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Heatmap: Cluster_183 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.79 -0.71 -0.32 0.38 0.6 0.41 0.48 0.53 0.46 0.36 0.15 -0.03 -1.48 -0.13 -0.29 0.24 -0.02 0.46 0.2 -0.07 -2.38 0.36 -0.39 -0.36 -0.08 -0.21
-0.73 0.04 0.07 0.43 0.42 0.61 0.63 0.47 0.46 0.34 0.36 0.37 -0.49 -0.29 -0.16 0.04 -0.6 -0.26 0.13 -0.36 -3.45 0.25 -0.35 -0.77 -0.56 -0.33
-0.08 0.13 -0.02 -0.02 -0.1 0.03 0.63 0.56 -0.05 -0.1 -0.17 -0.21 -0.44 -0.14 -0.03 -0.01 -0.06 0.44 0.55 0.18 -3.34 -0.28 -0.32 -0.2 0.27 0.04
-5.19 -1.32 -0.13 0.24 0.4 0.47 0.13 0.1 0.66 0.12 0.51 0.2 -3.53 0.03 0.16 0.09 -0.24 0.33 -0.07 -0.35 -2.33 -0.15 0.26 0.02 0.84 0.15
-3.22 -0.18 0.28 0.2 0.73 0.55 0.33 -0.09 0.23 0.31 -0.14 -0.35 -2.1 -0.07 0.12 0.06 0.17 0.34 0.39 0.3 -2.18 0.31 -0.22 -0.62 0.08 -0.08
-0.24 -0.07 0.06 0.17 0.22 -0.12 0.42 0.5 0.27 0.34 0.11 -0.17 -0.42 -0.4 -0.06 0.05 0.09 0.5 -0.03 0.11 -3.2 0.42 -0.18 -0.59 -0.05 -0.43
-1.75 -0.59 -0.07 0.46 0.55 0.12 0.33 0.22 0.68 0.22 0.27 0.03 -1.94 0.04 0.03 0.05 -0.49 0.18 0.07 -0.35 -1.78 -0.19 0.29 -0.12 0.43 0.07
-1.28 -0.34 0.08 0.24 0.5 0.6 0.42 0.54 0.55 0.27 0.11 -0.27 -1.99 0.04 0.59 -0.39 -0.49 0.63 -0.11 -0.77 -3.48 0.09 -0.39 -2.29 0.81 0.09
-0.49 0.64 0.51 0.47 0.39 0.11 0.54 0.79 0.65 1.05 0.73 0.05 -0.42 -2.52 -0.98 -1.86 -0.3 0.53 0.29 -0.23 -4.82 -0.66 -1.52 -0.86 0.15 -1.76
-1.55 0.33 0.34 0.59 0.61 0.48 0.41 0.51 0.34 0.17 0.07 0.01 -1.37 -0.3 -0.15 -0.04 -0.42 0.57 0.15 -0.4 -4.53 -0.49 -0.36 -0.65 0.3 -0.08
-0.26 -0.32 -0.02 0.3 0.44 0.28 0.56 0.49 0.24 0.25 0.27 0.12 -0.3 -0.26 -0.22 -0.09 -0.16 0.02 -0.06 -0.15 -2.95 -0.07 -0.35 -0.43 0.33 -0.07
0.21 -0.46 -0.38 0.14 0.46 0.19 0.35 0.42 0.54 0.26 0.15 -0.12 -0.23 -0.56 -0.35 -0.62 0.15 0.31 -0.18 -0.19 -3.45 -0.21 -0.11 0.11 0.52 -0.05
-0.63 -0.25 0.17 0.72 0.65 0.2 0.62 0.67 0.42 0.29 0.34 0.02 -1.07 -0.34 -0.26 -0.12 -0.07 0.2 0.0 -0.11 -5.58 -1.12 -0.58 -0.68 0.29 0.03
-2.69 -0.53 -0.13 0.25 0.59 0.65 0.43 0.25 0.26 0.03 0.07 0.05 -2.72 -0.53 -0.06 0.11 0.01 0.6 0.23 0.11 -3.95 0.55 -0.03 -0.14 0.26 -0.2
