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Heatmap: Cluster_209 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.86 0.15 -0.23 -0.08 0.56 0.62 0.74 0.74 1.34 0.5 0.27 0.09 -1.72 -1.9 -1.03 -1.53 -1.09 0.42 0.14 -0.26 -3.98 -1.87 0.17 0.38 0.22 -0.15
-0.72 -0.65 -0.22 -0.02 0.15 0.22 0.38 0.36 0.52 0.7 0.41 0.02 -0.79 -0.65 -0.27 0.42 -0.29 0.84 0.1 -0.21 -4.39 -0.84 0.15 -0.52 0.29 0.12
-1.17 -0.26 0.34 0.3 0.29 0.24 0.01 -0.02 -0.18 -0.02 -0.07 0.11 -0.3 -0.22 -0.58 -0.43 1.1 -0.52 -0.62 -0.56 -1.29 -0.52 0.86 -0.03 0.58 0.34
-0.4 -0.15 -0.16 0.15 0.1 0.24 0.39 0.23 0.23 0.07 -0.1 -0.18 -0.54 -0.04 -0.01 -0.02 -0.22 0.7 0.25 -0.07 -2.84 -0.81 0.28 -0.23 0.44 0.23
-2.52 -0.01 -0.0 0.31 0.61 0.6 0.77 0.61 0.77 0.63 0.46 -0.01 -3.44 -1.08 -0.66 -1.21 -0.46 0.18 0.06 -0.46 -4.2 -0.93 0.44 0.04 0.56 0.0
-0.13 -0.41 -0.41 -0.09 0.24 0.48 0.55 0.4 0.16 -0.22 -0.35 -0.51 -0.3 -0.28 -0.45 -0.08 -0.81 0.01 -0.28 -0.37 -1.33 -1.01 1.05 0.72 0.47 0.43
-0.63 -0.35 -0.18 0.19 0.19 0.15 0.09 0.13 0.13 0.07 0.23 0.38 -0.77 -0.49 -0.59 -0.59 -0.51 0.14 -0.01 -0.22 -0.3 -1.1 1.24 0.21 0.5 0.04
-0.58 -0.35 -0.58 -0.22 -0.64 -0.68 -0.25 -0.12 0.63 0.62 0.43 0.3 -0.7 -0.29 -1.1 -0.59 -0.59 0.76 -0.31 -0.34 -2.05 0.23 1.07 0.54 0.78 0.17
-1.41 -0.81 -0.33 -0.08 0.2 0.04 0.3 0.51 0.55 0.73 0.65 0.67 -1.73 -0.6 -0.14 -0.1 -0.09 0.3 -0.32 -0.22 -2.77 -1.65 0.29 0.21 0.63 0.22
-1.82 -0.63 -0.35 -0.14 0.21 0.17 0.21 -0.04 0.26 0.04 0.19 0.2 -1.45 0.07 0.07 -0.04 -0.15 0.06 0.12 -0.41 -0.77 0.06 0.72 0.51 0.41 0.26
-0.76 -0.18 -0.02 0.26 0.23 0.21 -0.01 0.01 -0.27 0.14 0.42 0.54 -0.58 -1.11 -0.15 -1.35 -0.47 0.25 -0.1 -0.11 -3.57 0.26 0.43 0.58 0.73 0.4
-1.09 -0.66 -0.17 0.04 -0.13 -0.42 0.12 0.25 0.26 0.36 0.58 0.14 -1.98 -0.16 -0.24 -0.18 -0.22 0.18 0.22 -0.12 -3.3 -0.16 0.8 0.45 0.47 0.61
-1.93 -0.53 -0.6 -0.23 -0.3 -0.04 0.18 0.27 0.62 0.52 0.33 0.1 -2.55 -0.57 -0.55 -0.4 0.19 0.26 0.1 -0.08 -1.36 -3.03 1.02 0.52 0.87 0.73
-1.34 -0.67 -0.51 -0.08 0.12 -0.09 0.29 0.45 0.62 0.27 0.39 0.17 -1.16 -0.56 -0.53 -0.88 -0.57 0.48 0.12 -0.26 -2.2 -1.09 1.02 -0.13 1.14 0.4
