Heatmap: Cluster_180 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.39 0.35 0.34 0.44 0.51 0.59 0.62 0.6 0.65 0.52 0.53 0.47 0.42 0.53 0.49 0.54 0.42 0.56 0.49 0.41 0.29 1.0 0.94 0.66 0.54 0.51
0.13 0.19 0.18 0.32 0.43 0.4 0.6 0.48 0.6 0.66 0.73 0.57 0.18 0.61 0.33 0.38 0.34 0.37 0.37 0.35 0.08 0.75 1.0 0.59 0.48 0.39
0.01 0.01 0.01 0.04 0.04 0.02 0.04 0.03 0.03 0.04 0.05 0.03 0.03 0.67 0.5 0.5 0.4 0.42 0.34 0.28 0.82 0.87 1.0 0.86 0.61 0.55
0.24 0.27 0.33 0.33 0.34 0.26 0.37 0.25 0.35 0.38 0.39 0.33 0.13 0.84 0.78 0.54 0.67 0.76 0.8 0.55 0.87 0.72 1.0 0.88 0.81 0.78
0.11 0.2 0.17 0.25 0.32 0.23 0.36 0.28 0.43 0.35 0.38 0.32 0.14 0.64 0.37 0.47 0.37 0.49 0.45 0.33 0.08 0.7 1.0 0.69 0.38 0.49
0.17 0.24 0.38 0.44 0.45 0.58 0.67 0.61 0.67 0.45 0.38 0.33 0.21 0.68 0.47 0.72 0.49 0.6 0.48 0.5 0.3 1.0 0.91 0.42 0.7 0.61
0.28 0.38 0.36 0.42 0.44 0.37 0.55 0.55 0.65 0.63 0.68 0.58 0.31 0.61 0.51 0.58 0.41 0.45 0.45 0.35 0.31 0.74 1.0 0.81 0.6 0.54
0.15 0.24 0.3 0.39 0.6 0.7 0.66 0.54 0.66 0.5 0.43 0.38 0.19 1.0 0.68 0.87 0.66 0.74 0.68 0.64 0.39 0.61 0.86 0.75 0.71 0.69
0.3 0.33 0.34 0.38 0.45 0.36 0.42 0.34 0.41 0.53 0.57 0.53 0.32 0.94 0.47 0.82 0.49 0.75 0.6 0.46 0.32 0.85 1.0 0.86 0.58 0.76
0.1 0.22 0.23 0.3 0.29 0.24 0.26 0.27 0.22 0.21 0.21 0.19 0.1 0.42 0.45 0.46 0.38 0.6 0.51 0.3 0.44 0.71 1.0 0.45 0.7 0.46
0.28 0.22 0.19 0.33 0.34 0.25 0.35 0.3 0.34 0.28 0.3 0.27 0.22 0.43 0.51 0.44 0.29 0.58 0.49 0.33 0.79 1.0 0.96 0.88 0.78 0.62
0.06 0.04 0.05 0.08 0.08 0.06 0.06 0.04 0.12 0.09 0.08 0.11 0.08 0.99 0.7 1.0 0.66 0.73 0.55 0.8 0.06 0.14 0.33 0.78 0.89 0.99
0.33 0.25 0.27 0.35 0.4 0.36 0.43 0.45 0.37 0.37 0.38 0.28 0.31 0.66 0.56 0.68 0.51 0.88 0.62 0.48 0.55 0.77 1.0 0.6 0.81 0.66
0.23 0.19 0.19 0.34 0.34 0.3 0.46 0.5 0.56 0.49 0.43 0.27 0.18 0.61 0.43 0.62 0.42 0.71 0.5 0.3 0.61 1.0 0.85 0.69 0.91 0.65
0.23 0.3 0.32 0.43 0.49 0.37 0.53 0.45 0.56 0.4 0.42 0.33 0.2 0.49 0.5 0.47 0.52 0.83 0.83 0.59 0.26 0.9 1.0 0.63 0.55 0.63
0.24 0.29 0.27 0.34 0.48 0.42 0.47 0.51 0.59 0.55 0.55 0.45 0.27 0.61 0.46 0.5 0.37 0.49 0.44 0.33 0.18 0.82 1.0 0.58 0.52 0.47
0.05 0.03 0.12 0.3 0.45 0.52 0.51 0.45 0.81 0.74 0.65 0.47 0.07 0.68 0.52 0.72 0.57 0.66 0.4 0.48 0.38 0.9 1.0 0.86 0.76 0.76
0.24 0.24 0.29 0.33 0.33 0.28 0.42 0.43 0.67 0.61 0.59 0.54 0.27 0.72 0.48 0.67 0.28 0.37 0.27 0.28 0.06 0.63 1.0 0.44 0.43 0.41
