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Heatmap: Cluster_161 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.47 0.16 -0.07 0.14 0.11 -0.45 0.13 0.15 -0.37 -0.24 -0.13 0.07 0.74 0.61 -0.74 0.33 -0.4 -0.05 -0.33 -0.56 -1.58 -0.66 0.99 -0.35 0.11 -0.37
-0.18 -0.09 -0.23 -0.05 0.04 -0.16 0.01 0.37 0.62 -0.85 -0.02 -0.35 -0.24 0.6 0.44 0.25 -0.91 0.28 0.04 -0.97 -0.93 -0.68 -0.06 -1.35 1.21 0.35
0.33 -0.3 0.06 0.1 -0.59 -0.63 -0.25 0.04 -0.41 -0.41 0.02 0.16 0.66 0.49 -0.65 0.43 -0.68 -0.22 -0.6 -0.51 0.03 -0.09 0.46 0.39 -0.07 0.67
-0.45 -0.97 -0.66 -0.47 -0.3 -0.36 -0.06 -0.19 -0.95 -0.8 -0.97 -1.17 -0.31 1.31 -0.2 2.18 -0.32 -0.53 -0.92 -0.66 -0.03 0.06 -0.41 -0.23 0.43 0.68
0.5 0.0 0.1 0.35 0.08 -0.43 -0.03 0.04 -0.11 0.19 0.35 0.3 0.23 -0.4 -0.77 0.52 -0.4 -0.29 -0.32 -0.22 -3.15 -0.49 -0.25 0.0 0.65 0.52
0.58 0.16 -0.16 0.56 0.02 -0.78 -0.12 0.11 -0.27 0.06 0.63 0.15 0.35 -0.73 -1.62 0.43 -0.49 -0.4 -0.71 -0.52 -3.17 0.11 -0.68 0.28 0.93 0.7
-0.95 0.35 0.94 0.68 -0.58 -1.37 -1.19 -0.66 -0.75 -0.17 0.17 0.78 -0.44 0.65 -0.09 0.61 -0.19 0.06 -0.86 -0.22 -1.68 -0.61 -0.32 0.08 0.52 0.9
0.4 -0.49 -0.05 0.14 0.27 0.35 0.5 0.46 0.08 -0.43 -0.52 -0.8 0.14 0.22 -0.11 0.51 -0.09 -0.13 0.07 -0.03 -2.11 -0.37 -0.44 -0.79 0.57 0.34
0.58 -0.36 0.56 0.09 -0.17 -0.26 -0.4 -0.41 -0.82 -0.62 -0.88 -0.6 0.76 0.68 -0.2 0.49 -0.46 0.26 0.09 -0.53 -3.64 -1.61 -0.02 0.08 0.81 1.05
0.72 0.12 0.43 0.18 0.14 0.36 -0.32 -0.11 -0.72 -0.62 -0.56 -0.81 0.42 0.88 -0.04 0.65 -0.69 -0.04 0.53 -0.27 -3.64 -1.56 -0.79 -0.54 0.32 0.72
0.65 0.07 0.2 0.1 -0.27 -0.52 -0.53 -0.28 -1.01 -1.36 -0.96 -0.75 0.59 0.95 0.04 0.52 -0.68 0.36 0.35 -0.19 -3.85 -0.6 -1.23 -1.66 1.53 0.86
0.34 -0.06 -0.06 0.01 -0.02 -0.25 0.0 0.04 0.07 -0.19 0.06 -0.23 0.38 -0.05 0.15 0.19 -0.35 0.11 0.1 -0.11 -4.06 0.5 -0.49 -0.27 0.57 0.32