-1.91 -1.53 -0.23 -0.14 0.26 0.31 0.48 0.24 0.35 0.37 0.13 -0.13 -1.49 -0.11 -0.75 -0.2 -0.32 0.17 -0.07 -0.22 -0.79 -0.2 0.91 0.3 0.94 0.1
-1.02 -0.2 -0.53 -0.04 0.51 0.12 0.38 0.24 0.51 0.41 0.23 -0.08 -1.33 -0.5 -0.15 -0.32 -0.16 0.22 0.43 0.16 -1.21 -0.48 0.6 0.04 0.05 0.06
-0.45 -0.28 -0.35 -0.2 0.09 -0.09 0.1 0.28 0.01 -0.02 -0.07 -0.09 -0.49 -0.09 0.0 -0.08 -0.16 0.25 0.16 -0.01 -1.88 -0.52 0.57 0.64 0.52 0.45
-1.89 -0.55 -0.32 0.4 0.37 0.05 0.23 0.26 0.36 0.61 1.03 0.79 -2.98 0.22 -0.95 0.2 -0.55 -0.32 -0.62 -1.46 -2.3 -0.52 0.65 -0.13 0.89 -0.09
-0.75 -0.6 -0.31 0.0 0.53 0.71 0.58 0.39 0.34 -0.02 0.13 0.01 -0.72 -0.63 -0.51 -0.04 -0.54 -0.59 -0.4 -0.69 -1.64 -0.92 1.1 -0.0 1.01 0.06
-0.51 -0.17 -0.4 -0.27 -0.4 -0.24 0.06 0.02 0.5 0.23 0.21 0.04 -0.41 0.09 -0.05 -0.19 -0.35 0.57 0.1 -0.54 -1.6 0.22 0.38 0.37 0.65 0.05
-1.36 -1.75 -1.3 -0.55 -0.07 0.36 0.66 0.43 0.57 0.22 0.32 0.09 -1.29 -0.34 -0.14 -0.4 -0.31 -0.11 -0.2 -0.21 -0.62 -0.27 1.1 0.66 0.46 0.23
-1.12 -0.92 -0.08 0.23 0.01 -0.03 -0.18 -0.01 0.04 0.23 0.26 0.41 -0.7 -0.43 -0.38 -0.59 -0.35 0.2 0.08 -0.05 -1.53 -0.25 0.71 0.5 0.66 0.79
-0.61 -0.51 -0.47 -0.04 0.11 0.39 0.51 0.43 0.69 0.33 0.55 0.43 -0.66 -1.06 -0.77 -1.06 -0.08 -0.1 -0.34 -0.55 -3.34 -0.7 0.59 0.05 0.8 0.66
-2.72 -0.04 0.02 0.26 -0.2 0.07 0.14 0.21 0.58 0.54 0.4 0.54 -2.13 -0.19 -0.06 0.19 -0.3 0.11 -0.03 -0.42 -2.51 -2.06 0.25 0.53 0.71 0.32
-1.31 -0.47 -0.49 -0.12 0.14 0.48 0.32 0.38 0.54 0.44 0.52 0.28 -1.01 -0.28 -0.41 -0.43 -0.71 0.09 0.12 -0.17 -0.39 -0.48 0.75 -0.18 0.21 0.11
-1.13 -0.98 -0.77 -0.16 -0.04 0.15 0.16 0.26 0.87 0.7 0.82 0.47 -0.8 -0.89 -2.2 -1.38 -0.65 -1.15 -1.32 -0.96 -1.24 0.09 1.33 0.58 0.91 0.56
-1.6 -0.35 -0.54 0.36 0.64 0.36 0.32 0.66 0.54 0.32 0.51 -0.13 -0.96 -0.84 -0.78 -0.87 -0.86 0.01 -0.09 -0.1 -2.95 -2.27 0.96 0.07 1.02 0.28
-1.23 -0.12 -0.19 0.08 0.34 0.3 0.42 0.55 0.36 0.66 0.71 0.55 -1.35 -0.2 -0.77 -0.2 -0.33 0.36 -0.49 -0.83 -2.7 -0.9 0.24 -0.24 0.72 0.05
