Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.38 0.13 0.26 0.27 0.07 -0.11 0.29 0.43 0.02 0.11 -0.04 -0.25 0.23 0.33 0.74 0.22 0.02 0.11 -0.19 0.03 -2.79 -0.25 -1.26 -1.18 -0.31 -0.25
0.41 0.12 0.27 0.11 0.02 0.22 0.38 0.39 0.13 -0.03 -0.3 -0.63 0.08 0.8 0.79 0.47 0.11 0.17 0.21 0.28 -5.68 -1.96 -1.65 -1.72 -0.18 -0.5
-0.73 -0.65 -0.61 -0.45 -0.12 0.01 -0.14 -0.36 -0.35 -0.2 -0.42 -0.75 -0.58 0.69 0.78 0.41 0.04 0.35 0.64 -0.16 -1.88 -0.52 0.14 0.16 1.06 0.5
-0.99 -0.74 -0.55 -0.31 -0.03 0.05 0.12 0.02 0.27 0.06 -0.06 0.04 -0.87 0.47 0.36 0.74 0.36 0.57 0.09 0.3 -0.41 -1.14 -0.24 -0.04 0.02 0.09
0.02 0.14 0.12 0.15 0.1 0.38 0.24 0.09 -0.01 -0.11 -0.17 -0.39 0.03 -0.11 -0.04 0.2 0.67 0.43 0.42 -0.03 -2.09 -0.52 -0.78 -0.61 0.07 -0.06
0.2 0.17 0.1 0.2 0.18 -0.15 -0.01 -0.29 -0.15 -0.12 -0.32 -0.45 -0.0 0.49 0.07 0.61 -0.39 0.16 0.09 -0.5 -2.14 0.58 -0.4 -0.37 0.38 0.15
-0.78 -0.87 -1.12 -0.59 -0.08 0.1 0.12 -0.1 -0.16 -0.05 -0.16 -0.27 -0.7 0.87 0.07 0.87 0.0 0.43 0.39 0.23 -0.76 -0.18 -0.29 0.1 0.25 0.5
-0.38 -0.42 -0.43 -0.14 0.32 0.55 0.4 0.16 0.25 0.43 0.17 0.03 -0.35 0.39 0.27 0.09 0.12 0.52 0.22 -0.02 -2.17 -1.6 -0.08 -0.79 -0.2 0.03
-0.16 -0.23 -0.04 0.1 0.2 0.25 0.17 0.14 0.09 0.2 0.21 0.2 -0.12 0.43 0.22 0.39 -0.0 0.35 0.11 0.06 -3.15 -0.57 -0.75 -0.44 -0.3 0.08
0.11 0.14 0.28 0.2 0.06 -0.01 0.27 0.32 0.12 0.16 -0.05 -0.24 -0.01 0.58 0.29 0.21 -0.09 0.33 -0.08 0.29 -2.92 -0.86 -1.61 -1.12 0.14 0.2
0.02 0.67 0.78 0.59 -0.3 -0.99 -0.44 -0.11 -0.47 -0.57 -0.46 -0.48 -0.07 0.95 0.12 0.67 -0.17 0.28 -0.15 -0.13 -4.45 -0.84 -1.07 -1.15 0.81 0.66
-0.16 -0.35 -0.21 -0.31 -0.24 -0.37 0.23 0.19 0.24 0.15 -0.15 -0.18 -0.05 0.42 0.78 0.39 -0.03 0.59 -0.0 -0.05 -1.86 -0.08 -0.23 -0.93 0.39 -0.07
0.49 -0.02 -0.24 -0.08 0.58 0.29 0.42 0.15 0.15 -0.24 -0.43 -0.39 0.02 0.45 0.09 0.53 -0.36 0.47 0.27 -0.16 -4.03 -1.52 0.08 -0.21 -0.08 -0.39
-1.11 -1.46 -1.21 -0.62 -0.73 -1.3 -0.78 -0.77 -0.54 -0.63 -0.3 -0.58 -0.86 0.59 0.89 0.41 0.27 0.46 0.93 -0.2 -1.16 -0.16 0.08 0.91 1.25 0.89
