1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_72 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
8.54 7.73 12.57 12.43 12.36 15.35 18.16 12.08 18.03 13.69 13.72 8.27 33.47 46.84 14.46 12.59 5.84 4.0 0.71 0.29 3.75 0.0 5.7 5.03 3.52 2.13 3.47 4.12 3.2 3.85 11.72 11.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.3 0.07 0.21 0.03 0.06 0.14 0.19 0.03 0.07 0.26 0.19 0.0 1.87 0.84 0.0 0.06 0.22 0.0 0.0 0.0 0.5 0.06 0.12 0.0 0.06 0.07 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0
2.38 1.8 0.67 1.04 1.32 0.28 2.32 0.99 0.37 2.41 1.78 0.79 7.3 39.68 15.76 3.75 0.76 7.29 2.08 0.32 0.0 0.22 0.6 2.57 0.91 0.75 0.42 0.0 1.07 1.13 0.1 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
4.72 11.8 2.28 3.46 11.5 7.4 10.26 10.72 9.33 10.2 7.39 6.27 130.54 716.25 231.81 306.68 3.77 385.84 105.13 2.92 18.57 52.79 6.38 33.03 9.72 31.73 119.02 25.32 99.08 238.87 160.47 185.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
442.74 402.34 460.26 503.32 470.01 495.6 522.28 555.46 537.23 563.51 508.13 531.85 736.2 1240.23 854.54 446.96 411.66 360.96 378.31 312.41 528.84 337.99 525.21 562.55 309.15 388.25 236.36 216.06 415.05 416.11 353.25 405.06
0.37 0.16 2.34 0.44 0.52 0.56 0.34 1.0 0.25 0.29 0.28 0.22 0.95 4.19 10.74 1.43 0.61 0.72 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.7 0.0 0.45 0.35 0.63 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.13 0.03 0.0 0.05 0.58 0.22 0.17 0.11 0.04 0.08 0.09 0.55 6.5 0.34 0.55 0.0 0.53 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.57 1.09 0.0 0.18 0.46 0.59 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.26 1.56 1.72 2.59 3.3 1.23 1.56 1.92 2.35 2.67 3.21 2.72 14.75 21.89 14.76 16.22 0.12 0.03 3.82 0.05 0.0 0.0 0.19 0.32 0.42 1.57 1.85 1.87 0.6 1.12 0.26 0.41
7.39 6.89 9.02 13.56 22.25 13.97 18.8 13.45 12.25 13.9 15.51 11.48 51.36 154.92 165.06 81.04 3.48 0.16 6.52 0.0 0.0 0.0 1.71 31.99 14.68 8.36 17.32 23.69 3.67 23.27 2.84 4.87
1.71 2.54 3.44 5.3 12.87 7.94 7.97 6.37 6.43 3.27 3.97 2.9 36.62 486.82 360.76 64.31 3.96 1.24 4.69 0.0 0.0 0.0 1.34 26.57 1.64 3.2 16.29 16.45 3.3 22.35 2.83 4.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.05 3.04 3.65 7.03 4.67 3.85 6.19 2.68 4.34 5.11 5.21 5.75 27.71 50.82 52.26 40.78 11.92 53.1 19.6 0.0 0.5 0.0 0.97 5.41 51.46 8.42 2.31 6.75 10.18 8.58 4.06 5.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 10.17 21.35 0.0 0.0 1.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.41 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.15 0.14 0.73 5.68 8.04 11.48 1.98 1.12 0.77 0.18 0.13 1.0 96.84 98.31 4.75 2.59 26.11 11.97 14.94 11.02 8.23 2.22 1.06 4.48 1.3 37.97 7.86 6.7 9.28 15.93 23.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
1.07 0.89 1.23 1.17 1.94 1.11 0.97 0.73 2.54 0.73 1.21 1.59 3.34 10.86 4.4 4.67 1.21 0.73 0.5 1.1 0.65 0.0 4.44 2.25 0.36 1.21 2.99 3.15 0.78 1.37 1.05 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.64 1.62 0.83 0.54 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.55 4.56 12.17 4.35 8.04 2.64 0.42 2.2 2.02 3.03 3.47 2.85 0.14 44.04 36.99 4.3 1.46 0.77 1.69 2.51 0.0 26.71 1.47 1.67 5.06 1.26 4.0 3.5 2.35 4.11 2.38 10.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.35 0.0 0.06 0.06 0.06 0.12
0.27 0.11 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.24 0.13 0.0 0.19 0.11 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.21 0.11 0.22 0.0 0.0
0.0 0.03 0.05 0.06 0.0 0.06 0.06 0.13 0.0 0.11 0.35 0.06 0.07 0.04 0.38 0.04 0.03 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.53 0.67 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.3 0.06 0.07 0.2 0.16 0.15 0.0 0.08 0.07 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.63 3.73 2.85 8.33 14.06 8.67 6.17 6.49 5.57 6.13 8.81 5.98 14.21 62.24 67.65 24.76 22.61 99.89 4.23 0.0 0.0 0.0 0.76 9.65 3.98 4.83 6.35 12.92 14.99 26.88 9.43 12.99
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.73 0.59 0.74 1.2 0.84 0.71 0.45 0.73 0.53 0.98 0.64 1.32 6.79 10.41 2.35 0.41 0.73 0.94 0.0 0.0 0.0 1.91 3.69 0.26 0.69 2.21 0.62 0.67 1.07 1.64 2.41
1.12 0.8 0.64 1.15 1.29 1.5 0.9 1.09 0.8 1.18 0.86 1.04 0.09 2.83 3.22 0.35 0.76 0.35 0.65 1.11 0.58 1.97 0.24 0.2 0.57 0.31 1.05 1.15 0.54 0.49 0.37 0.4
4.22 4.61 6.66 6.47 4.89 5.34 5.74 3.57 5.33 4.88 5.44 4.42 3.74 48.52 79.37 5.0 0.99 1.08 5.32 19.49 0.8 7.35 0.67 4.83 0.46 3.79 12.71 2.73 1.24 5.3 2.38 2.23
2.79 2.78 0.25 0.92 1.87 1.44 4.51 3.32 2.15 0.78 2.61 1.36 2.82 51.24 16.11 3.92 3.41 13.86 9.97 0.58 0.0 8.83 1.22 4.09 0.41 0.43 0.0 1.06 1.85 3.09 0.49 0.17
4.99 5.77 3.92 3.19 1.48 3.7 5.46 3.27 3.96 3.26 6.01 3.1 4.86 37.29 27.56 6.12 6.97 5.5 4.69 1.25 1.83 12.65 0.97 3.47 1.39 4.26 1.53 2.16 1.6 2.25 0.82 0.62

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)