1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_220 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00002p00218040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.231)
 0.85 0.48 0.65 0.75 0.53 0.64 0.42 0.21 0.39 0.47 0.28 0.58 0.56 0.5 1.0 0.08 0.14 0.27 0.2 0.48 0.05 0.57
AMTR_s00002p00268550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.538)
 0.52 0.37 0.23 0.09 1.0 0.59 0.57 0.26 0.56 0.52 0.25 0.38 0.46 0.48 0.93 0.33 0.54 0.27 0.19 0.42 0.21 0.32
AMTR_s00003p00241460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.258)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.53 0.69 0.42 0.0 0.23 0.27 0.27 0.14 0.15 0.15 0.52 0.07 0.01 0.15 0.19 0.21 0.03 0.16
AMTR_s00003p00261780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.348)
 0.58 0.87 0.93 0.4 1.0 0.46 0.48 0.16 0.47 0.47 0.56 0.57 0.51 0.65 0.69 0.76 0.43 0.81 0.66 0.67 0.45 0.36
AMTR_s00004p00018810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.5)
 0.18 0.56 0.86 0.43 0.34 1.0 0.49 0.2 0.45 0.57 0.42 0.54 0.78 0.46 0.66 0.35 0.5 0.42 0.38 0.66 0.17 0.65
AMTR_s00004p00151230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.158)
 0.79 0.69 1.0 0.37 0.8 0.61 0.33 0.25 0.35 0.34 0.62 0.59 0.65 0.66 0.44 0.22 0.36 0.38 0.41 0.41 0.22 0.58
AMTR_s00007p00095830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.54)
 0.72 0.52 1.0 0.26 0.68 0.99 0.65 0.3 0.82 0.83 0.22 0.42 0.7 0.8 0.97 0.17 0.2 0.14 0.18 0.78 0.05 0.96
AMTR_s00009p00222480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.166)
 0.75 0.54 1.0 0.09 0.51 0.9 0.21 0.23 0.21 0.23 0.59 0.88 0.72 0.66 0.69 0.42 0.42 0.42 0.45 0.8 0.14 0.61
AMTR_s00013p00144020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.71)
 0.48 0.82 0.24 0.2 0.35 0.82 0.59 0.12 0.43 0.48 0.62 0.57 0.39 0.45 0.51 1.0 0.27 0.26 0.42 0.47 0.4 0.35
AMTR_s00016p00150480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.107)
 0.86 0.26 0.33 0.15 1.0 0.39 0.65 0.23 0.45 0.52 0.25 0.37 0.36 0.48 0.78 0.3 0.4 0.18 0.16 0.22 0.12 0.32
AMTR_s00016p00237360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.242)
 0.38 0.63 0.0 0.02 0.37 0.65 1.0 0.01 0.47 0.47 0.56 0.48 0.3 0.37 0.33 0.35 0.55 0.38 0.24 0.2 0.33 0.22
AMTR_s00021p00189630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.150)
 1.0 0.5 0.38 0.12 0.86 0.27 0.8 0.05 0.6 0.48 0.25 0.45 0.4 0.41 0.7 0.11 0.46 0.15 0.18 0.23 0.08 0.47
AMTR_s00021p00218440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.201)
 0.97 0.66 1.0 0.44 0.55 0.73 0.45 0.32 0.25 0.34 0.47 0.44 0.51 0.43 0.58 0.36 0.32 0.28 0.43 0.61 0.19 0.45
AMTR_s00022p00110010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.97)
 0.13 0.05 0.11 0.06 0.37 0.6 0.32 0.14 0.29 0.31 0.28 0.21 0.35 0.45 1.0 0.16 0.15 0.19 0.22 0.27 0.13 0.28
AMTR_s00022p00232100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.314)
 0.0 0.0 0.59 0.06 0.51 0.36 0.16 0.3 0.22 0.23 0.23 0.12 0.4 0.98 1.0 0.05 0.09 0.19 0.27 0.5 0.16 0.12
AMTR_s00023p00243610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.214)
 0.7 0.16 0.19 0.17 1.0 0.85 0.94 0.4 0.46 0.4 0.42 0.38 0.42 0.37 0.48 0.33 0.18 0.18 0.25 0.21 0.14 0.16
AMTR_s00025p00235380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.346)
 0.71 0.55 0.75 0.0 1.0 0.47 0.68 0.13 0.6 0.72 0.36 0.38 0.47 0.58 0.51 0.56 0.53 0.32 0.32 0.65 0.32 0.31
AMTR_s00037p00182150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.88)
 0.0 0.0 0.0 0.09 0.85 0.99 0.66 0.0 0.96 1.0 0.0 0.39 0.2 0.23 0.58 0.0 0.09 0.34 0.0 0.33 0.0 0.15
AMTR_s00038p00171980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.111)