-0.1 0.33 0.36 0.34 0.5 0.36 0.11 -0.0 -0.57 -0.51 -0.53 -0.45 0.34 0.31 0.59 0.75 0.23 -0.08 0.03 -0.25 -3.57 -0.5 -1.73 -1.34 0.77 -0.28
-0.07 -0.25 -0.28 -0.22 -0.09 0.21 0.35 0.1 -0.05 -0.21 -0.45 -0.41 0.02 0.29 0.33 0.45 0.03 0.53 0.59 0.21 -1.77 -0.9 -0.01 -0.49 0.25 0.08
-0.45 0.23 -0.56 -0.44 -0.23 -1.5 -0.37 -0.6 -1.32 -0.43 -0.81 -0.49 -0.38 0.95 0.7 0.54 0.33 0.51 1.01 0.18 -2.0 0.88 -0.83 -0.31 -0.35 0.81
-0.04 0.14 0.16 0.19 0.43 0.29 0.3 0.11 0.06 -0.15 -0.16 -0.09 0.12 0.49 0.45 0.57 -0.16 0.01 0.35 -0.14 -3.43 -0.4 -0.67 -0.84 -0.63 -0.18
-0.04 -0.01 -0.16 -0.22 -0.14 0.06 -0.21 -0.51 -0.4 -0.25 -0.7 -0.34 -0.25 0.49 0.51 0.46 -0.06 0.31 0.3 -0.36 -1.56 -0.31 -0.03 0.06 0.76 0.71
0.07 -0.04 -0.17 0.02 0.26 0.36 0.21 0.12 -0.14 -0.34 -0.15 -0.42 -0.02 0.64 0.17 0.37 0.05 0.49 0.35 0.08 -4.07 -0.26 -0.71 -0.41 0.01 -0.01
-0.04 -0.26 0.01 -0.19 -0.1 0.2 0.15 0.03 -0.13 -0.08 -0.44 -0.46 -0.02 0.15 0.21 0.14 0.46 0.52 0.53 0.41 -3.35 -0.67 -0.35 -0.39 0.22 0.48
-0.0 -0.33 -0.23 0.11 0.34 0.64 0.51 0.52 0.41 0.15 -0.03 -0.4 -0.35 0.02 0.17 0.15 -0.24 0.3 0.13 -0.04 -2.36 -0.25 -0.25 -0.85 -0.35 0.03
-0.59 -0.45 -0.27 -0.12 0.14 0.07 -0.01 -0.09 0.06 0.02 -0.1 -0.08 -0.49 0.86 -0.02 0.75 -0.06 0.24 -0.13 -0.11 -1.81 -0.03 -0.5 -0.24 0.55 0.45
0.4 0.48 0.53 0.31 0.26 0.28 0.03 0.14 -0.39 -0.42 -0.68 -0.53 0.08 -0.01 -0.22 -0.4 -0.07 0.52 0.69 0.34 -3.47 -0.8 -1.17 -0.61 -0.04 0.64
0.73 0.57 0.46 0.07 -0.16 -0.09 0.19 0.24 0.03 -0.14 -0.34 -0.39 0.29 0.35 0.15 -0.02 -0.13 0.36 0.22 0.34 -4.43 -1.87 -1.37 -0.94 0.25 0.22
-1.16 -0.76 -0.16 -0.04 0.01 0.27 0.25 0.08 0.5 0.22 -0.07 -0.33 -1.42 0.53 0.48 0.67 0.16 0.61 -0.0 -0.1 -2.8 -0.15 0.06 -0.55 0.06 0.18
-0.48 -0.27 -0.57 -0.66 -0.59 -0.24 0.42 0.23 0.28 -0.15 -0.49 -0.77 -0.82 -0.41 1.43 0.04 0.12 0.76 0.56 0.04 -1.41 -1.21 0.44 -0.03 0.33 -0.03
0.07 -0.4 -0.32 0.11 0.28 0.01 0.27 0.3 -0.01 0.2 0.06 -0.22 -0.33 0.63 0.79 0.73 -0.17 -0.19 -0.04 0.26 -4.29 0.18 -1.09 -1.14 -0.51 0.2
-0.67 -0.79 -0.59 -0.28 -0.27 -0.2 -0.11 0.09 0.49 0.16 0.03 -0.37 -0.76 0.75 -0.15 0.85 -0.24 0.46 0.25 -0.05 -2.73 0.64 -0.04 -0.45 0.27 0.41