0.27 0.31 0.3 0.37 0.39 0.37 0.41 0.37 0.42 0.37 0.4 0.3 0.2 0.34 0.49 0.45 0.41 0.59 0.56 0.4 0.21 0.94 1.0 0.43 0.39 0.35
0.14 0.06 0.07 0.04 0.03 0.06 0.18 0.26 0.32 0.27 0.29 0.2 0.25 0.35 0.36 0.25 0.5 0.78 0.37 0.17 0.42 0.16 1.0 0.91 0.98 0.34
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.5 0.33 0.41 0.36 0.74 0.59 0.46 0.5 0.51 1.0 0.51 0.77 0.62
0.2 0.3 0.28 0.31 0.41 0.38 0.47 0.4 0.43 0.39 0.38 0.39 0.16 0.59 0.51 0.57 0.46 0.59 0.51 0.36 0.72 1.0 0.97 0.64 0.72 0.56
0.27 0.35 0.29 0.31 0.38 0.44 0.43 0.32 0.46 0.52 0.48 0.48 0.21 0.45 0.48 0.79 0.47 0.55 0.52 0.48 0.11 0.63 1.0 0.8 0.41 0.41
0.09 0.07 0.08 0.09 0.15 0.13 0.16 0.13 0.18 0.17 0.19 0.19 0.1 0.44 0.3 0.52 0.32 0.49 0.41 0.57 0.66 0.96 0.96 1.0 0.5 0.64
0.32 0.45 0.47 0.51 0.52 0.48 0.56 0.56 0.58 0.58 0.65 0.6 0.35 0.59 0.59 0.64 0.48 0.77 0.64 0.47 0.45 0.97 1.0 0.64 0.6 0.7
0.05 0.33 0.48 0.57 0.5 0.46 0.57 0.53 0.54 0.55 0.57 0.46 0.07 0.73 0.79 0.75 0.64 0.72 0.7 0.5 0.49 0.94 1.0 0.7 0.73 0.63
0.08 0.1 0.16 0.31 0.36 0.39 0.31 0.24 0.14 0.14 0.18 0.18 0.13 0.57 0.31 0.59 0.36 0.41 0.39 0.35 0.22 0.41 1.0 0.28 0.2 0.48
0.15 0.15 0.19 0.33 0.37 0.33 0.47 0.4 0.49 0.53 0.55 0.46 0.17 0.69 0.45 0.69 0.42 0.73 0.4 0.38 0.8 0.88 1.0 0.75 0.74 0.64
0.06 0.06 0.07 0.14 0.18 0.26 0.16 0.14 0.26 0.25 0.2 0.13 0.06 0.43 0.49 0.48 0.23 0.51 0.42 0.33 0.61 1.0 0.7 0.47 0.4 0.29
0.24 0.23 0.22 0.24 0.26 0.29 0.22 0.21 0.29 0.32 0.33 0.36 0.28 0.65 0.6 0.82 0.52 0.55 0.56 0.52 0.26 0.62 1.0 0.64 0.58 0.68
0.05 0.03 0.19 0.39 0.56 0.67 0.6 0.45 0.82 0.7 0.61 0.55 0.05 0.6 0.74 0.7 0.67 0.68 0.59 0.73 0.34 0.92 1.0 0.71 0.59 0.81
0.05 0.16 0.27 0.41 0.47 0.41 0.48 0.46 0.52 0.53 0.48 0.4 0.06 0.48 0.69 0.81 0.52 0.7 0.46 0.39 0.28 0.91 1.0 0.62 0.83 0.53
0.72 0.59 0.53 0.54 0.62 0.6 0.59 0.6 0.48 0.6 0.52 0.53 0.66 0.57 0.52 0.71 0.56 0.93 0.64 0.44 0.2 0.32 1.0 0.58 0.96 0.47
0.03 0.19 0.3 0.38 0.36 0.48 0.5 0.42 0.38 0.38 0.33 0.3 0.04 0.84 0.79 0.86 0.58 0.74 0.67 0.47 0.42 0.74 1.0 0.87 0.55 0.57
0.04 0.1 0.12 0.14 0.16 0.18 0.22 0.21 0.3 0.31 0.27 0.22 0.04 0.28 0.34 0.36 0.24 0.42 0.34 0.29 0.41 1.0 0.55 0.7 0.27 0.29
0.09 0.07 0.14 0.14 0.18 0.3 0.21 0.19 0.22 0.24 0.18 0.18 0.06 0.42 0.37 0.99 0.29 0.34 0.51 0.23 0.24 0.61 1.0 0.39 0.48 0.44