-1.08 0.81 0.7 0.21 -0.13 -0.63 -1.14 -1.52 -1.63 -1.01 -0.5 -0.37 -1.33 0.88 -0.5 0.48 -0.08 0.03 -0.3 -0.52 -1.65 0.81 0.04 0.67 0.88 0.98
0.47 -0.67 -0.64 -0.93 -0.45 -0.28 0.41 0.42 -0.05 0.09 -0.08 -0.07 0.38 1.29 0.45 1.06 0.07 -0.06 -0.23 0.03 -5.92 -2.33 -1.72 -1.98 0.5 0.51
0.54 -1.0 -1.3 -1.21 -0.86 -0.28 0.53 0.47 0.47 0.58 0.46 0.16 0.48 1.67 -0.08 0.64 0.18 0.43 0.32 0.15 -6.91 -4.38 -4.86 -3.99 -0.1 -0.67
0.44 -0.31 -0.62 -0.28 -0.14 -0.13 0.57 0.6 0.25 0.23 0.37 0.12 0.68 0.58 0.01 0.01 -0.84 -0.49 -1.0 -0.66 -4.02 -0.65 -0.34 -1.15 1.15 0.18
0.35 -0.14 0.14 0.15 0.22 0.34 0.51 0.55 0.36 0.01 -0.0 0.03 0.37 0.36 -0.38 0.09 -0.55 -0.27 -0.58 -0.39 -1.65 -2.06 0.07 -0.76 0.33 0.24
0.52 0.23 0.57 0.72 0.04 -0.9 -0.51 -0.13 -1.39 -0.68 -0.17 0.41 0.69 1.01 -0.01 0.61 -0.58 -1.11 -1.51 -0.91 -0.9 -0.59 -1.18 -0.64 0.87 0.67
0.44 0.07 0.44 0.69 0.43 0.48 0.63 1.01 -0.92 -1.2 -1.35 -1.6 0.38 0.49 -1.11 0.78 -0.23 -0.01 -0.24 -0.26 -5.33 -0.88 -3.9 -3.26 1.03 0.54
0.05 -0.14 -0.51 -0.41 -0.7 -1.02 -0.64 -0.29 -0.09 0.29 0.38 0.15 -0.02 0.94 -0.38 0.62 -0.48 0.31 0.21 -0.28 -0.34 -0.45 -0.41 -0.26 0.51 0.82
0.62 0.08 -0.01 -0.09 -0.23 -0.53 -0.09 -0.0 -0.49 -0.71 -0.59 -0.41 0.86 0.8 1.12 -0.06 -0.69 -0.32 -0.42 -0.91 -2.59 -0.59 -0.11 -1.3 1.16 0.56
0.6 -0.51 -0.74 -0.82 -0.83 -0.49 0.14 0.28 0.13 0.14 -0.0 -0.14 0.5 1.38 0.06 0.7 -0.16 0.33 0.09 -0.15 -3.43 -1.14 -0.44 -0.43 0.14 -0.0
-0.09 -0.05 0.15 0.28 0.22 -0.27 -0.19 -0.22 -0.24 -0.04 0.02 0.13 -0.16 0.71 -0.16 0.66 -0.02 -0.11 -0.6 -0.16 -0.63 -0.59 -0.04 0.05 0.05 0.34
-0.43 0.23 0.06 0.46 0.24 -0.08 0.58 0.69 0.12 0.19 0.26 -0.1 -0.98 0.02 0.21 0.6 -0.27 0.06 -0.03 -0.07 -7.81 -2.56 -1.56 -1.39 0.85 0.47
0.55 -0.02 0.16 0.21 -0.21 -0.27 0.41 0.61 -0.17 -0.2 -0.16 -0.36 0.48 0.75 -0.45 0.38 -0.35 -0.23 -0.4 -0.19 -3.37 -0.5 -0.76 -0.54 0.54 0.45
0.31 0.07 0.13 0.04 0.07 -0.11 -0.16 -0.22 -0.45 -0.15 -0.1 0.04 0.4 0.65 0.05 0.47 0.06 -0.14 0.1 -0.05 -3.37 -0.66 0.42 0.11 -0.59 0.21