-1.55 -0.25 0.12 0.33 0.42 0.1 0.42 0.32 0.67 0.43 0.52 0.59 -1.29 0.15 -0.14 0.15 -0.37 0.08 -0.16 -0.37 -3.98 -0.25 -0.07 -0.39 0.03 -0.11
-0.26 -0.17 -0.28 0.15 0.56 0.46 0.68 0.61 0.79 0.39 0.51 0.18 -0.54 -0.69 -0.7 -0.85 -0.56 0.26 0.16 -0.2 -4.33 -0.55 0.05 -0.78 0.48 -0.58
-2.56 -0.31 0.14 0.29 0.34 0.1 0.43 0.29 0.24 0.23 -0.04 -0.28 -2.45 -0.1 0.47 0.05 0.39 1.02 0.63 0.32 -2.98 -0.74 -0.23 -0.71 -0.1 -0.24
-0.71 -0.38 -0.23 0.05 0.27 0.35 0.4 0.34 0.42 0.29 0.2 0.13 -0.56 -0.03 -0.04 0.11 -0.18 0.4 -0.06 -0.34 -2.7 0.27 0.03 -0.14 0.01 -0.15
-1.34 -0.25 -0.39 0.19 0.62 0.82 0.61 0.3 0.43 0.18 -0.24 -0.59 -1.39 -0.06 -0.08 0.15 0.09 0.45 0.02 -0.02 -4.18 -1.22 0.0 -0.27 0.73 0.03
-0.33 -0.35 -0.19 0.18 0.44 0.32 0.5 0.44 0.54 0.25 0.38 0.05 -0.71 -0.22 0.1 -0.26 -0.25 0.32 0.09 0.05 -4.12 0.09 0.08 -0.8 0.02 -0.45
-0.26 -0.11 0.14 0.16 0.31 0.16 0.33 0.26 0.42 0.19 -0.03 -0.24 -0.66 0.4 -0.15 0.25 -0.17 0.58 -0.02 -0.26 -2.14 0.09 -0.22 -0.72 -0.06 -0.11
-1.49 -0.59 -0.33 0.58 0.96 0.42 0.49 0.32 0.48 0.21 0.13 -0.13 -1.71 -0.07 0.06 -0.06 -0.09 0.52 -0.12 -0.27 -4.98 -0.35 0.31 -0.0 0.02 -0.4
-0.23 0.35 0.35 0.14 0.21 0.25 0.54 0.5 0.15 0.01 -0.03 -0.06 -0.4 0.04 -0.13 0.03 -0.12 0.4 0.19 0.0 -7.23 -0.21 -0.38 -0.93 0.09 -0.13
-0.43 -0.23 -0.62 0.32 0.67 0.36 0.55 0.65 0.2 0.19 0.14 -0.31 -1.42 -0.55 -0.42 -0.11 -0.08 0.35 0.12 0.21 - -0.89 -0.04 0.26 0.49 0.13
-0.18 -0.5 -0.27 0.04 0.11 0.3 0.71 0.64 0.56 0.1 -0.1 -0.21 -0.1 0.26 0.05 0.32 -0.12 0.23 0.01 -0.02 -2.28 -1.48 0.04 -0.9 0.13 -0.01
-0.96 -0.63 -0.32 0.02 -0.01 -0.18 0.48 0.37 0.36 0.23 0.05 -0.19 -0.87 0.27 -0.09 0.34 0.12 0.61 0.01 -0.07 -1.96 0.4 0.23 -0.39 0.26 -0.24
0.23 -0.16 -0.23 0.01 0.34 0.33 0.75 0.84 0.49 0.69 0.48 0.24 -0.04 -0.93 -0.66 -0.79 -0.26 0.5 0.14 -0.0 -5.44 -0.42 -0.39 -0.81 -0.26 -0.99
-0.11 -0.07 -0.18 0.41 0.62 0.4 0.52 0.36 0.34 0.57 0.53 0.23 -0.45 -0.62 -0.41 -0.68 -0.09 0.25 0.1 0.18 -4.39 -0.64 -0.76 -0.4 0.02 -0.3
