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Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.15 -0.52 -0.91 -0.89 -0.93 -0.77 -0.17 0.05 0.08 -0.12 -0.48 -0.7 -1.41 0.83 1.22 0.67 0.0 0.04 -0.06 -0.3 -1.81 0.26 0.53 -0.03 1.15 0.52
-0.37 -0.44 -0.37 0.45 0.4 0.11 -0.03 -0.04 -0.51 -0.14 0.1 -0.35 -0.56 0.4 -0.85 -0.08 -0.97 -0.42 -0.82 -0.11 -4.21 0.84 -1.15 -1.29 1.6 1.35
0.13 -0.43 -0.43 -0.19 -0.28 -0.49 -0.23 -0.36 -0.36 0.01 0.26 0.43 0.39 0.91 0.28 0.5 -0.23 -0.24 -0.18 -0.62 -1.06 0.32 -0.37 -0.07 0.5 0.17
0.29 -1.2 -1.18 0.38 -0.17 -0.23 0.53 0.34 -0.12 -0.69 -0.92 -1.14 -0.7 1.82 -1.07 1.17 -1.15 -0.29 -0.09 -0.51 -1.12 -0.83 0.25 0.36 0.52 -0.15
-1.69 -0.42 0.03 -0.24 -0.15 0.17 0.45 0.35 0.44 0.16 -0.08 -0.48 -1.44 1.02 0.29 -0.62 -0.01 0.64 0.65 0.33 -3.88 -0.74 -0.11 -0.36 0.27 0.1
0.26 -0.31 -0.06 0.12 -0.29 -0.93 -0.19 -0.08 -0.76 -0.33 -0.22 -0.19 0.29 0.82 0.03 0.76 0.21 0.2 -0.19 -0.04 -2.02 0.07 -0.53 -0.08 0.54 0.49
0.05 -0.58 -0.64 -0.41 -0.37 -0.72 -0.19 -0.15 -0.2 -0.01 -0.07 -0.04 0.32 0.8 0.23 0.81 -0.1 0.07 -0.16 -0.27 -1.1 0.59 -0.06 0.07 0.25 0.21
-0.5 -0.72 -0.87 -0.3 -0.26 -0.78 -0.34 -0.37 -0.54 0.04 0.15 -0.06 -0.14 1.11 -0.15 0.24 -0.6 -0.2 -0.2 -1.11 0.34 0.55 0.33 0.96 0.45 0.32
-0.19 -0.8 -0.35 0.32 0.06 -0.7 -0.46 -0.47 -0.7 -0.65 -0.48 -0.44 -0.34 1.01 0.6 0.77 -0.26 0.11 -0.19 -1.1 -2.12 1.05 -0.38 -0.13 0.92 0.62
-0.85 -2.36 -1.9 -0.47 -0.05 -0.21 0.05 0.31 0.22 0.14 0.32 0.18 -0.91 0.97 -0.01 0.0 -0.97 -0.23 -0.44 -1.46 -0.74 0.59 -0.8 0.62 1.2 1.03
0.58 -0.03 -0.18 -0.02 -0.29 -0.66 0.01 -0.13 -0.53 -0.45 -0.34 -0.27 0.7 0.74 0.11 0.55 -0.05 -0.06 -0.32 -0.68 -3.35 -0.73 -0.75 -0.28 1.23 0.68
-1.74 -0.73 -0.9 -0.63 -0.1 0.26 0.57 0.55 0.4 0.18 -0.11 -0.85 -1.45 0.96 0.29 0.21 0.23 0.9 0.79 0.38 -1.76 -1.82 -0.57 -0.64 0.45 -0.18
0.19 -0.15 -0.15 0.66 0.57 -0.17 -0.08 -0.06 -0.57 -0.03 0.17 0.05 -0.02 0.2 -0.88 -0.34 -0.9 -0.84 -0.73 -0.45 -6.08 1.01 -1.85 -1.42 1.45 1.06
-1.11 -1.2 -1.06 -0.32 0.04 -0.33 -0.43 -0.3 -0.61 -0.13 -0.02 -0.21 -0.77 1.84 -1.75 0.6 -1.35 0.32 -0.63 -1.06 -1.12 0.97 0.33 -0.13 1.0 0.75
