0.62 0.53 0.44 0.38 1.0 0.65 0.79 0.5 0.59 0.65 0.08 0.97 0.46 0.81 0.9 0.27 0.54 0.97 0.97 0.49 0.53 0.49 0.52
0.21 0.23 0.16 0.21 0.16 0.18 0.17 0.19 0.2 0.24 0.23 0.26 0.8 1.0 0.46 0.71 0.2 0.52 0.5 0.47 0.31 0.4 0.44 0.6 0.15 0.22 0.15 0.11 0.3 0.31 0.4 0.5
0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.85 1.0 0.95 0.8 0.55 0.32 0.75 0.14 0.13 0.11 0.73 0.75 0.2 0.47 0.41 0.35 0.58 0.57 0.67 0.77
0.31 0.36 0.35 0.4 0.42 0.42 0.4 0.43 0.39 0.37 0.34 0.3 0.68 0.52 0.77 0.73 0.37 0.31 0.72 0.68 0.46 0.49 0.55 0.63 1.0 0.61 0.6 0.58 0.43 0.45 0.38 0.45
0.45 0.55 0.45 0.29 0.22 0.41 0.48 0.35 0.18 0.27 0.12 0.27 0.82 0.17 0.61 0.9 0.49 0.68 1.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.52 0.27 0.69 0.6 0.93 0.65 0.62 0.53 0.28
0.31 0.37 0.48 0.55 0.39 0.54 0.55 0.45 0.57 0.4 0.43 0.25 0.42 0.78 0.99 0.52 0.4 0.52 0.7 0.51 0.13 0.64 0.39 0.43 0.48 0.69 0.79 1.0 0.29 0.39 0.28 0.33
0.45 0.45 0.44 0.37 0.5 0.4 0.33 0.3 0.28 0.28 0.26 0.29 0.68 0.78 0.82 0.73 0.5 0.7 0.81 0.07 0.49 0.22 0.58 0.6 0.94 0.66 1.0 0.85 0.47 0.48 0.51 0.55
0.04 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0 0.08 0.05 0.04 0.05 0.0 0.0 0.3 0.44 0.29 0.28 0.1 0.64 0.41 0.0 0.39 0.0 0.24 0.21 1.0 0.35 0.32 0.91 0.26 0.07 0.16 0.11
0.34 0.31 0.26 0.32 0.37 0.4 0.21 0.21 0.36 0.38 0.35 0.37 0.52 0.63 0.74 0.81 0.35 0.53 0.63 0.15 0.6 0.04 0.42 0.49 0.5 1.0 0.66 0.43 0.45 0.45 0.27 0.41
0.44 0.68 0.63 0.57 0.5 0.58 0.53 0.46 0.48 0.34 0.34 0.41 0.6 0.41 0.78 0.58 0.57 1.0 0.55 0.1 0.0 0.0 0.64 0.5 0.02 0.39 0.74 0.79 0.49 0.39 0.48 0.5
0.34 0.46 0.38 0.49 0.5 0.54 0.55 0.6 0.5 0.49 0.39 0.39 0.69 0.36 0.73 0.84 0.43 0.2 0.64 0.3 0.51 0.63 0.48 0.55 1.0 0.46 0.45 0.46 0.38 0.41 0.29 0.28
0.37 0.34 0.32 0.33 0.32 0.38 0.36 0.36 0.42 0.42 0.42 0.42 0.7 1.0 0.6 0.7 0.41 0.59 0.57 0.28 0.5 0.35 0.56 0.6 0.5 0.27 0.16 0.14 0.49 0.47 0.39 0.48
0.39 0.41 0.4 0.4 0.4 0.47 0.42 0.41 0.4 0.42 0.42 0.38 1.0 0.87 0.81 0.8 0.51 0.61 0.71 0.13 0.44 0.26 0.62 0.68 0.41 0.22 0.27 0.21 0.54 0.56 0.47 0.52
0.24 0.42 0.39 0.41 0.47 0.42 0.51 0.35 0.26 0.25 0.22 0.18 0.36 0.44 1.0 0.54 0.42 0.35 0.73 0.59 0.02 0.42 0.24 0.23 0.76 0.2 0.3 0.18 0.3 0.34 0.16 0.14
0.27 0.26 0.2 0.18 0.21 0.22 0.18 0.23 0.29 0.26 0.25 0.29 0.83 0.89 0.85 0.83 0.29 0.29 0.56 0.58 0.38 0.04 0.5 0.52 0.77 1.0 0.64 0.56 0.46 0.41 0.3 0.32
0.42 0.39 0.4 0.4 0.45 0.37 0.31 0.39 0.4 0.37 0.38 0.32 0.62 0.68 1.0 0.73 0.32 0.21 0.49 0.47 0.3 0.04 0.44 0.53 0.84 0.56 0.46 0.41 0.34 0.39 0.3 0.3
0.81 0.86 0.82 0.78 0.72 0.87 0.75 0.61 0.65 0.61 0.59 0.6 0.63 0.53 1.0 0.63 0.67 1.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.49 0.53 0.0 0.42 0.58 0.61 0.65 0.66 0.65 0.71
0.3 0.3 0.26 0.26 0.34 0.29 0.36 0.3 0.33 0.33 0.39 0.35 0.56 0.41 0.74 0.85 0.51 0.86 0.74 0.42 0.0 0.02 0.49 0.52 0.1 0.78 1.0 0.96 0.73 0.66 0.84 0.95
0.31 0.35 0.36 0.38 0.45 0.4 0.38 0.34 0.42 0.36 0.39 0.31 0.77 0.85 1.0 0.91 0.46 0.51 0.7 0.41 0.55 0.21 0.52 0.68 0.61 0.46 0.34 0.32 0.46 0.57 0.4 0.53
0.47 0.46 0.51 0.57 0.54 0.65 0.51 0.65 0.62 0.56 0.46 0.49 0.76 0.89 0.85 0.89 0.6 0.75 0.93 0.56 0.9 0.42 0.7 0.66 0.64 0.82 1.0 0.95 0.6 0.65 0.5 0.53
0.3 0.32 0.27 0.34 0.33 0.38 0.41 0.46 0.43 0.36 0.41 0.32 0.59 0.35 0.34 0.96 0.66 1.0 0.93 0.45 0.24 0.18 0.68 0.65 0.56 0.51 0.27 0.23 0.8 0.83 0.49 0.36
0.2 0.19 0.22 0.29 0.37 0.34 0.32 0.37 0.36 0.31 0.28 0.22 0.43 0.17 0.58 0.48 0.32 0.41 0.48 0.36 0.03 0.22 0.5 0.49 0.49 0.42 1.0 0.99 0.32 0.41 0.58 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)