-0.89 0.14 0.21 0.22 0.43 0.25 0.28 0.26 0.01 0.13 0.02 -0.18 -0.97 -0.01 0.19 0.18 0.24 0.5 0.29 0.12 -3.51 -0.14 -0.33 -0.63 0.22 -0.34
-0.29 -0.23 -0.06 0.22 0.11 0.04 0.5 0.6 0.5 0.3 0.49 0.15 -1.13 -0.46 -0.39 -0.41 -0.39 0.33 0.06 -0.2 -2.66 -0.15 -0.05 0.14 0.39 -0.11
-0.44 0.02 0.21 0.35 0.46 0.37 0.49 0.3 0.39 0.47 0.46 0.23 -0.5 -0.35 -0.35 -0.18 0.07 0.32 0.11 0.27 -4.12 -0.54 -0.58 -0.77 -0.38 -0.41
-1.41 -0.03 0.25 0.41 0.4 0.11 0.37 0.44 0.28 0.1 -0.05 -0.35 -1.52 -0.17 0.36 0.22 0.05 0.64 0.27 -0.02 -2.82 -0.1 -0.04 -0.71 0.18 -0.36
-1.54 -0.15 -0.0 0.55 0.59 0.17 -0.07 -0.0 -0.06 -0.14 -0.11 -0.25 -1.71 -0.28 0.05 0.01 0.45 0.68 0.48 0.07 -2.66 0.62 0.22 -0.19 -0.07 -0.33
-2.44 -0.08 0.18 0.74 0.82 0.68 0.65 0.67 0.61 0.17 -0.05 -0.3 -3.46 -0.39 -0.09 -0.19 -0.21 0.35 -0.12 -0.26 -5.09 -0.34 -0.06 -0.54 0.28 -0.23
-0.62 0.29 0.5 0.36 0.25 -0.28 0.27 0.4 0.29 0.34 0.21 -0.15 -0.39 -0.45 -0.06 -0.1 0.24 0.55 0.15 0.41 -4.41 -0.09 -0.26 -0.98 -0.25 -0.51
-0.03 0.26 -0.3 1.04 0.54 0.53 0.59 0.49 0.53 0.71 0.31 -0.24 -0.63 -1.15 -1.0 -1.28 -0.49 0.27 0.29 0.53 -5.87 -0.49 -1.22 -0.87 0.24 -0.93
-1.01 0.09 0.11 0.82 1.03 0.8 0.8 0.68 0.57 0.28 0.12 -0.31 -1.92 -1.05 -0.8 -0.77 -0.26 0.07 -0.05 -0.24 -4.48 -0.36 -0.22 -1.23 0.54 -0.52
-1.32 0.11 -0.07 0.23 0.53 0.67 0.44 0.27 0.4 0.09 0.32 0.0 -1.55 -0.15 -0.08 0.11 -0.28 0.08 0.03 -0.02 -4.37 0.46 -0.29 0.05 -0.04 -0.39
-1.81 -0.13 -0.27 0.1 0.28 0.11 0.63 0.21 0.14 0.33 0.06 0.14 -1.89 -0.04 -0.01 0.24 -0.04 0.63 0.16 0.0 -4.25 0.24 0.22 -0.42 0.39 -0.16
-0.01 0.16 0.32 0.22 0.42 0.01 0.23 0.41 0.1 0.3 0.04 -0.17 -0.28 -0.42 -0.1 -0.25 0.31 0.49 0.18 0.11 -5.42 0.46 -0.83 -0.63 -0.31 -0.3
-0.12 -0.01 0.34 0.38 0.33 0.11 0.81 0.58 0.19 0.08 -0.21 -0.33 -0.26 -0.56 -0.75 -0.34 -0.13 0.64 0.11 0.35 -3.65 0.42 -0.37 -0.94 -0.25 -0.3
-0.15 -0.03 -0.05 0.32 0.49 0.47 0.57 0.55 0.35 0.28 0.24 -0.06 -0.61 -0.59 -0.19 -0.55 -0.17 0.32 0.21 0.01 -3.26 -0.08 -0.13 -0.84 0.09 -0.35
0.03 0.42 0.26 0.21 0.43 0.18 0.41 0.36 0.1 -0.06 -0.39 -0.43 -0.08 -0.45 -0.06 -0.28 -0.25 0.5 0.21 0.22 -3.98 -0.68 -0.15 -0.36 0.38 -0.11
