Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.41 0.0 0.84 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 1.0 0.0 0.95 0.33 0.82 0.56 0.0 0.0 0.57 0.0
0.04 0.31 0.31 0.27 0.42 0.38 0.52 0.43 0.29 0.22 0.24 0.17 0.1 0.01 0.16 0.06 1.0 0.01 0.01 0.01 0.25 0.29 0.03 0.38 0.48 0.3
0.05 0.33 0.34 0.29 0.45 0.48 0.6 0.45 0.4 0.31 0.27 0.2 0.12 0.0 0.17 0.06 1.0 0.01 0.02 0.0 0.32 0.41 0.03 0.43 0.63 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.22 0.24 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.21 0.0 0.0 0.16 0.0 0.18 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.72 0.81 0.0 0.17 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.2 0.26 0.27 0.2 0.2 0.17 0.07 0.12 0.28 0.31 0.16 0.02 0.23 0.05 0.01 1.0 0.26 0.06 0.47 0.03 0.05 0.02 0.22 0.06 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.98
0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 1.0 0.12 0.65 0.03 0.16 0.0 0.42 0.02 0.03 0.1 0.31 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.91 0.78 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.2 0.0 0.79 0.32 1.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.34 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.28 0.3 0.0 0.14 0.0 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 1.0 0.0 0.26 0.82 0.0 0.1 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.14 1.0 0.44 0.0 0.4 0.0 0.4 0.47 0.0 0.0 0.21 0.12 0.16
0.5 0.27 0.07 0.38 0.0 0.22 0.64 0.3 0.8 0.21 0.07 0.07 0.35 0.33 0.5 0.28 0.44 0.06 0.57 0.51 0.11 0.0 0.04 0.24 1.0 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.29 0.31 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 1.0 0.37 0.36 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.56 0.0 0.44 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.0 0.0 0.26 0.43 1.0 0.12 0.24 0.26 0.45 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.36 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 1.0 0.0 0.6 0.28 0.0 0.26 0.0 0.32 0.0 0.0
0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.12 0.0 0.23 0.28 0.23
0.06 0.0 0.06 0.11 0.1 0.33 0.13 0.0 0.08 0.08 0.06 0.09 0.0 0.0 0.07 0.05 1.0 0.03 0.04 0.07 0.37 0.07 0.0 0.11 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 1.0 0.97 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.24 0.31 0.23 0.52 0.08 0.0 0.0 0.51 0.66 1.0 0.72 0.0 0.62 0.0 0.04 0.0 0.0 0.36 0.05 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.0 0.44 0.0 0.19 0.35 0.0 0.2 0.0 0.0 0.51 0.0 0.43 0.13 0.73 0.15 0.0 0.3 0.35 0.88 0.12 0.26
0.0 0.01 0.05 0.1 0.39 1.0 0.64 0.24 0.45 0.07 0.02 0.05 0.0 0.13 0.13 0.09 0.19 0.1 0.17 0.18 0.01 0.01 0.3 0.14 0.02 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.88 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.19 0.15 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.15 0.21 0.1 0.02 0.05 0.09 0.08 0.1 0.48 0.55 0.37 0.19 0.05 0.01 0.03 1.0 0.11 0.09 0.09 0.12 0.01 0.02 0.27 0.04 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.7 0.0 0.0 0.0 0.13 0.25 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.59 0.22 0.5 0.15 0.92 0.58 0.4 0.62 0.3 0.0 0.55 0.29
0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.52 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.48 1.0 0.0 0.87 0.34 0.0 0.0 0.0 0.81 0.28 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.54 1.0 0.19 0.58 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 1.0 0.0 0.42 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.8 1.0 0.49 0.23 0.32 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)