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Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-4.03 -1.01 -0.45 -0.24 -0.13 -0.72 -0.35 -0.03 -0.33 -0.0 -0.27 -0.41 -4.11 1.42 1.2 1.4 0.85 1.17 0.97 0.52 -4.18 -1.96 -2.9 -1.6 -0.47 -0.76
-0.36 -0.19 -0.07 0.09 0.1 -0.25 -0.02 -0.07 -0.33 -0.24 -0.41 -0.59 -0.39 0.55 0.42 1.05 0.14 0.65 0.4 -0.27 -0.99 0.44 -0.39 -0.49 -0.31 -0.25
-2.72 -3.11 -3.01 -2.56 -2.16 -1.95 -1.46 -1.46 -1.62 -1.13 -0.96 -1.17 -1.79 1.85 1.62 2.06 1.05 2.12 1.21 0.98 -7.05 -3.19 -4.98 -3.18 -1.99 -2.92
-2.28 -1.16 -0.89 -0.55 0.03 0.43 0.21 -0.04 -0.57 -0.91 -1.27 -1.39 -2.09 0.45 0.88 1.17 0.32 0.79 0.94 0.3 -0.23 0.12 0.61 -0.39 -0.47 -0.22
-0.05 -0.08 -0.23 -0.14 -0.41 -0.41 0.43 0.37 0.11 0.17 0.05 0.04 -0.15 -0.1 -0.43 -0.13 0.34 -0.07 0.48 -0.18 -0.09 0.16 0.17 -0.39 0.22 -0.3
-1.64 -1.0 -0.57 0.13 -0.16 -0.26 -0.24 -0.35 -0.06 -0.23 0.02 -0.36 -2.56 0.66 0.17 1.4 -0.25 0.6 0.49 -0.03 -3.25 0.4 0.04 -0.35 0.39 0.71
-0.99 -1.22 -1.98 -1.7 -1.5 -1.51 -1.14 -1.22 -1.16 -0.96 -0.41 -0.43 -0.37 1.64 1.2 1.88 0.97 2.16 1.01 0.51 -4.94 -3.96 -2.72 -3.4 -2.04 -3.15
-0.78 -0.37 -0.12 -0.07 -0.05 -0.14 0.06 -0.07 0.01 -0.26 -0.32 -0.55 -1.23 -0.39 -0.45 1.49 0.15 1.16 0.52 0.51 -2.85 -0.87 -0.2 -0.23 0.07 0.25
-1.27 -0.95 -1.14 -0.63 -0.83 -1.18 -0.88 -0.49 -0.43 -0.66 -0.73 -1.2 -1.5 0.78 1.11 1.41 -0.02 1.61 0.82 -0.64 -0.47 -0.0 0.79 -0.27 -0.29 -0.21
-1.79 -0.19 0.19 0.45 0.69 0.5 -0.23 -0.63 -0.91 -0.86 -0.88 -0.74 -1.87 0.79 0.89 0.59 -0.11 0.02 -0.18 -0.48 -1.64 0.88 -0.11 -0.27 0.51 0.41
-0.18 -0.52 -0.46 -0.3 0.12 0.27 -0.44 -0.4 -0.14 0.14 0.03 0.12 -0.1 0.47 0.65 0.99 0.06 -0.05 0.75 0.24 -0.41 0.43 -1.58 -0.68 -0.83 -0.69
-0.67 -0.43 -0.25 -0.04 -0.2 -0.77 -0.2 -0.07 -0.58 -0.43 -0.55 -0.7 -0.65 0.1 0.49 1.01 0.38 0.88 0.5 -0.09 -0.36 0.68 0.31 -0.2 -0.21 -0.27
-0.32 -0.23 -0.22 0.2 0.11 -0.41 -0.0 0.1 -0.2 -0.28 -0.26 -0.55 -0.33 -0.17 0.36 0.62 -0.09 0.37 0.35 -0.45 -0.39 0.75 0.39 -0.19 0.04 -0.26
- - - - - - - - - - - - - 2.23 2.77 2.1 0.3 -0.44 0.74 0.87 0.69 - 0.44 -0.0 - -0.41
-0.4 -0.2 0.1 0.0 0.03 -0.24 -0.6 -0.51 -0.15 -0.01 -0.08 0.03 -0.32 1.26 0.46 1.04 0.14 0.16 -0.21 -0.06 -3.59 0.28 -1.02 -0.4 -0.17 0.12