0.06 0.02 0.03 0.04 0.07 0.12 0.1 0.07 0.09 0.15 0.17 0.16 0.06 0.9 0.68 1.0 0.49 0.32 0.52 0.46 0.15 0.15 0.33 0.53 0.3 0.45
0.23 0.29 0.37 0.42 0.57 0.65 0.39 0.37 0.34 0.33 0.4 0.44 0.21 0.65 0.46 0.64 0.45 0.42 0.53 0.47 0.34 0.79 1.0 0.52 0.42 0.55
0.26 0.29 0.21 0.25 0.34 0.26 0.35 0.31 0.26 0.28 0.28 0.3 0.27 0.53 0.47 0.48 0.38 0.74 0.44 0.35 0.68 0.97 1.0 0.75 0.8 0.58
0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.91 0.3 1.0 0.91 0.63 0.69 0.86 0.12 0.29 0.02 0.43 0.43 0.58
0.33 0.35 0.35 0.44 0.48 0.37 0.46 0.44 0.44 0.42 0.4 0.33 0.26 0.56 0.61 0.65 0.5 0.7 0.69 0.45 0.37 0.77 1.0 0.61 0.61 0.66
0.12 0.18 0.3 0.36 0.45 0.49 0.56 0.55 0.7 0.61 0.49 0.47 0.17 0.58 0.43 0.66 0.39 0.58 0.38 0.46 0.26 0.89 1.0 0.7 0.67 0.72
0.79 0.5 0.37 0.31 0.37 0.39 0.56 0.65 0.36 0.41 0.4 0.36 0.76 0.65 1.0 0.6 0.63 0.84 0.85 0.44 0.57 0.61 0.97 0.61 0.84 0.76
0.85 0.83 0.6 0.55 0.46 0.43 0.63 0.61 0.76 0.63 0.74 0.55 0.6 0.89 0.69 0.88 0.7 0.86 0.78 0.57 0.22 0.54 1.0 0.75 0.92 0.74
0.14 0.2 0.25 0.27 0.34 0.3 0.26 0.28 0.66 0.59 0.54 0.48 0.2 0.53 0.71 0.68 0.47 0.87 0.56 0.45 0.64 0.86 1.0 0.65 0.65 0.75
0.09 0.09 0.09 0.14 0.22 0.32 0.49 0.42 0.62 0.51 0.41 0.27 0.13 0.5 0.46 0.39 0.27 0.41 0.22 0.23 0.81 0.86 1.0 0.52 0.58 0.5
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.57 0.75 0.43 0.5 0.46 0.44 0.19 0.21 0.82 0.73 0.48 0.67
0.65 0.73 0.6 0.49 0.34 0.27 0.28 0.35 0.33 0.32 0.38 0.47 0.74 0.69 0.66 0.73 0.43 0.57 0.67 0.4 0.5 0.28 1.0 0.6 0.43 0.65
0.2 0.23 0.15 0.03 0.16 0.0 0.07 0.17 0.13 0.09 0.0 0.07 0.32 0.07 0.03 0.13 0.11 0.58 0.13 0.06 0.14 0.28 0.81 0.56 1.0 0.21
0.08 0.13 0.14 0.16 0.2 0.27 0.25 0.22 0.24 0.27 0.26 0.26 0.09 0.85 0.61 1.0 0.57 0.71 0.45 0.46 0.1 0.58 0.79 0.74 0.68 0.68
0.3 0.36 0.4 0.44 0.44 0.38 0.45 0.43 0.49 0.51 0.5 0.44 0.29 0.72 0.56 0.99 0.5 0.65 0.51 0.43 0.38 0.7 1.0 0.71 0.71 0.74
0.17 0.22 0.2 0.32 0.4 0.32 0.35 0.34 0.3 0.35 0.39 0.27 0.13 0.28 0.46 0.39 0.34 0.54 0.58 0.37 0.3 0.72 1.0 0.84 0.41 0.45
0.09 0.14 0.18 0.27 0.34 0.45 0.46 0.4 0.58 0.55 0.52 0.43 0.12 0.56 0.36 0.41 0.35 0.45 0.37 0.3 0.25 0.78 1.0 0.56 0.49 0.6
0.25 0.26 0.31 0.41 0.42 0.33 0.63 0.61 0.76 0.84 0.88 0.74 0.23 0.71 0.58 0.71 0.54 0.63 0.53 0.53 0.26 0.99 1.0 0.78 0.63 0.52