-0.96 -1.12 -0.81 -0.28 -0.34 -0.71 -0.09 -0.36 -0.21 -0.29 -0.08 -0.5 -1.36 1.27 0.53 1.28 -0.32 0.35 -0.07 -0.34 -3.39 0.28 -0.64 -0.1 0.86 0.98
-0.11 -0.05 0.25 0.36 0.2 0.01 0.33 0.26 -0.16 -0.44 -0.42 -0.34 0.02 0.55 0.6 0.65 0.11 0.01 -0.16 -0.08 -4.01 0.0 -1.13 -1.04 0.43 0.03
-0.02 -0.86 -0.66 -0.05 -0.52 -0.75 -0.29 -0.22 -0.51 -0.38 0.07 -0.45 -0.29 1.44 -0.14 0.84 -0.95 -0.11 -1.2 -1.08 -3.83 -2.91 -0.04 -1.36 2.2 0.91
-0.84 -1.02 -0.6 -0.2 -0.61 -0.96 -0.01 0.15 0.2 -0.22 -0.44 -0.86 -0.83 1.06 0.06 0.91 -0.13 0.19 -0.22 -0.3 -1.35 -0.1 0.7 0.25 0.86 0.68
-1.48 -0.38 0.02 0.27 0.26 -0.07 0.23 0.22 -0.22 -0.22 -0.36 -0.49 -1.8 0.75 0.92 0.68 -0.49 0.01 -0.33 -0.38 -4.13 0.47 -0.14 -0.98 0.84 0.65
1.06 0.11 -0.83 -0.84 -1.25 -1.02 0.0 0.4 -0.77 -0.41 -0.18 -0.13 1.05 1.33 0.0 0.92 -0.59 -0.43 -1.28 -2.05 -3.14 -0.43 -2.27 -1.2 1.76 -0.11
-1.11 -1.09 -0.8 -0.21 -0.12 -0.43 -0.02 -0.04 0.09 0.26 0.39 0.55 -0.46 0.87 -0.08 0.6 -0.18 -0.58 -0.49 -0.95 -1.04 0.55 0.27 0.28 0.61 0.34
0.15 -0.38 -0.84 -0.53 -1.14 -1.83 -0.78 -0.4 -0.67 -0.15 0.15 -0.03 0.33 1.81 0.12 0.58 0.06 -0.24 -0.44 -0.56 -1.16 -0.0 0.68 0.07 0.55 -0.05
0.12 -0.29 -0.49 -0.36 -0.14 -0.1 0.24 0.28 -0.04 0.04 0.08 -0.09 0.11 0.77 -0.11 0.58 0.13 -0.11 -0.44 -0.42 -2.56 -0.06 -0.12 0.02 0.62 0.1
-0.63 -0.84 -0.46 -0.24 -0.41 -0.81 -0.28 -0.36 -0.5 -0.2 -0.23 -0.23 -0.71 1.13 0.24 0.94 0.05 0.24 -0.06 -0.22 -1.25 0.52 0.31 0.33 0.51 0.39
0.44 -0.27 -0.4 -0.32 -0.41 -0.72 -0.15 0.09 -0.02 0.26 0.29 0.3 0.58 0.94 -0.09 0.3 -0.29 -0.05 -0.51 -0.39 -1.8 -0.48 0.35 -0.51 0.43 0.2
0.13 -0.15 -0.14 0.31 0.21 0.02 0.12 0.2 0.02 -0.12 -0.05 -0.04 0.27 0.29 -0.0 0.29 -0.22 0.11 -0.19 -0.96 -3.23 -0.25 -0.35 -0.39 1.0 0.13
0.65 0.38 0.15 0.25 -0.25 -0.81 -0.82 -0.5 -0.86 -1.43 -1.09 -0.65 0.51 1.09 0.67 0.45 -1.48 -0.47 -0.23 -1.11 -3.15 0.6 -2.28 -2.05 1.75 0.82
-0.63 -0.46 -0.24 0.55 0.61 0.28 0.34 0.14 -0.08 -0.25 -0.13 -0.46 -0.73 0.66 -0.13 0.57 0.22 0.07 -0.18 -0.31 -2.36 0.08 -0.78 -0.39 0.77 -0.03
-0.41 -0.38 -0.39 0.45 0.51 0.37 -0.03 -0.14 0.08 0.24 0.34 0.12 -0.51 0.06 -0.5 -0.08 -0.8 -0.52 -0.43 -0.05 -6.75 0.94 -1.78 -1.13 1.21 0.83