0.6 0.25 0.2 0.05 0.43 0.23 -0.0 0.07 -0.02 0.0 0.25 0.25 0.49 0.41 -0.22 0.14 -0.39 -0.69 -0.53 -0.59 -3.14 -0.92 0.5 -0.45 -0.27 0.15
-0.41 -0.79 -0.18 -0.19 -0.7 -0.84 0.25 0.33 -0.59 -0.36 -0.3 -0.54 -0.1 1.07 -0.72 1.89 -1.23 -0.59 -1.65 -1.02 -0.07 0.3 -1.09 -1.05 1.04 0.94
0.28 -0.42 -0.49 -0.18 -0.02 0.15 0.4 0.1 0.18 -0.18 -0.05 -0.45 0.18 0.57 0.39 0.19 -0.53 -0.29 0.18 -0.27 -2.95 0.55 -0.66 -0.22 0.39 0.38
0.37 -0.05 0.09 0.12 0.07 -0.01 0.07 0.07 -0.39 -0.35 -0.41 -0.38 0.56 0.44 0.29 0.38 -0.12 0.16 -0.19 -0.46 -1.33 -0.11 -0.4 -0.47 0.37 0.36
-1.23 -0.43 0.29 0.18 -0.74 -1.04 -0.11 0.13 -0.04 0.18 0.74 0.85 -0.77 0.46 -0.22 -0.09 -0.25 -0.59 -0.37 -0.68 -1.17 0.05 -0.16 0.28 0.88 0.76
0.69 0.16 0.03 0.15 0.05 0.0 0.22 0.11 -0.44 -0.36 -0.46 -0.47 0.65 0.43 -0.21 0.09 -0.27 -0.25 0.04 -0.38 -1.84 -1.22 0.17 -0.56 0.78 0.44
-0.33 -0.26 0.11 0.59 0.44 0.28 0.57 0.66 0.45 0.14 0.28 0.02 -0.28 0.39 0.25 0.02 -0.67 -0.45 -0.76 -0.59 -4.53 -0.39 -1.01 -1.0 0.3 0.56
0.22 -0.51 -0.03 0.56 -0.01 -0.56 0.43 0.88 0.3 0.25 0.13 -0.07 -0.27 0.51 -0.77 0.41 -0.34 0.31 -0.49 -0.33 -2.15 -1.73 -0.42 -0.68 0.5 0.41
-0.2 -0.75 -1.09 0.11 0.32 -0.79 0.25 0.73 0.51 0.3 0.69 0.23 -0.01 0.49 -0.92 0.25 -0.87 -0.88 -0.72 -0.74 -4.54 -1.74 0.51 0.08 1.37 0.05
-0.89 -0.68 -0.47 -0.22 -0.16 -0.07 -0.03 0.08 0.01 -0.02 -0.08 -0.59 -1.92 0.7 0.48 1.31 0.09 0.17 0.39 0.06 -1.97 -0.49 -0.14 -0.82 0.92 0.18
0.32 0.44 0.56 0.59 0.25 -0.23 -0.1 0.19 0.1 0.21 0.28 0.13 0.24 -0.12 -0.63 -0.01 -0.5 -0.2 -0.18 -0.5 -2.45 -0.94 -0.9 -0.68 0.91 0.15
0.27 -0.08 -0.19 0.43 0.18 0.01 -0.01 0.12 -0.1 0.22 0.52 0.17 -0.02 -0.29 -0.38 0.33 -0.69 0.0 0.03 -0.45 -2.85 -0.67 -0.37 0.43 0.67 0.08
0.55 0.09 -0.05 -0.2 -0.09 0.28 0.64 0.42 -0.18 -0.42 -0.59 -0.67 0.45 0.93 -0.69 1.02 -0.23 -0.38 -0.43 -0.24 -2.85 -1.86 -2.2 -1.89 1.3 0.21