0.24 -0.05 0.11 0.17 -0.15 -0.51 -0.14 0.01 -0.41 -0.37 -0.51 -0.63 0.15 0.34 0.82 0.74 0.0 0.42 0.33 0.07 -1.73 0.3 -0.8 -0.69 -0.19 0.26
-0.81 0.28 0.36 0.17 0.12 -0.16 -0.14 -0.03 0.15 0.09 0.1 -0.0 -0.95 0.51 0.39 0.38 0.11 0.52 0.14 0.02 -3.13 -1.42 -0.58 -0.57 0.49 0.34
0.15 0.48 -0.06 -0.4 0.03 0.72 0.29 0.13 -0.05 -0.4 -0.4 -0.87 -0.12 0.47 -0.09 0.43 0.12 0.4 0.52 0.12 -3.36 -0.11 -0.47 -1.1 -0.06 0.09
-0.05 -0.09 -0.01 -0.0 0.18 0.11 0.19 -0.12 -0.36 -0.3 -0.87 -0.76 -0.01 0.71 0.48 0.57 0.09 0.47 0.34 0.02 -2.78 -1.13 -0.32 -0.22 0.26 0.49
-0.07 -0.57 -0.66 -0.83 -0.1 0.44 0.61 0.28 0.0 -0.42 -0.86 -1.4 -0.03 0.35 0.52 0.3 0.38 0.96 0.76 0.58 -3.89 -1.29 0.57 -1.55 -0.07 -0.27
-0.65 0.2 0.18 0.17 0.09 -0.19 -0.01 -0.07 -0.22 -0.11 -0.23 -0.17 -0.75 -0.23 0.21 0.59 0.17 0.44 0.43 0.06 -2.05 -0.2 -0.09 0.16 0.42 0.05
-0.09 0.35 -0.06 -0.16 -0.1 0.28 0.23 0.09 -0.05 -0.64 -1.07 -1.04 -0.42 0.37 0.45 0.4 0.3 0.64 0.76 0.32 -2.91 -1.09 -0.1 -0.36 0.11 0.17
0.48 0.08 0.05 0.16 0.41 0.11 0.1 -0.12 -0.49 -0.82 -1.08 -0.7 0.45 0.37 0.29 0.67 0.28 0.49 0.26 -0.14 -4.68 -0.23 -1.3 -0.48 0.28 0.26
0.38 0.28 0.06 -0.19 -0.13 -0.22 -0.1 -0.25 -0.41 -0.43 -0.55 -0.49 -0.0 0.47 0.29 0.5 -0.01 0.28 0.09 -0.08 -1.89 0.7 -0.57 -0.31 0.3 0.37
-0.17 -0.34 -0.07 -0.05 -0.01 0.08 0.2 0.27 0.47 0.37 0.1 0.16 0.21 0.18 0.17 0.62 0.04 0.47 0.39 0.2 -4.65 -2.07 -0.21 -0.92 -0.18 -0.4
-0.78 -0.3 -0.26 -0.11 0.11 -0.36 -0.0 -0.31 0.04 -0.18 -0.72 -0.76 -1.06 0.61 0.33 0.76 0.1 0.36 0.27 -0.18 -0.79 0.52 0.24 -0.39 0.45 0.42
-0.45 -0.63 -0.5 -0.55 -0.49 -0.1 0.39 0.27 0.38 -0.03 -0.29 -0.59 -0.7 0.62 0.79 0.46 0.06 1.01 0.58 0.03 -4.0 -0.7 -0.11 -0.35 0.17 -0.05
0.1 0.17 0.14 0.06 -0.09 -0.34 0.06 0.35 0.23 0.16 0.08 -0.22 -0.14 0.2 0.82 0.24 -0.11 0.31 -0.02 0.11 -1.85 -0.69 -0.03 -0.95 0.03 -0.37
0.11 -0.02 0.43 0.32 0.27 0.06 0.33 0.23 -0.09 -0.18 -0.4 -0.52 -0.16 -0.0 0.27 0.29 0.15 0.55 0.26 0.19 -4.66 -0.47 -0.91 -0.82 0.38 -0.03
0.03 0.01 -0.04 -0.23 -0.45 -0.55 -0.14 -0.07 -0.13 -0.17 -0.27 -0.39 0.09 0.39 0.62 0.78 0.35 0.68 0.35 0.05 -1.62 0.08 -0.23 -0.5 -0.21 -0.23
