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Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.76 -1.07 -0.49 -0.01 0.35 0.53 0.46 0.49 0.61 0.49 0.45 0.37 -1.63 -0.77 -0.93 -0.99 -0.77 0.23 -0.01 -0.33 0.12 0.46 0.19 -0.34 0.39 0.32
-0.7 -0.25 -0.55 -0.1 0.09 -0.05 0.3 0.21 0.84 0.5 0.6 0.24 -1.01 0.18 -0.72 0.06 -0.58 -0.15 -0.67 -0.8 0.39 0.14 0.54 0.08 -0.31 -0.29
-1.39 0.15 0.39 0.41 0.43 0.34 0.5 0.58 0.35 0.35 0.06 -0.25 -1.85 -1.11 -0.56 -0.74 -0.26 0.4 0.06 0.23 -0.05 -0.13 -0.1 -0.08 -0.01 -0.37
0.71 0.17 -0.12 0.84 0.84 0.45 0.43 0.38 -0.16 -0.47 -0.56 -0.79 0.26 -0.41 -0.4 -0.05 -0.19 -0.21 -0.15 -0.83 -0.68 -0.59 -0.09 -0.49 0.28 -0.32
-0.99 -1.26 -1.01 -0.46 0.19 0.79 0.83 0.69 0.83 0.84 0.34 -0.06 -0.76 -0.53 -0.66 -1.01 -1.04 0.0 -0.76 0.13 0.36 0.16 -0.09 -0.29 0.26 -0.21
-4.27 -2.9 -1.01 0.29 0.87 0.78 0.47 -0.05 0.75 0.62 0.36 0.04 -3.06 -0.9 -1.09 -1.03 -0.91 -0.23 -0.43 -0.35 0.67 0.92 -0.79 0.68 0.41 0.19
-3.04 -2.01 -0.44 0.55 0.12 -0.28 0.28 0.83 0.57 0.55 0.52 -0.14 -3.1 -1.93 -1.47 -1.88 -0.51 0.24 0.35 -0.74 0.28 -0.06 1.23 -1.2 1.34 -0.04
-1.29 -1.17 -2.17 -0.85 -0.17 0.87 0.73 0.22 1.07 0.84 0.76 0.7 -0.65 -0.56 -0.18 -0.66 -1.6 -0.43 -0.22 -0.74 0.78 -0.5 0.49 0.33 -1.06 -0.52
-0.42 -0.11 -0.45 0.31 0.51 0.32 0.58 0.59 0.62 0.31 0.14 -0.19 -1.38 -0.5 -0.87 -0.18 -0.37 0.03 0.07 -0.02 0.09 -1.23 -0.38 -0.85 0.63 0.26
-0.43 -0.38 -0.06 -0.13 0.4 0.6 0.55 0.45 0.54 0.49 0.58 0.78 0.01 -0.8 -0.04 -0.29 -0.39 -0.02 0.09 -0.21 -0.15 -1.13 -0.99 -0.33 -0.38 -1.28
-0.62 -0.73 -0.42 0.1 0.1 0.19 0.61 0.57 0.29 -0.22 -0.48 -0.64 -0.81 -0.73 -0.29 -0.11 -0.4 0.14 0.35 -0.53 1.12 -0.56 0.78 -0.25 -0.09 0.22
0.07 -0.29 -0.42 0.12 0.24 0.39 0.68 0.58 0.53 0.14 0.19 0.1 -0.06 -0.43 -0.33 -0.5 -0.55 0.01 0.01 -0.45 0.07 -0.35 -0.27 -0.23 0.15 -0.53
0.35 0.07 0.11 0.4 0.61 0.63 0.45 0.44 -0.14 -0.23 -0.09 -0.25 0.61 -0.38 -0.9 -0.59 -1.03 -0.79 -0.72 -0.8 0.54 0.03 -0.69 -0.36 0.27 0.16