-0.25 -1.3 -1.88 -0.84 -1.31 -1.48 0.35 0.12 -0.1 0.33 0.51 0.11 -0.18 1.56 -1.31 -0.41 -0.62 -0.74 -2.25 -1.7 -1.64 -0.74 0.76 0.87 1.78 0.58
-2.32 -2.24 -1.66 -0.63 0.1 -0.13 -0.33 -0.61 -0.18 -0.48 -0.5 -0.52 -2.49 1.72 0.09 1.58 -0.64 -0.53 -0.96 -1.31 -1.97 0.08 0.8 0.3 1.31 0.71
-1.08 -1.19 -1.03 -0.06 0.35 0.19 0.83 0.15 0.38 -0.15 -0.2 -0.84 -1.48 0.98 0.58 0.62 -0.35 -0.76 -1.1 -1.24 -3.04 0.77 0.03 0.05 1.07 0.15
-0.27 -0.39 -0.22 -0.07 -0.4 -0.36 0.07 -0.02 0.06 -0.02 -0.06 -0.26 -0.51 0.7 0.59 0.62 0.29 0.16 0.2 0.02 -1.72 -0.05 0.2 -0.79 0.23 0.22
-1.32 -1.32 -0.64 -0.66 -0.73 -0.16 0.14 0.12 0.37 -0.13 0.06 -0.51 -1.62 0.96 0.76 0.27 -0.0 0.01 -0.41 -0.47 -1.41 0.08 0.26 0.49 0.73 0.97
-0.07 -0.91 -0.93 -0.91 -1.1 -0.52 -0.07 0.25 -0.31 -0.1 -0.32 -0.65 0.26 1.13 0.57 0.61 -1.0 0.34 -0.51 -0.52 -2.19 0.44 -0.57 -0.85 1.54 0.77
0.09 -0.67 -0.43 -0.74 -0.06 -0.63 -0.58 -0.53 -0.52 -0.34 -0.41 -0.01 0.07 0.84 0.15 0.79 0.23 -0.04 -0.29 -0.48 -0.17 0.62 0.14 0.46 0.23 0.41
-0.35 -0.44 -0.41 -0.06 -0.24 -0.25 0.14 0.26 -0.31 -0.15 -0.1 -0.31 0.08 1.24 -0.1 1.17 -0.07 -0.09 -0.44 -0.78 -2.97 -0.99 -0.75 -1.04 1.45 0.09
-0.73 -1.09 -0.44 -0.04 -0.21 -0.44 0.3 0.12 0.17 -0.06 0.05 0.07 -0.88 0.75 -0.23 0.63 -0.4 -0.52 -0.64 -0.8 -2.32 0.43 0.15 0.75 0.85 0.77
-0.04 -0.32 -0.27 0.19 -0.14 -0.69 -0.08 0.3 0.05 -0.12 0.47 0.24 0.05 0.09 -0.27 0.29 -0.05 0.09 -0.44 -0.83 -1.28 0.03 0.14 0.13 0.88 0.12
-1.07 -0.94 -0.39 -0.01 0.15 -0.05 0.35 0.16 -0.07 -0.08 0.12 -0.01 -0.75 0.82 0.09 0.94 -0.07 0.09 -0.34 -0.58 -1.98 0.29 -0.03 -0.16 0.57 0.18
0.22 -0.25 -0.04 0.09 -0.28 -0.53 -0.08 -0.05 0.11 -0.59 -0.57 -0.59 0.28 0.9 0.49 0.62 0.14 -0.0 -0.27 -0.54 -4.44 -0.48 -0.8 -1.08 1.43 0.39
-1.35 -0.41 -0.16 -0.15 -0.07 -0.48 -0.07 -0.08 0.0 0.02 -0.14 -0.07 -1.45 1.06 0.25 0.9 0.11 0.18 0.23 -0.32 -2.48 0.24 -0.33 -0.23 0.42 0.67
-0.29 -0.56 -0.75 -0.41 -0.56 -0.97 -0.52 -0.47 -0.49 0.01 0.34 0.23 -0.05 0.83 -0.27 0.97 -0.52 -0.5 -0.7 -1.28 -1.44 0.86 0.62 0.69 0.73 0.52