-1.38 -1.43 -0.51 -0.48 -0.22 -0.32 -0.14 -0.19 -0.16 -0.45 -0.95 -1.32 -0.85 0.84 0.99 1.55 0.57 1.14 1.06 0.52 -2.64 -2.01 -1.32 -0.7 -0.25 0.13
-0.46 -0.42 -0.2 -0.17 -0.14 -0.35 0.27 -0.12 -0.58 -0.08 -0.39 -0.43 -1.07 0.82 0.39 0.6 0.33 0.08 0.18 0.21 0.07 0.39 0.39 -0.28 -0.08 -0.53
-0.57 -0.61 -0.08 -0.34 -0.06 -0.52 0.13 -0.18 -0.66 0.13 -0.3 -0.67 -1.01 0.88 0.45 0.76 0.53 0.13 0.27 0.37 0.17 0.25 0.48 -0.81 -0.48 -0.51
-0.32 -0.21 -0.09 0.07 0.19 0.12 0.5 0.09 0.0 0.17 -0.06 -0.13 -0.53 0.16 -0.05 0.15 -0.17 -0.04 0.18 -0.03 0.08 -0.06 0.49 -0.68 -0.15 -0.28
-0.2 -0.02 -0.26 -0.17 -0.11 -0.2 -0.23 -0.14 -0.22 -0.15 -0.18 -0.26 -0.19 0.28 0.55 0.64 -0.2 0.27 0.33 -0.14 -0.36 0.2 0.24 -0.15 0.07 -0.05
-0.01 -0.3 0.04 -0.19 -0.23 -0.01 -0.1 -0.34 -0.37 -0.29 -0.43 -0.42 0.0 0.79 1.03 0.77 0.35 0.04 0.35 0.21 -1.07 -0.6 0.16 -0.71 -0.67 -0.12
-0.37 0.29 0.41 0.19 0.05 -0.33 -0.47 -0.59 -0.14 0.03 -0.09 -0.04 -0.39 0.7 0.74 0.51 -0.51 -0.01 0.84 0.69 -0.75 -0.2 -0.25 -0.85 -0.99 -0.83
-0.34 0.12 -0.04 0.05 0.07 0.1 -0.24 -0.16 -0.21 -0.25 -0.17 -0.01 0.18 0.52 0.47 0.9 0.15 0.29 0.33 -0.8 -1.41 0.56 -0.5 -0.59 -0.55 -0.36
-1.28 -0.47 -1.1 -1.09 -0.13 0.75 0.75 -0.42 -0.83 -2.07 -1.92 -2.51 -1.87 1.29 2.15 2.37 0.18 0.08 0.33 -1.09 -3.12 -1.49 -1.64 -3.03 -2.08 -1.98
-1.11 -0.32 -0.02 0.16 0.32 0.11 -0.06 -0.17 -0.1 -0.05 -0.08 -0.04 -0.79 0.54 0.64 0.64 0.15 0.49 0.32 -0.34 -0.85 0.17 -0.36 -0.34 -0.2 -0.27
-1.41 -0.52 -0.38 -0.27 -0.28 -0.26 -0.11 -0.14 -0.27 0.07 -0.4 -0.22 -1.81 -0.11 -0.22 1.62 -0.65 0.42 0.57 -0.53 -0.65 -0.61 -0.07 0.18 0.77 0.97
-1.37 -0.44 -0.09 0.04 0.15 -0.14 -0.19 -0.35 -0.46 -0.47 -0.71 -0.75 -1.49 0.67 0.66 1.64 0.11 0.31 0.25 -0.2 -1.63 0.5 -0.07 -0.26 -0.06 0.1
-2.15 -0.68 -0.3 -0.04 0.08 -0.04 -0.34 -0.21 -0.03 -0.22 -0.47 -0.77 -1.85 0.26 0.92 0.69 -0.07 0.67 0.59 -0.19 -0.14 0.66 0.35 -0.16 0.04 -0.08
-6.96 -5.73 -5.76 -4.15 -1.2 0.31 0.3 0.12 -0.38 0.03 0.06 -0.78 -4.68 1.33 2.33 2.72 -0.64 -2.3 -2.89 -2.1 -6.65 -1.16 -4.44 -2.89 0.85 -0.53
-0.65 -0.17 0.22 -0.03 0.12 -0.14 0.44 -0.12 -0.22 -0.18 -0.19 -0.98 -0.77 0.81 1.0 0.98 1.01 -0.38 0.55 1.01 -1.72 -1.3 -2.17 -0.84 -1.72 -0.8