-2.98 -3.16 -0.93 0.38 0.87 0.78 1.13 0.65 0.51 0.07 0.09 0.02 -2.33 -0.5 -0.9 -0.59 -0.99 -0.35 -0.53 -0.77 1.12 0.39 -1.22 -0.15 0.61 0.09
0.22 0.24 0.36 0.67 0.05 -0.59 -0.42 0.27 -0.21 -0.5 -0.08 -0.47 -0.07 -1.58 -0.96 -1.33 0.3 -0.08 0.17 0.16 0.11 0.81 -0.5 -0.74 1.03 0.13
-1.63 -0.49 -0.25 0.29 0.31 -0.35 0.2 0.55 0.07 0.12 0.2 -0.27 -1.93 -0.69 -0.46 -0.68 -0.56 0.55 0.04 -0.69 1.09 0.34 0.55 -0.19 0.54 -0.1
-1.55 -0.38 -0.07 0.48 0.46 0.28 0.36 0.62 0.42 0.29 0.3 -0.25 -1.65 -0.81 -0.3 -0.76 -0.57 0.16 0.22 -0.58 0.59 0.18 0.34 -0.59 0.34 -0.46
-2.32 -0.69 -0.27 0.28 0.61 0.47 0.61 0.41 0.86 0.5 0.43 0.19 -1.9 -0.35 -0.66 -0.31 -0.92 -0.2 -0.64 -0.94 -0.1 0.26 0.74 0.1 -0.35 -0.09
-0.99 0.14 -0.3 0.89 1.9 1.59 1.1 1.17 -1.64 -0.89 -2.01 -3.02 -1.99 -4.03 -1.6 -2.5 -0.41 0.26 -0.08 0.51 0.93 -4.15 -4.02 -4.83 0.55 -0.49
-1.71 -1.38 -0.52 0.13 0.53 0.18 0.26 0.52 0.84 0.85 0.89 0.48 -1.38 -1.08 -1.1 -2.25 -0.18 0.39 -0.27 -0.73 0.96 -0.95 0.21 -0.99 0.35 -0.15
-1.98 0.03 -0.09 -0.09 -0.45 -0.45 0.2 0.68 1.13 1.09 1.18 0.43 -1.65 -1.43 -1.1 -1.18 -0.54 0.36 0.26 -0.1 -0.78 -0.64 -0.3 -0.03 0.51 -0.8
0.46 0.95 0.54 0.08 -0.62 -0.69 -0.34 0.16 -0.17 -0.86 -0.74 -0.63 0.47 -1.46 -0.3 -0.71 -0.29 0.56 -0.08 -0.2 0.61 0.26 0.12 -0.8 0.87 -0.25
-0.95 -0.14 -0.03 0.11 0.34 0.15 0.46 0.76 0.71 0.83 0.72 0.44 -1.65 -1.45 -0.74 -1.56 -0.69 0.12 0.07 0.07 -0.22 -0.2 -0.44 -0.09 0.27 -0.67
-1.1 -2.17 -0.91 -0.21 -0.2 -0.07 0.42 0.47 0.61 0.44 -0.04 -0.41 -1.42 0.07 -1.58 0.3 -0.78 -0.97 -0.75 -0.44 0.51 -0.45 0.64 0.77 0.39 1.39
-0.77 -0.21 -0.58 0.62 1.54 1.21 0.74 0.76 -1.48 -0.54 -0.74 -1.36 -2.41 -1.49 -1.35 -0.88 -0.2 0.34 0.49 0.31 0.6 -1.88 -1.57 -1.98 1.06 -0.01
- 0.46 0.03 0.05 0.79 1.87 - 1.05 -0.84 -1.01 -0.96 -0.86 0.22 -0.55 -1.05 -1.08 -1.0 0.55 0.93 -1.35 1.65 -0.22 - -0.07 -0.06 -
-0.49 0.14 0.51 0.45 0.1 0.16 0.08 0.35 0.23 0.13 0.03 0.12 -0.73 -0.97 -0.57 -0.94 -0.57 -0.05 -0.35 -0.11 0.13 -1.04 1.04 0.33 -0.21 0.1
-3.59 -3.04 -1.35 0.7 1.61 0.99 0.71 0.54 0.64 0.3 0.34 -0.39 -3.34 0.05 -1.91 -0.09 -3.52 -0.96 -1.36 -1.11 0.03 0.8 0.44 -0.57 0.1 0.22