-2.44 -0.39 -0.22 0.46 0.59 0.37 0.57 0.55 0.54 0.28 0.24 -0.1 -3.01 -0.43 -0.08 -0.05 0.03 0.7 0.39 0.08 -3.47 -0.13 -0.22 -0.51 0.19 -0.36
-2.2 -0.76 -0.1 0.29 0.39 0.23 0.55 0.46 0.35 0.12 -0.01 -0.23 -1.96 0.11 0.13 0.69 0.32 0.53 0.28 -0.14 -2.23 0.07 -0.44 -0.54 0.17 -0.27
-0.85 0.17 0.33 0.48 0.41 0.11 0.31 0.47 0.37 0.22 0.15 0.11 -0.97 -0.06 0.19 0.15 0.07 0.7 0.11 0.23 -5.12 -0.46 -0.7 -1.36 -0.15 -0.54
-0.66 0.03 0.2 0.43 0.4 0.13 0.55 0.52 0.48 0.36 0.19 -0.16 -0.9 0.13 -0.34 0.14 -0.22 0.07 -0.19 -0.17 -3.37 0.12 -0.32 -1.19 0.4 -0.18
-0.73 -0.03 0.11 0.81 0.73 0.46 0.71 0.7 0.44 0.47 0.13 0.1 -1.4 -0.82 -0.66 -0.81 -0.94 0.24 -0.28 -0.09 - -0.22 -0.33 -0.87 0.84 -0.35
-0.8 -0.21 -0.04 0.13 0.24 0.2 0.47 0.45 0.6 0.32 0.34 0.08 -0.57 0.21 0.04 0.27 -0.25 0.1 0.06 -0.27 -3.2 -0.22 -0.3 -0.53 0.12 -0.1
-2.07 -0.58 -0.31 -0.02 0.21 0.12 0.03 -0.05 0.29 0.19 0.35 0.21 -2.01 0.25 0.03 -0.0 0.3 0.06 -0.19 -0.34 -3.19 0.48 0.06 0.3 0.9 0.29
-1.0 -0.28 -0.11 0.38 0.51 0.37 0.83 0.76 0.48 0.01 -0.1 -0.41 -1.36 0.33 -0.19 0.49 -0.29 0.62 -0.35 -0.24 -4.15 -1.43 -0.13 -0.91 0.58 -0.19
-0.4 -0.15 -0.09 -0.06 0.26 0.05 0.58 0.31 0.22 0.28 -0.18 -0.21 -0.44 0.12 0.19 0.22 0.1 0.52 0.26 0.18 -3.78 -0.31 -0.37 -0.02 -0.11 -0.3
-0.9 -0.09 0.19 0.37 0.41 0.18 0.37 0.41 0.25 0.18 0.07 -0.09 -0.8 -0.19 0.03 -0.21 -0.12 0.33 -0.01 0.04 -2.3 0.2 -0.01 -0.54 0.17 0.01
-1.31 -0.06 -0.02 0.3 0.29 0.14 0.44 0.39 0.18 0.17 0.03 -0.29 -1.22 0.18 0.02 0.38 -0.04 0.43 -0.07 -0.05 -2.36 -0.17 0.01 -0.16 0.12 0.18
-0.39 -0.27 -0.35 0.21 0.53 0.85 0.66 0.32 0.14 -0.08 -0.23 -0.76 -1.41 0.07 -0.51 0.4 -0.21 0.54 0.12 0.28 -3.6 -0.43 0.1 -0.25 0.11 0.0
-0.77 0.02 0.09 0.08 0.37 0.32 0.35 0.2 0.29 0.15 0.18 -0.05 -0.51 0.09 0.47 0.16 -0.08 0.32 -0.01 -0.34 -3.6 -0.27 -0.13 -0.18 0.24 -0.4
-1.27 -0.03 -0.3 -0.01 0.22 0.19 0.26 0.3 0.39 0.23 0.36 0.1 -1.17 0.1 0.05 0.14 0.03 0.21 0.22 -0.03 -3.87 -0.08 0.01 -0.62 0.59 0.1