0.26 0.64 0.97 0.4 -0.7 -1.27 -0.44 -0.41 0.07 0.22 0.24 -0.14 -0.08 0.94 0.92 0.93 0.4 0.21 0.59 0.91 -4.01 -5.9 - -1.94 -6.26 -1.99
0.0 -0.15 -0.1 -0.14 0.15 0.25 0.31 0.17 -0.09 -0.09 -0.3 -0.35 -0.02 0.29 0.58 0.54 0.15 0.32 0.17 0.01 -1.17 -0.13 -0.11 -0.48 -0.42 -0.45
-1.75 -1.02 -0.34 -0.24 0.04 -0.05 0.12 -0.15 0.23 0.69 0.56 0.24 -1.9 1.18 1.25 1.13 0.99 -0.03 0.42 0.45 -4.99 -4.73 -1.52 -1.18 -2.89 -1.44
-0.19 -0.14 -0.21 -0.24 -0.17 0.02 0.18 -0.07 -0.17 -0.11 -0.23 -0.4 -0.42 -0.12 0.08 1.06 -0.03 0.71 0.41 0.24 -3.62 -0.39 -0.0 0.02 0.37 0.0
-0.06 -0.11 0.03 -0.08 -0.18 -0.17 -0.2 -0.08 -0.43 -0.44 -0.61 -0.63 -0.12 0.39 1.08 1.29 -0.01 0.29 0.41 0.02 -0.69 0.04 -0.99 -0.7 -0.56 -0.02
-0.07 0.06 0.13 0.08 0.08 0.05 0.08 -0.04 -0.24 -0.36 -0.61 -0.64 -0.08 0.03 0.41 0.51 0.41 0.39 0.13 -0.26 -0.07 -0.29 0.26 -0.51 0.15 -0.42
-0.54 -0.57 0.1 -0.16 0.18 0.03 0.8 0.42 0.21 0.14 -0.58 -0.75 -0.95 0.43 0.53 0.86 1.06 0.24 0.64 1.04 -3.64 -1.91 -1.56 -1.28 -1.62 -1.05
-0.83 -0.24 0.1 0.19 0.19 0.16 -0.01 0.08 0.05 -0.09 -0.2 -0.18 -0.72 0.57 0.8 0.75 -0.19 0.63 0.44 -0.43 -1.77 0.31 -0.89 -0.89 -0.36 -0.14
-0.96 -2.01 -1.94 -1.82 -1.82 -2.55 -1.95 -1.48 -0.9 -0.35 -0.21 -0.13 -0.99 1.66 1.1 1.92 0.3 2.14 1.38 0.59 -3.06 -2.05 -4.31 -2.61 -1.97 -1.53
0.45 -0.07 -0.61 -0.3 0.69 0.69 0.33 0.18 0.11 -0.33 -0.86 -1.27 0.5 -0.74 0.82 1.85 -1.16 0.01 -0.35 -1.09 -1.2 -2.63 0.36 -0.85 -0.67 -0.75
-1.58 -0.98 -0.58 -0.26 -0.12 -0.41 0.12 0.1 0.26 -0.07 -0.37 -0.77 -1.76 0.53 0.48 0.99 0.15 0.78 0.63 -0.34 -0.54 0.47 0.69 -0.23 -0.22 -0.68
-1.09 -0.37 -0.4 -0.34 -0.48 -0.56 -0.44 -0.4 -0.59 -0.54 -0.72 -0.79 -0.73 0.78 0.83 1.49 0.02 1.15 0.89 -0.37 0.39 -1.08 0.37 -0.78 -0.68 -0.42
-0.3 0.04 0.23 0.25 0.03 -0.43 -0.04 0.08 -0.2 -0.25 -0.48 -0.6 -0.5 0.25 0.49 0.65 0.06 0.63 0.22 -0.33 -0.47 0.25 -0.08 -0.39 0.08 -0.3
-1.22 -0.44 -0.43 -0.16 0.32 0.42 0.02 -0.35 -0.23 -0.2 -0.38 -0.8 -1.25 0.08 1.03 1.67 -0.11 0.92 0.54 -0.59 -1.22 -0.38 -0.01 -0.35 -0.83 -0.8
-1.6 -0.47 -0.07 -0.14 0.11 0.14 -0.15 -0.3 -0.24 -0.12 -0.43 -0.51 -1.64 0.48 0.45 1.33 0.2 0.5 0.17 -0.03 -2.29 0.13 -0.32 -0.01 0.27 0.5
-1.45 -1.69 -1.52 -1.23 -1.45 -1.84 -1.34 -1.23 -0.94 -0.44 0.03 -0.17 -0.64 1.88 1.17 2.22 0.4 1.79 1.08 0.23 -6.53 -2.5 -4.13 -3.77 -2.2 -3.29