0.71 0.57 0.46 0.48 0.35 0.3 0.33 0.34 0.35 0.4 0.41 0.45 0.75 0.75 0.73 0.98 0.82 0.85 0.84 0.43 0.32 0.47 1.0 0.52 0.55 0.59
0.48 0.37 0.39 0.41 0.33 0.21 0.39 0.37 0.43 0.49 0.48 0.43 0.47 0.74 0.53 1.0 0.51 0.83 0.65 0.45 0.18 0.57 0.72 0.45 0.74 0.67
0.63 0.55 0.49 0.59 0.48 0.36 0.63 0.63 0.59 0.54 0.58 0.61 0.56 0.73 0.53 0.56 0.58 0.91 0.51 0.5 0.11 0.29 0.83 1.0 0.8 0.77
0.03 0.06 0.07 0.16 0.15 0.43 0.36 0.2 0.16 0.15 0.09 0.07 0.0 0.47 0.66 0.83 0.53 0.64 0.74 0.8 0.42 0.81 1.0 0.48 0.62 0.45
0.4 0.51 0.48 0.56 0.66 0.66 0.8 0.71 0.77 0.89 0.77 0.76 0.41 0.9 0.62 0.79 0.58 0.8 0.69 0.55 0.32 0.94 1.0 0.92 0.74 0.7
0.67 0.72 0.29 0.38 0.32 0.31 0.21 0.31 0.3 0.49 0.4 0.59 0.44 0.83 0.44 1.0 0.26 0.66 0.43 0.28 0.07 0.51 0.63 0.4 0.49 0.61
0.4 0.44 0.31 0.29 0.3 0.21 0.29 0.31 0.32 0.38 0.44 0.39 0.3 0.81 0.51 1.0 0.32 0.69 0.45 0.3 0.12 0.52 0.77 0.47 0.61 0.49
0.24 0.33 0.52 0.55 0.72 0.71 0.91 0.7 0.89 0.79 0.59 0.61 0.12 0.78 0.79 1.0 0.7 0.99 0.73 0.74 0.46 0.92 0.92 0.9 0.65 0.7
0.24 0.18 0.17 0.15 0.25 0.19 0.21 0.18 0.25 0.37 0.4 0.39 0.23 0.3 0.31 0.35 0.34 0.43 0.55 0.35 0.48 0.72 0.94 1.0 0.36 0.54
0.38 0.41 0.32 0.33 0.3 0.28 0.43 0.34 0.39 0.41 0.38 0.45 0.46 0.56 0.44 0.5 0.5 1.0 0.62 0.41 0.15 0.48 0.59 0.38 0.81 0.59
0.13 0.1 0.11 0.23 0.3 0.28 0.36 0.34 0.35 0.32 0.26 0.18 0.18 0.84 0.57 0.7 0.51 0.74 0.54 0.55 0.3 0.41 1.0 0.5 0.61 0.71
0.17 0.25 0.2 0.27 0.27 0.27 0.34 0.4 0.42 0.5 0.49 0.46 0.22 0.36 0.23 0.28 0.23 0.44 0.31 0.26 0.2 0.57 1.0 0.66 0.45 0.36
0.16 0.24 0.24 0.33 0.39 0.57 0.43 0.37 0.47 0.35 0.36 0.29 0.15 1.0 0.63 0.92 0.6 0.59 0.57 0.56 0.19 0.39 0.53 0.36 0.42 0.47
0.32 0.38 0.34 0.41 0.42 0.33 0.39 0.4 0.5 0.62 0.55 0.53 0.33 0.64 0.57 0.63 0.45 0.85 0.61 0.44 0.62 1.0 0.81 0.87 0.71 0.9
0.37 0.55 0.54 0.52 0.37 0.27 0.38 0.44 0.37 0.44 0.51 0.48 0.44 0.64 0.47 0.68 0.51 1.0 0.77 0.27 0.09 0.2 0.87 0.28 0.84 0.45
0.19 0.21 0.19 0.24 0.23 0.25 0.23 0.2 0.27 0.28 0.31 0.33 0.19 0.54 0.39 0.4 0.41 0.8 0.54 0.31 0.59 0.79 1.0 0.77 0.57 0.6
0.02 0.08 0.12 0.25 0.43 0.51 0.62 0.45 0.62 0.56 0.49 0.26 0.03 0.67 0.5 0.53 0.42 0.45 0.34 0.25 0.32 0.73 1.0 0.88 0.68 0.51
0.06 0.21 0.17 0.21 0.25 0.2 0.3 0.27 0.36 0.33 0.32 0.3 0.05 0.47 0.53 0.53 0.44 0.38 0.45 0.39 0.2 0.58 1.0 0.57 0.52 0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)