0.49 -0.13 -0.38 -0.74 -1.24 -1.02 -0.54 -0.66 -1.32 -1.2 -1.11 -0.72 0.72 0.94 2.06 1.03 0.48 0.68 0.57 -0.23 -1.66 -0.4 -2.39 -1.11 -0.63 -0.57
0.46 0.39 0.51 0.34 0.11 0.01 0.29 0.46 0.02 -0.02 -0.26 -0.49 0.18 0.19 0.43 0.33 -0.09 0.3 0.11 0.21 -5.76 -0.76 -1.95 -1.55 -0.03 -0.14
0.34 0.07 0.13 0.24 0.14 0.07 -0.13 -0.27 -0.59 -0.41 -0.61 -0.63 -0.01 0.58 0.31 0.57 -0.02 0.61 0.28 -0.01 -0.93 -0.75 -0.85 -0.31 -0.0 0.47
-0.0 -0.3 -0.22 -0.31 0.06 -0.3 0.36 0.21 0.28 0.14 -0.07 0.04 0.14 0.79 0.3 0.76 0.35 0.45 0.13 0.19 -3.61 -1.38 -0.5 -1.06 -0.25 -0.3
0.13 0.18 0.03 -0.1 -0.4 -0.72 -0.02 -0.09 -0.99 -0.78 -0.95 -0.76 0.05 0.43 0.31 0.15 0.03 0.25 0.46 0.19 -2.82 1.13 -0.81 -0.06 0.15 0.93
0.38 -0.21 -0.46 -0.67 -0.57 -0.42 -0.06 -0.14 -0.59 -0.49 -0.64 -0.69 0.58 1.07 0.68 0.95 0.3 0.2 0.48 -0.19 -4.41 -2.36 -0.07 -0.46 0.71 0.3
-0.47 0.2 0.28 -0.0 -0.39 -0.42 -0.12 0.04 -0.02 -0.25 -0.32 -0.57 -0.78 0.15 0.45 0.02 0.23 0.56 0.47 0.45 -4.36 -2.99 -0.41 -0.09 0.92 0.95
-0.12 0.07 0.24 -0.05 -0.17 -0.27 -0.02 0.09 -0.05 -0.06 -0.33 -0.4 -0.24 0.68 1.1 0.68 0.23 0.29 0.25 0.62 -4.33 -0.87 -0.92 -1.32 -0.3 -0.02
0.68 0.99 0.91 0.39 0.12 0.1 -0.46 0.04 -0.64 -1.18 -1.36 -1.14 0.32 0.09 0.74 0.4 0.58 -1.19 -0.33 0.05 -3.92 -0.54 -2.39 -1.55 0.98 0.08
0.3 0.48 0.27 0.27 0.24 -0.15 0.02 -0.06 -0.3 -0.63 -0.66 -0.77 -0.42 0.55 0.19 0.75 0.4 0.59 0.27 0.2 -3.85 -1.1 0.03 -0.93 0.04 -0.16
0.43 0.13 -0.32 -0.17 0.25 0.11 0.37 0.24 0.09 -0.2 -0.26 -0.69 0.05 0.75 0.36 0.62 -0.24 0.38 0.17 -0.29 -3.03 -0.69 -0.49 -0.51 -0.05 -0.02
-0.09 -0.39 -0.52 -0.36 -0.09 0.09 0.02 -0.17 -0.19 -0.5 -0.72 -0.73 0.02 0.6 0.75 0.51 0.17 0.66 0.52 -0.38 -2.33 0.23 -0.35 -0.09 0.47 0.11
-0.31 -0.4 -0.06 -0.07 -0.16 -0.5 -0.19 -0.15 -0.34 -0.14 -0.1 -0.1 -0.26 0.64 1.5 0.79 -0.37 0.55 0.29 -0.54 -3.03 0.2 -0.5 -0.55 -0.16 -0.12
0.42 0.23 0.11 -0.04 -0.07 0.08 0.11 0.16 -0.02 -0.31 -0.4 -0.35 0.23 0.33 -0.42 0.52 0.02 0.32 0.37 0.26 -1.65 -0.88 -0.4 -0.41 -0.08 0.28
-0.38 -0.97 -0.38 -0.14 0.0 -0.29 0.56 0.44 0.46 0.67 0.23 -0.01 -0.37 -0.01 -0.56 1.21 0.47 0.53 0.3 0.65 -4.61 -0.88 -1.21 -1.31 -0.48 -0.42