-1.09 -0.26 -0.29 0.32 0.33 0.35 1.03 0.98 0.7 0.87 0.44 -0.14 -1.27 -1.28 -1.04 -1.55 -0.5 0.32 0.25 0.25 -6.88 -0.69 0.33 -1.07 0.34 -0.4
-0.14 -0.51 -0.36 -0.08 0.51 0.29 0.58 0.71 0.74 0.54 0.47 0.26 -0.61 -1.09 -1.12 -1.32 -0.23 0.56 0.15 0.36 -4.49 -0.44 -0.15 -0.23 0.28 -0.49
-1.37 0.01 0.01 0.1 0.41 0.74 0.37 0.36 0.33 0.03 -0.09 -0.12 -2.17 -0.29 0.2 0.21 -0.09 0.49 0.18 -0.17 -2.91 -0.38 0.05 0.01 0.31 -0.13
-1.38 -0.38 -0.12 0.15 0.27 0.14 0.37 0.32 0.42 0.14 -0.01 -0.06 -1.38 0.23 0.14 0.06 -0.07 0.49 0.1 -0.14 -3.1 0.16 0.18 -0.37 0.35 0.18
-1.48 -0.44 -0.1 0.12 0.29 0.11 0.38 0.37 0.44 0.57 0.6 0.33 -1.88 -0.44 0.6 -0.19 -0.14 0.11 -0.1 -0.55 -2.37 0.0 0.16 -0.18 0.4 -0.22
-0.44 -0.23 -0.03 0.22 0.21 -0.17 0.36 0.25 0.36 0.27 0.27 -0.01 -0.29 0.09 0.13 0.11 0.01 0.44 -0.17 -0.13 -3.92 0.17 -0.26 -1.01 0.48 -0.12
-2.8 -0.38 0.02 0.59 0.84 0.96 0.58 0.5 0.41 0.34 -0.13 -0.18 -2.9 -0.52 0.21 0.43 -0.18 0.79 -0.0 0.17 -3.03 -2.33 0.08 -1.36 -0.46 -0.01
-1.99 -0.36 0.03 0.52 0.47 0.69 0.35 0.08 0.35 0.34 0.1 0.11 -1.44 0.07 0.59 -0.05 0.27 0.31 -0.18 -0.1 -3.26 -0.36 0.04 -0.57 0.15 -0.65
-2.17 -0.71 -0.14 0.28 0.35 0.16 0.63 0.18 0.22 -0.06 -0.31 -0.58 -2.32 0.54 0.16 0.5 0.08 0.55 0.17 -0.09 -2.14 -0.24 -0.17 0.07 0.29 0.44
-0.76 -0.44 -0.25 0.22 0.52 0.64 0.73 0.28 0.64 0.58 0.12 0.01 -0.67 0.12 -0.52 0.04 -0.67 -0.16 -0.08 0.0 -4.77 -0.2 -0.07 0.11 0.03 -0.36
-0.2 -0.21 0.03 0.24 0.45 0.51 0.62 0.69 0.47 0.35 -0.02 -0.19 -0.35 -0.8 -0.29 -0.53 -0.05 0.5 0.13 0.27 -3.91 -0.84 -0.05 -0.46 0.04 -0.5
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-0.67 -0.28 -0.09 0.19 0.11 0.03 0.47 0.4 0.29 0.05 -0.12 -0.42 -0.81 0.01 0.05 0.39 0.04 0.63 0.25 -0.07 -2.02 0.34 0.05 -0.48 0.01 -0.26
-0.95 0.04 0.1 0.25 0.37 0.33 0.42 0.33 0.31 0.24 -0.02 -0.23 -1.32 -0.42 0.34 -0.13 0.04 0.81 0.48 0.28 -5.76 -0.92 -0.14 0.03 -0.21 -0.43
0.34 -0.18 -0.52 0.04 0.56 0.44 0.8 0.92 0.87 0.6 0.45 -0.14 0.0 -2.44 -1.07 -2.2 -0.31 0.48 0.16 0.18 -5.84 -2.64 -0.06 -0.99 0.39 -0.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.