-2.6 -1.42 -0.31 0.53 0.23 0.02 0.14 0.26 0.22 0.2 0.3 0.52 -1.99 -0.74 -0.65 -0.81 -0.48 -0.24 -0.15 -0.21 -1.59 -1.03 1.3 0.21 1.16 0.76
-1.69 -0.28 -0.68 -0.13 0.08 0.1 0.8 0.72 0.39 0.59 0.64 0.29 -2.82 -0.72 -0.69 -0.53 -0.73 0.72 0.16 0.24 -5.41 0.21 -0.19 -0.17 0.59 0.21
-1.48 -0.21 0.39 0.07 -0.18 -0.17 -0.31 0.15 0.59 0.37 0.4 0.44 -1.25 0.13 -0.2 0.27 0.07 -0.16 -0.24 0.11 -3.99 -1.17 0.04 0.48 0.12 0.81
-0.34 -0.59 -0.3 0.05 -0.21 -0.77 -0.29 -0.45 -0.17 0.01 0.13 0.17 -0.31 0.11 0.14 -0.37 -0.34 0.52 0.29 -0.44 -1.02 -0.35 0.56 0.17 0.86 0.97
-2.25 -1.41 -1.04 -0.94 -0.33 -0.08 0.18 -0.04 0.27 0.27 0.19 0.12 -2.16 -0.53 -0.83 -0.66 0.01 0.52 0.36 -0.04 -0.58 -0.36 1.27 1.19 0.71 0.43
-2.49 -0.98 -1.16 -0.54 0.09 0.47 0.37 0.52 1.06 0.87 0.82 0.62 -4.06 -1.3 -0.72 -1.57 -0.55 0.17 0.17 -0.4 -0.44 -0.5 0.83 0.3 0.33 -0.02
-1.14 -0.81 -0.5 0.18 0.39 0.14 0.09 -0.05 0.12 0.43 0.44 0.51 -1.62 -0.77 -0.58 -0.66 -0.03 0.23 -0.15 -0.23 -1.7 -1.91 0.99 0.5 0.83 0.7
-0.72 -0.25 -0.13 -0.06 0.03 -0.01 0.21 0.25 0.35 0.53 0.45 0.32 -0.76 -0.72 -0.3 -1.29 -0.29 -0.11 -0.12 0.2 -1.19 -0.62 0.73 0.29 0.54 0.43
-0.71 -0.09 -0.41 -0.16 -0.04 -0.59 -0.07 -0.13 0.37 0.33 0.43 0.44 -0.93 -0.14 -0.03 -0.3 -0.38 0.74 0.33 -0.19 -3.97 -0.08 0.25 0.43 0.73 0.06
-1.56 -0.2 -0.05 0.17 0.23 0.19 0.18 0.16 0.37 0.42 0.51 0.19 -1.18 -1.26 -0.72 -0.63 -0.22 0.27 0.28 0.12 -4.56 -0.38 0.7 0.37 0.88 -0.14
-0.31 -0.2 0.11 0.21 0.26 0.17 0.05 0.08 0.06 0.12 0.11 0.08 -0.15 -0.43 -0.39 -0.36 -0.11 -0.16 -0.44 -0.16 -0.82 -0.34 0.8 0.12 0.37 0.35
-1.49 -0.93 -0.96 -0.34 -0.01 -0.2 0.26 0.4 0.45 0.63 0.71 0.49 -0.95 -0.47 -0.74 -0.54 -0.87 0.6 0.05 -0.14 -1.3 0.43 0.31 0.1 0.84 0.11
-3.46 -0.64 -0.55 0.22 0.22 0.12 0.27 0.54 0.65 0.58 0.8 0.69 -2.87 -1.17 -0.8 -1.04 -0.29 0.19 -0.0 -0.14 -3.88 -0.28 0.72 0.43 0.83 -0.14
-0.77 -0.31 0.1 0.2 0.31 0.02 0.36 0.45 0.47 0.49 0.44 0.3 -0.49 -0.3 -0.19 -0.2 0.03 0.21 -0.06 0.06 -1.56 -0.75 0.02 -0.41 0.12 -0.17
-0.69 -0.53 -0.65 -0.87 -0.85 -0.58 -0.32 -0.17 -0.02 0.19 0.04 0.08 -0.52 -0.41 -0.32 -0.75 -0.43 0.65 0.29 0.19 0.08 0.02 1.34 0.58 0.43 0.5