-0.3 -0.6 -0.49 -0.42 -0.8 -0.72 0.07 0.34 0.29 0.5 0.47 0.4 -0.03 0.98 -0.51 0.42 -0.1 -0.03 -0.34 -0.24 -1.83 -0.54 0.27 -0.16 0.54 0.22
-1.27 -0.43 0.1 0.37 0.49 0.1 0.34 0.2 -0.14 -0.16 -0.41 -0.69 -1.24 0.66 0.19 0.57 0.03 0.1 -0.17 -0.09 -4.0 0.88 -0.79 -0.92 0.8 0.18
-1.69 -1.01 -0.66 0.25 0.19 -0.45 -0.27 -0.18 -0.37 -0.38 -0.11 -0.35 -1.91 1.42 0.66 0.71 -0.34 -0.33 -0.6 -1.13 -1.91 0.7 -0.41 -0.4 1.3 0.86
-0.0 -1.12 -1.01 -0.74 -0.35 0.3 0.78 0.53 0.03 -0.09 -0.49 -1.13 -0.21 1.49 0.6 1.1 -0.34 -0.55 -0.81 -0.66 -4.89 -0.71 -0.41 -1.12 0.96 0.4
-0.65 -0.12 0.07 0.12 0.1 -0.44 0.25 0.4 0.42 0.3 0.25 0.28 -0.61 0.63 -0.68 0.14 -0.19 0.03 -0.08 -0.37 -2.43 -0.52 0.18 -0.46 0.44 0.45
0.3 -0.33 -0.35 0.13 0.04 -0.27 0.27 0.41 0.05 0.18 0.34 0.08 0.29 0.69 -0.43 0.63 -0.33 -0.53 -0.46 -0.69 -3.94 -0.21 -0.79 -0.99 1.15 0.03
0.3 -0.24 -0.23 -0.19 -0.53 -0.8 0.04 0.22 0.11 0.17 0.24 0.18 0.51 0.63 -0.05 0.34 -0.26 0.05 -0.43 -0.39 -0.8 -0.03 -0.27 -0.11 0.18 0.25
0.43 -1.18 -1.58 -1.29 -1.83 -1.72 -0.83 -0.31 -0.23 -0.04 0.36 -0.15 0.36 1.7 0.51 -0.7 -1.16 -0.63 -0.54 -1.53 -0.91 0.6 1.04 0.77 0.8 0.33
-0.19 -0.9 -0.81 -0.7 -0.36 -0.19 0.32 0.51 0.2 -0.02 0.17 -0.6 -0.37 1.39 0.27 0.73 -0.77 -0.39 -0.69 -0.42 -3.46 -0.18 0.26 -0.05 0.69 0.53
-0.48 -0.45 -0.6 0.31 0.38 0.0 0.23 -0.1 0.12 0.16 0.54 0.44 -0.7 0.23 -0.39 0.71 -0.45 -0.71 -0.88 -0.11 -7.76 0.61 -1.83 -1.74 1.19 0.89
0.3 -0.28 -0.31 -0.26 -0.34 -0.7 -0.15 0.04 0.0 0.21 0.39 0.43 0.6 0.53 -0.37 0.45 -0.45 -0.02 -0.6 -0.65 -1.06 0.09 0.53 -0.16 0.28 -0.09
-0.72 -0.26 -0.24 -0.23 0.09 0.47 0.59 0.34 0.38 0.14 -0.31 -0.81 -0.92 1.02 0.31 0.42 0.19 0.29 -0.17 0.01 -4.37 -0.35 -0.51 -1.1 0.55 -0.01
-3.27 -3.25 -1.77 -1.53 -0.95 -0.5 0.44 0.55 -0.67 -0.5 -0.61 -0.98 -1.32 1.68 0.78 1.07 0.47 0.18 -0.41 -0.7 -5.13 0.61 -0.66 -2.01 1.39 1.16
-0.36 -0.82 -0.76 0.19 -0.45 -0.87 -0.24 0.22 -0.17 0.05 0.34 0.29 -0.08 0.32 -0.3 -0.18 -0.53 -0.25 -0.6 -0.25 -1.11 0.91 -0.79 0.52 1.22 0.68
0.43 0.24 -0.12 -0.3 -0.65 -1.17 -1.03 -0.6 -0.97 -0.48 -0.16 0.03 0.23 0.54 0.34 0.61 0.23 -0.28 -0.04 -0.34 -1.17 0.39 -0.97 -0.23 1.46 0.4