0.38 0.36 0.09 0.0 -0.18 -0.42 0.34 0.22 0.14 0.31 0.11 0.22 0.03 -0.2 -0.27 -0.01 0.22 -0.2 0.3 -0.09 0.02 -0.52 -0.02 -0.89 -0.25 -0.47
0.07 -0.01 -0.45 -0.28 -0.63 -0.69 0.05 -0.09 -0.38 -0.37 -0.53 -0.53 0.21 1.0 -0.45 0.6 -0.08 0.86 -0.06 -0.04 -1.95 0.83 -0.21 -0.02 0.21 0.14
0.15 0.06 -0.23 -0.3 -0.33 -0.3 -0.09 -0.17 -0.45 -0.26 -0.46 -0.56 0.17 1.06 -0.09 0.78 0.08 0.66 0.34 0.21 -2.3 0.32 -0.49 -0.47 0.09 -0.17
-2.03 -0.38 -0.36 -0.44 0.35 0.57 0.43 -0.37 -0.15 -1.28 -1.61 -1.71 -2.59 -0.07 1.36 1.47 0.6 0.55 0.7 0.58 -0.97 -0.26 -0.36 -1.04 -0.33 -0.54
-1.12 -0.56 -0.47 -0.0 -0.16 -0.6 0.62 0.35 0.26 0.09 -0.22 -0.33 -0.8 0.68 0.18 0.92 0.27 0.78 0.26 -0.11 -1.8 0.39 -0.61 -1.25 0.08 -0.18
-0.66 -0.56 -0.36 -0.1 0.09 -0.03 0.4 0.32 0.06 0.07 -0.1 -0.24 -0.25 0.51 0.13 0.85 0.01 0.59 -0.01 -0.34 -0.57 0.26 -0.34 -0.42 -0.26 -0.34
-1.89 -1.26 -1.28 -1.31 -0.98 -0.93 -0.84 -1.13 -1.1 -1.05 -1.38 -1.66 -1.76 1.08 1.27 1.76 0.25 1.43 1.29 -0.34 0.09 -0.73 0.32 -0.09 -0.53 -0.11
0.2 0.16 -0.04 -0.19 0.24 -0.15 0.44 0.02 -0.01 0.44 0.07 0.1 -0.37 0.4 0.08 0.4 -0.06 -0.27 -0.1 -0.14 -0.39 -0.35 -0.44 -0.28 -0.68 0.18
-1.29 -0.93 -1.14 -1.01 -0.72 -0.73 -0.7 -0.9 -0.74 -0.7 -1.0 -1.15 -1.25 1.08 1.36 1.74 0.27 1.37 1.04 -0.28 -0.63 -0.27 -0.28 -0.27 -0.85 -0.28
-2.02 -1.13 -0.36 0.05 0.18 -0.23 0.1 0.06 -0.03 0.03 0.03 0.13 -2.05 0.18 0.52 0.48 0.03 0.7 0.69 -0.35 -0.24 0.86 -0.04 -0.51 -0.1 -0.38
-0.37 -0.13 0.07 -0.13 0.04 0.26 0.04 -0.1 -0.02 0.06 -0.06 -0.04 -0.37 -0.07 0.88 0.68 0.36 0.31 0.56 0.32 -0.38 -0.9 -0.46 -0.24 -1.26 -1.0
-0.2 -0.34 -0.51 -0.46 -0.32 -0.31 -0.25 -0.24 -0.27 -0.39 -0.43 -0.53 -0.04 0.65 0.88 0.99 -0.05 0.42 0.54 -0.41 0.15 -0.48 0.42 -0.29 -0.44 -0.02
-1.99 -0.48 -0.07 -0.08 0.18 0.08 0.22 0.11 0.2 -0.05 -0.36 -0.51 -1.84 0.14 0.81 0.37 0.07 0.89 1.24 -0.32 -1.58 0.74 -0.36 -0.6 -0.66 -0.9
-0.57 -0.24 -0.05 -0.28 -0.02 0.0 -0.07 -0.04 0.02 0.04 -0.01 -0.2 -0.57 0.36 0.84 1.19 0.22 0.22 0.49 0.23 -0.74 -1.03 -0.34 -0.21 -1.03 -0.51
-0.76 -0.67 -0.54 -0.27 -0.03 -0.18 -0.2 -0.22 0.07 0.21 0.32 0.2 -0.4 -0.02 0.24 1.11 0.19 0.63 0.67 0.23 -0.76 -0.22 -0.03 -0.41 -0.41 -0.76
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.