0.05 -0.07 -0.22 -0.29 -0.37 -0.38 0.18 0.03 0.22 0.28 0.33 -0.05 -0.27 -0.21 -0.14 -0.19 -0.04 -0.0 0.02 -0.02 -1.7 -0.59 0.56 0.54 0.56 0.3
-2.05 -0.08 -0.57 0.07 0.45 0.48 0.14 0.15 1.06 0.65 0.55 0.39 -2.69 -1.54 -1.92 -3.35 -1.18 -0.45 -0.36 -0.24 -1.05 -0.68 1.46 0.18 0.77 0.43
-4.01 -0.36 -0.29 0.36 -0.48 -0.58 0.17 0.63 0.62 0.42 0.74 0.5 -4.62 -0.84 -0.63 -0.83 -0.72 0.18 0.25 -0.05 -5.41 -0.32 0.61 1.12 0.3 0.65
-0.34 -0.76 -0.79 -0.08 -0.07 -0.26 0.14 0.04 0.18 0.51 0.64 0.6 -0.32 -0.37 -0.35 -0.94 -0.48 -0.1 0.19 -0.24 -4.74 0.14 0.67 0.77 0.47 0.27
-2.97 -0.93 -0.12 0.62 0.23 -0.27 0.07 0.31 0.49 0.52 0.42 0.3 -3.32 -0.8 -0.54 -0.4 -0.5 0.35 0.12 -0.12 -4.14 -1.24 0.51 0.66 1.15 0.48
-1.06 -0.35 -0.08 0.49 0.61 -0.0 0.29 0.61 0.49 0.45 1.1 0.12 -1.18 -0.01 -0.99 -0.45 -1.09 0.05 -0.99 -0.84 -1.36 -0.91 0.1 -0.06 0.66 0.42
-0.44 -0.53 -0.63 -0.49 0.09 0.07 0.02 -0.14 0.09 0.43 0.52 0.48 -0.03 0.21 -0.94 -0.18 0.74 -0.33 0.03 -0.5 -2.74 -0.88 0.6 -0.22 0.72 0.57
-0.46 -0.5 -0.63 -0.17 0.2 -0.02 0.2 0.05 0.44 0.42 0.47 0.41 -0.67 -0.22 0.16 -0.19 -0.25 0.47 -0.07 -0.31 -3.72 -0.12 0.34 0.06 0.46 0.24
-4.6 -1.61 -1.09 -0.23 0.25 -0.02 0.4 0.24 0.57 0.63 0.41 0.05 -4.78 -0.59 -1.03 -1.0 -0.32 0.63 0.35 -0.02 -1.49 -0.78 0.95 1.02 0.65 0.55
-2.37 -1.01 -0.63 0.61 0.74 0.13 0.07 0.38 0.85 0.73 0.76 0.35 -2.12 -0.89 -0.96 -1.43 -1.09 -0.16 -0.41 -1.08 -4.11 -0.82 0.64 1.02 0.55 0.76
-2.4 -0.37 -0.47 0.05 0.28 0.27 0.11 0.43 0.42 0.04 0.27 0.15 -3.34 -0.3 -0.44 -0.26 -0.35 0.42 -0.01 -0.67 -1.89 -0.61 0.85 0.5 1.01 0.45
-0.67 -0.05 -0.05 -0.15 0.13 -0.17 0.31 -0.06 0.33 0.4 0.19 -0.39 -1.01 -0.24 -0.41 -0.4 -0.19 0.23 0.24 -0.07 -5.57 -0.63 0.52 0.89 0.37 0.68
-2.49 -0.14 -0.11 0.41 0.54 0.34 0.42 0.55 0.49 0.48 0.53 0.41 -2.65 -0.49 0.2 -0.33 -0.57 -0.12 -0.03 -0.2 -5.69 -0.67 0.24 -0.39 0.62 0.23
-0.76 -0.4 -0.41 0.15 0.23 -0.11 0.41 0.39 0.69 0.74 0.67 0.28 -1.03 -0.14 -0.62 0.1 -0.1 0.3 -0.15 -0.18 -2.29 -0.99 0.21 -0.1 0.21 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.