0.36 -0.6 -0.44 -1.08 -0.45 -0.12 0.2 0.41 0.31 -0.1 0.49 0.31 0.35 1.48 -0.09 0.28 -0.48 -0.27 -0.53 -1.79 -2.57 -1.48 0.25 -0.85 0.86 0.09
-2.73 -1.11 -0.61 -0.02 0.2 0.79 0.37 -0.09 -0.7 -0.83 -1.1 -1.27 -2.31 1.14 -0.83 1.03 -0.69 0.14 -0.76 -0.16 -0.4 -0.66 1.01 0.78 0.78 0.59
-3.25 -4.0 -3.78 -2.38 -0.77 0.35 1.01 0.38 0.81 0.11 -0.72 -1.61 -2.93 1.46 0.79 1.25 0.57 1.18 0.07 0.17 -6.25 -1.86 -2.92 -1.54 0.72 0.38
-0.11 -0.81 -0.61 -0.3 -0.25 0.02 0.55 0.38 0.49 0.13 -0.1 -0.23 -0.32 0.57 0.17 0.59 0.1 0.09 -0.14 -0.3 -1.56 -0.29 0.2 -0.29 0.26 0.05
-2.5 -1.59 -0.71 -0.42 -0.83 -0.86 -0.54 -0.29 -0.05 0.0 0.2 -0.16 -1.99 0.89 -0.07 0.72 0.21 0.01 -0.04 -0.37 -2.74 0.14 1.16 0.72 1.15 0.62
-0.92 -0.3 -0.05 0.46 0.33 0.39 0.32 0.12 -0.01 -0.12 -0.3 -0.6 -0.85 0.17 -0.91 0.04 -0.99 0.09 -0.83 -0.45 -4.77 1.11 -0.52 -1.12 1.42 0.92
-0.59 -0.45 -1.53 -0.96 -0.53 0.41 0.51 0.01 -0.21 -1.68 -2.27 -2.4 -0.55 0.84 1.53 1.17 0.04 -0.48 0.0 -0.14 -2.89 -0.1 0.62 -1.97 1.25 0.3
-0.33 -0.84 -1.03 -0.85 -0.53 -0.02 0.21 -0.02 -0.39 -1.07 -1.3 -1.67 -0.33 0.86 1.51 0.99 0.43 0.32 0.18 -0.09 -2.72 -0.07 -0.21 -1.07 1.08 0.18
-0.65 -0.63 -0.8 -0.28 -0.41 -0.7 -0.74 -0.26 -0.41 0.06 0.1 -0.09 -0.19 1.05 0.1 0.34 -0.43 0.17 -0.03 -0.72 0.14 0.5 0.2 0.81 0.34 0.38
0.18 -0.54 -0.37 -0.04 -0.0 0.31 0.17 0.16 -0.46 -0.25 -0.16 -0.18 0.28 0.87 -0.57 0.67 -0.77 0.37 -0.33 -0.23 -1.7 -0.0 -0.0 -0.52 0.42 0.53
-1.45 -1.21 -0.72 -0.53 -0.55 -0.85 -0.08 0.17 0.2 0.2 0.41 0.44 -0.99 1.81 -0.32 0.83 -0.62 -0.49 -0.37 -1.04 -0.41 -0.61 0.27 -0.52 0.71 0.53
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-0.46 -1.31 -1.1 -0.27 -0.08 -0.46 -0.07 -0.23 -0.34 0.07 0.37 0.22 -0.16 0.95 -0.23 0.58 -0.58 -0.13 -0.56 -0.89 -0.97 0.18 0.0 0.74 1.07 0.5
0.26 -0.79 -0.61 -0.21 -0.74 -0.51 0.04 -0.0 -0.14 -0.3 -0.07 -0.74 -0.53 0.6 0.5 0.26 -0.54 -0.11 -0.02 -0.85 -1.73 0.63 0.17 0.58 1.06 0.65
0.34 -0.39 -0.34 -0.06 -0.23 -0.67 -0.19 -0.04 -0.33 -0.17 0.02 0.32 0.41 0.58 -0.35 0.22 -0.22 0.41 -0.3 -0.2 -1.23 0.16 -0.12 0.22 0.5 0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.