-0.23 -0.23 -0.02 -0.06 -0.07 -0.28 0.08 0.07 -0.07 -0.22 -0.38 -0.59 -0.29 0.41 0.69 0.76 0.14 0.52 0.28 0.05 -1.69 -0.11 -0.25 -0.37 0.17 0.01
-0.17 -0.4 -0.47 -0.32 -0.2 -0.36 -0.14 -0.2 -0.74 -0.53 -0.68 -0.71 -0.45 0.85 1.22 1.21 0.84 0.68 0.68 -0.35 -3.17 -0.95 -0.28 -0.48 0.08 -0.51
-0.64 -0.25 -0.32 0.07 -0.17 -0.1 -0.12 -0.31 -0.14 -0.09 -0.27 -0.39 -1.31 0.51 0.52 0.4 0.09 0.21 0.26 -0.17 -0.5 0.16 0.53 0.02 0.17 0.49
-0.27 0.1 0.11 0.2 0.37 0.13 0.51 0.39 0.19 0.07 -0.14 -0.33 -0.39 0.52 0.16 0.19 -0.01 0.38 0.04 -0.03 -3.38 -0.67 -0.88 -0.34 -0.26 0.26
0.4 0.52 0.49 0.18 -0.04 0.06 -0.09 -0.35 -0.79 -1.28 -1.45 -1.38 0.1 0.79 0.44 0.71 0.63 -0.07 0.27 -0.09 -4.26 -0.58 -1.46 -1.24 1.07 0.24
-0.4 -0.01 0.12 0.09 0.2 -0.25 -0.39 -0.38 -0.35 -0.28 -0.43 -0.22 -0.45 0.6 0.78 0.83 0.21 0.68 0.25 -0.2 -2.71 -1.41 -0.05 -0.15 0.44 0.08
0.62 0.1 0.22 0.17 -0.07 -0.33 0.13 0.52 0.21 0.17 -0.53 -0.77 0.39 -0.0 0.41 0.46 -0.24 0.47 0.01 0.01 -5.16 -0.61 -1.2 -1.86 0.44 0.33
-0.74 -0.53 -0.58 -0.03 -0.08 -0.33 -0.2 -0.16 0.06 0.36 0.0 0.23 -0.62 1.09 -0.53 1.08 -0.91 -0.09 -0.1 -0.39 -1.53 0.0 -0.35 0.4 0.25 0.73
0.09 0.2 0.15 0.15 -0.06 -0.54 -0.48 -0.45 -0.65 -0.21 -0.15 -0.07 0.16 1.03 1.59 0.74 -0.07 0.08 -0.52 -0.27 -3.77 -1.05 -0.94 -0.81 0.24 -0.14
-2.27 -1.07 -0.58 -0.06 0.31 0.1 0.44 0.1 0.05 -0.1 -0.29 -0.83 -2.09 0.77 0.95 0.22 -0.1 1.09 0.67 0.28 -2.31 -1.15 0.28 -0.82 -0.14 0.43
0.06 -0.2 -0.11 0.07 -0.05 -0.12 0.03 0.08 -0.17 -0.29 -0.36 -0.41 -0.02 0.1 -0.01 0.36 -0.37 0.2 0.02 -0.3 -0.93 0.5 0.42 -0.22 0.41 0.44
-0.71 -0.33 -0.3 -0.21 -0.11 -0.19 0.01 -0.14 0.05 -0.22 -0.27 -0.48 -0.54 0.73 0.36 0.62 -0.01 0.69 0.26 -0.16 -1.76 0.34 0.13 -0.26 0.25 0.3
0.36 0.19 0.38 -0.02 -0.12 0.04 0.22 0.35 -0.02 -0.02 -0.08 0.06 -0.04 0.58 0.13 0.28 0.38 -0.03 0.24 0.21 -3.67 -2.22 -0.72 -0.65 -0.12 0.12
-0.47 -0.28 -0.23 -0.42 -0.13 0.22 0.07 -0.12 -0.03 -0.02 -0.29 -0.34 -0.53 0.7 0.45 0.46 0.12 0.43 0.12 -0.03 -0.79 -1.01 -0.02 0.0 0.3 0.47

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.