0.76 0.27 0.31 0.3 -0.07 -0.35 0.04 0.04 -0.65 -0.65 -0.81 -0.68 0.69 0.06 0.08 -0.3 -0.1 0.25 0.09 -0.19 -2.78 -1.3 0.53 -0.2 0.43 0.65
-0.23 -0.25 0.15 0.36 0.3 0.14 0.26 0.25 0.28 0.05 0.19 0.08 -0.02 0.4 0.15 0.58 -0.79 0.07 0.03 -0.2 -2.05 -1.48 -0.34 -0.72 -0.13 0.5
-0.07 -0.45 -0.08 0.05 0.06 -0.09 -0.01 -0.17 -0.21 -0.08 -0.12 -0.36 -0.01 0.6 0.17 1.14 -0.13 -0.14 -0.53 -0.27 -1.39 0.16 -0.35 -0.53 0.47 0.52
0.44 0.06 0.26 0.12 -0.33 -0.34 -0.11 0.06 -0.18 -0.35 -0.07 -0.06 0.26 0.41 0.33 0.88 -0.39 -0.0 0.02 -0.45 -2.43 -1.78 0.91 -0.6 -0.09 0.11
-0.36 -0.5 -0.12 0.31 -0.74 -1.31 -0.7 -0.13 -0.49 -0.43 0.01 0.24 0.15 1.16 -2.15 0.47 -0.87 -0.25 -0.14 -0.07 0.18 -0.69 0.45 -0.36 0.9 1.14
0.91 0.03 -0.13 0.48 -0.5 -1.79 -0.85 -0.13 -1.18 -1.17 -0.69 -0.95 0.84 1.02 -0.96 1.78 -1.18 -1.39 -2.08 -1.63 -3.13 0.13 -1.51 -1.56 1.61 1.14
0.05 -0.75 -0.35 -0.11 -0.02 0.33 0.4 0.68 0.45 0.04 -0.0 -0.2 -0.29 0.63 -0.67 0.73 -0.43 -0.27 -0.28 -0.17 -2.4 -1.33 0.14 0.04 0.35 0.38
-0.13 -0.84 -0.64 -0.16 -0.27 0.09 0.53 0.41 0.31 0.13 -0.14 -0.28 -0.5 0.92 -0.76 0.89 -0.44 -0.02 -0.14 0.05 -2.75 -1.24 0.31 0.32 0.1 0.49
0.65 -0.59 -0.39 0.47 0.13 -0.24 1.01 1.11 0.31 -0.35 -0.91 -1.37 0.76 0.34 -0.57 0.34 -0.38 -0.05 -0.49 -0.62 -3.01 -1.0 -3.03 -2.28 1.18 0.39
0.45 -0.15 -0.03 0.38 -0.08 -0.31 0.3 0.63 0.34 0.27 -0.02 0.03 0.48 -0.04 -0.76 0.27 -0.77 -0.11 -0.59 -0.19 -0.67 -0.44 -0.57 -0.67 0.25 0.45
0.07 -0.2 -0.36 -0.29 -0.28 -0.2 -0.39 -0.5 -0.62 -0.4 -0.29 -0.12 -0.04 0.35 -0.05 1.43 -0.31 -0.07 -0.17 -0.52 -0.36 0.32 0.2 0.32 0.49 0.11
0.66 0.05 0.31 0.51 0.35 -0.29 0.2 0.53 -0.02 -0.01 0.1 -0.14 0.54 0.07 -0.1 0.21 -0.48 -0.29 -0.38 -0.21 -3.64 -2.13 -0.8 -1.2 0.66 0.52
0.23 0.21 -0.07 0.2 0.46 0.09 -0.42 -0.73 -1.34 -2.49 -2.34 -2.48 -1.34 0.53 -0.35 1.84 -0.86 0.92 0.06 -0.14 -0.95 0.81 0.04 -1.65 0.54 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.