 0.38 1.0 0.73 0.34 0.61 0.24 0.29 0.2 0.26 0.26 0.5 0.42 0.62 0.49 0.49 0.39 0.53 0.21 0.26 0.26 0.16 0.52
0.0 1.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.4 0.03 0.16 0.24 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
AMTR_s00048p00164960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.118)
 0.44 0.46 0.64 0.05 0.69 0.48 0.53 0.49 1.0 0.52 0.55 0.4 0.42 0.56 0.64 0.24 0.49 0.3 0.25 0.21 0.19 0.18
AMTR_s00049p00111320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.87)
 0.37 0.0 0.0 0.0 0.77 0.86 0.61 0.08 0.84 1.0 0.39 0.54 0.28 0.46 0.43 0.36 0.5 0.42 0.36 0.35 0.32 0.31
AMTR_s00056p00139340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.110)
 0.0 0.57 0.17 0.09 0.24 1.0 1.0 0.48 0.71 0.73 0.57 0.85 0.3 0.46 0.25 0.3 0.52 0.35 0.24 0.2 0.17 0.2
AMTR_s00057p00035800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.16)
 1.0 0.59 0.75 0.33 0.93 0.81 0.8 0.28 0.55 0.56 0.53 0.55 0.68 0.68 0.77 0.41 0.44 0.45 0.33 0.42 0.23 0.58
AMTR_s00060p00057310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.17)
 0.66 1.0 0.68 0.87 0.67 0.63 0.2 0.18 0.48 0.43 0.15 0.38 0.32 0.25 0.25 0.17 0.28 0.1 0.13 0.25 0.24 0.34
AMTR_s00060p00208570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.151)
 0.99 0.64 1.0 0.25 0.6 0.82 0.24 0.13 0.23 0.24 0.64 0.62 0.58 0.54 0.61 0.73 0.5 0.56 0.54 0.45 0.25 0.55
AMTR_s00061p00134950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.112)
 0.08 0.14 0.15 0.01 0.92 0.96 1.0 0.14 0.5 0.56 0.52 0.34 0.48 0.55 0.68 0.37 0.3 0.35 0.46 0.29 0.15 0.15
AMTR_s00061p00163190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.157)
 1.0 0.49 0.39 0.06 0.54 0.87 0.46 0.14 0.42 0.49 0.42 0.32 0.47 0.4 0.39 0.96 0.62 0.46 0.37 0.73 0.58 0.19
AMTR_s00062p00026590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.11)
 0.46 0.42 1.0 0.45 0.48 0.28 0.4 0.17 0.24 0.3 0.24 0.36 0.23 0.2 0.12 0.41 0.18 0.16 0.18 0.06 0.08 0.11
AMTR_s00062p00158840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.148)
 0.39 1.0 0.39 0.83 0.83 0.28 0.83 0.03 0.47 0.49 0.67 0.65 0.71 0.5 0.33 0.41 0.52 0.59 0.67 0.35 0.16 0.72
AMTR_s00065p00182000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.155)
 1.0 0.68 0.75 0.17 0.33 0.64 0.28 0.2 0.21 0.26 0.22 0.16 0.27 0.36 0.66 0.18 0.12 0.1 0.13 0.2 0.1 0.22
AMTR_s00066p00105400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.90)
 0.54 0.71 1.0 0.23 0.92 0.16 0.5 0.12 0.32 0.35 0.36 0.46 0.34 0.35 0.3 0.53 0.2 0.44 0.42 0.22 0.13 0.2
AMTR_s00069p00123730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.82)
 0.32 0.27 0.23 0.2 0.4 0.34 0.18 0.12 0.48 0.38 0.25 0.25 0.48 0.49 1.0 0.24 0.25 0.19 0.17 0.46 0.14 0.43
AMTR_s00074p00114650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.34)
 0.24 0.0 0.3 0.54 1.0 0.86 0.9 0.2 0.78 0.82 0.6 0.59 0.56 0.68 0.55 0.49 0.45 0.25 0.38 0.47 0.15 0.58
AMTR_s00080p00161640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.81)
 0.78 0.88 0.73 0.2 1.0 0.92 0.93 0.12 0.58 0.74 0.62 0.66 0.54 0.53 0.79 0.48 0.52 0.39 0.38 0.45 0.32 0.4
AMTR_s00089p00097770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.53)
 0.49 0.78 0.26 0.06 1.0 0.0 0.52 0.13 0.36 0.44 0.26 0.29 0.1 0.26 0.4 0.01 0.22 0.09 0.21 0.17 0.15 0.02
AMTR_s00100p00159440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.65)
 0.93 0.0 1.0 0.0 0.53 0.68 0.36 0.0 0.33 0.32 0.33 0.82 0.35 0.62 0.34 0.11 0.21 0.41 0.88 0.46 0.86 0.53
AMTR_s00103p00025680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.7)
 0.4 0.21 1.0 0.14 0.19 0.37 0.38 0.02 0.37 0.34 0.3 0.46 0.34 0.42 0.22 0.09 0.43 0.31 0.43 0.52 0.23 0.13
AMTR_s00106p00052530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.30)
 0.97 0.53 0.48 0.07 0.74 0.63 0.6 0.25 0.38 0.41 0.38 0.64 0.62 0.49 0.46 1.0 0.27 0.45 0.72 0.51 0.28 0.54
AMTR_s00106p00124640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.96)
 0.21 0.2 0.36 0.01 0.12 0.64 1.0 0.3 0.49 0.52 0.46 0.37 0.34 0.37 0.27 0.26 0.48 0.28 0.25 0.26 0.2 0.27
AMTR_s00108p00141550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00108.42)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 1.0 0.91 0.45 0.44 0.61 0.45 0.0 0.36 0.21 0.23 0.05 0.29 0.18 0.17 0.18 0.0 0.16
AMTR_s00111p00064560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.32)
 0.68 0.91 0.14 0.02 0.64 0.44 1.0 0.29 0.7 0.7 0.41 0.55 0.34 0.47 0.27 0.21 0.27 0.5 0.4 0.24 0.23 0.25
AMTR_s00116p00090490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00116.16)
 1.0 0.45 0.54 0.92 0.62 0.47 0.65 0.16 0.39 0.5 0.41 0.42 0.46 0.47 0.51 0.54 0.31 0.38 0.4 0.43 0.25 0.39
AMTR_s00116p00111830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00116.26)
 0.23 0.28 0.62 0.48 1.0 0.03 0.25 0.0 0.37 0.36 0.51 0.76 0.48 0.56 0.65 0.77 0.34 1.0 0.96 0.71 0.78 0.58
AMTR_s00126p00070000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00126.29)
 0.29 0.29 0.11 0.02 0.43 0.83 1.0 0.15 0.39 0.38 0.28 0.27 0.31 0.32 0.17 0.25 0.73 0.36 0.35 0.25 0.22 0.19
AMTR_s00128p00107690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00128.37)
 1.0 0.0 0.07 0.0 0.46 0.0 0.63 0.0 0.1 0.08 0.0 0.09 0.01 0.13 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.0 0.02
AMTR_s00140p00036490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.9)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.96 0.28 0.0 0.68 0.83 0.27 1.0 0.2 0.29 0.08 0.0 0.38 0.16 0.07 0.01 0.0 0.45
AMTR_s00154p00057990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00154.36)
 0.19 0.35 0.29 0.01 0.56 1.0 0.32 0.0 0.29 0.36 0.21 0.24 0.65 0.39 0.99 0.51 0.15 0.29 0.46 0.52 0.17 0.41
AMTR_s00155p00071520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00155.46)
 0.79 0.25 0.73 0.02 0.64 0.41 0.54 0.14 0.32 0.4 0.17 0.17 0.78 0.5 0.32 0.4 0.55 0.32 0.32 1.0 0.32 0.52
AMTR_s00156p00055010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.27)
 0.86 0.99 0.85 0.07 1.0 0.0 0.77 0.03 0.41 0.63 0.21 0.37 0.21 0.21 0.23 0.08 0.1 0.14 0.24 0.08 0.04 0.0
AMTR_s00156p00089110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.44)
 0.91 0.87 0.88 0.32 1.0 0.7 0.78 0.25 0.7 0.65 0.43 0.41 0.43 0.55 0.62 0.29 0.49 0.32 0.22 0.1 0.12 0.46
AMTR_s00165p00060220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00165.39)
 0.33 0.42 0.56 0.02 1.0 0.95 0.47 0.32 0.89 0.62 0.24 0.21 0.59 0.63 0.88 0.2 0.2 0.14 0.21 0.4 0.16 0.36
AMTR_s00167p00018590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00167.3)
 1.0 0.9 0.71 0.63 0.95 0.72 0.31 0.45 0.21 0.27 0.22 0.17 0.45 0.34 0.56 0.24 0.24 0.18 0.2 0.51 0.1 0.55
AMTR_s00168p00036950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00168.10)
 0.54 0.84 0.59 0.18 1.0 0.0 0.85 0.15 0.88 0.86 0.24 0.6 0.47 0.53 0.62 0.1 0.51 0.16 0.17 0.17 0.09 0.42
AMTR_s00197p00035890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00197.14)
 0.57 0.4 0.75 0.45 0.86 1.0 0.41 0.0 0.24 0.28 0.26 0.28 0.35 0.17 0.27 0.1 0.42 0.05 0.02 0.17 0.03 0.52
AMTR_s05591p00003960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold05591.1)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.84 0.24 0.37 0.51 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)