-3.15 -3.6 -0.85 0.51 1.15 1.09 0.62 0.45 0.22 0.33 0.1 -0.8 -2.99 0.77 -1.36 0.38 -1.81 -0.66 -0.76 -0.71 0.06 0.39 0.17 -0.64 0.63 0.29
-0.63 -0.0 0.05 0.68 0.82 0.66 0.66 0.47 -0.31 -0.31 -0.3 -0.48 -0.58 -0.13 -0.48 -0.61 -0.71 0.17 -0.24 -0.61 0.65 0.05 -0.74 -0.67 0.35 -0.04
-4.21 -2.54 -1.03 0.26 0.8 0.84 0.76 0.32 0.94 0.79 0.57 0.15 -4.46 -0.94 -0.43 -0.49 -0.5 -0.59 -0.37 -0.69 0.56 0.68 0.4 -0.04 -0.6 -0.86
-0.2 -0.28 -0.45 -0.35 0.11 0.2 0.48 0.35 0.43 -0.01 -0.19 -0.61 -0.5 -0.58 -0.19 -0.11 0.04 0.11 0.01 0.28 0.66 -1.38 0.7 -0.1 0.15 -0.2
-0.66 0.11 0.36 0.58 0.35 0.15 0.3 0.49 0.15 -0.07 -0.05 -0.05 -0.79 -0.44 -0.03 -0.15 -0.17 0.06 -0.04 -0.22 -0.08 -0.95 0.37 -0.22 0.12 -0.27
-0.84 0.18 0.34 0.42 0.34 -0.26 0.25 0.35 -0.0 -0.05 -0.17 -0.37 -1.02 -0.03 0.22 0.05 0.27 0.53 0.13 0.18 -0.15 -0.82 0.29 -0.59 -0.25 -0.38
0.12 0.09 0.92 0.65 -0.13 0.93 1.51 1.09 0.67 -2.82 - - - -1.73 -0.82 -1.75 -2.76 0.13 1.09 0.14 1.41 -1.05 -3.39 -2.83 0.54 -1.25
-1.01 -0.45 -0.57 -0.89 -1.02 -0.0 0.5 1.01 1.06 0.97 1.07 0.87 -1.12 -0.88 -0.5 -0.52 -1.13 0.23 0.31 -0.12 -3.27 -0.72 -0.85 0.03 0.49 -0.35
-0.91 0.46 0.78 0.93 0.6 -0.33 0.35 0.45 0.58 0.1 0.32 -0.09 -1.95 -1.48 -1.27 -1.99 -1.71 0.61 0.27 0.17 0.14 -1.69 -0.7 -1.28 0.9 0.03
-1.77 0.06 0.11 0.32 0.52 0.1 0.03 -0.1 0.31 0.1 0.25 0.12 -1.77 -0.42 -0.25 -0.5 -0.21 0.31 0.13 -0.07 -0.47 -0.16 0.54 0.1 0.56 -0.1
-0.49 0.55 0.56 0.57 0.45 0.12 0.01 0.09 -0.08 -0.21 -0.3 -0.42 -0.57 -1.83 -0.65 -1.42 -0.22 0.43 -0.22 0.0 0.47 0.67 -0.47 -0.31 0.69 -0.31
-0.74 -0.2 0.08 0.25 0.58 0.55 0.74 0.81 0.47 0.53 0.53 0.29 -1.01 -1.39 -0.91 -1.18 -1.18 -0.09 -0.19 -0.13 -0.06 -0.84 -0.02 -0.57 0.08 0.2
-2.13 -0.46 -0.61 0.21 1.2 1.2 1.31 1.26 0.47 0.51 0.07 -0.19 -1.69 -2.83 -2.59 -1.63 -0.98 -0.54 -0.04 -0.47 1.01 -4.24 0.68 -0.2 -0.91 -2.95
-0.59 -0.3 -0.19 0.57 0.99 0.37 0.45 0.13 0.1 0.61 0.73 0.51 -0.47 -0.67 -1.53 -0.89 -2.6 -0.58 -1.51 -1.65 -0.37 0.46 -0.28 0.69 0.27 0.28
-1.4 -2.11 -1.44 -0.06 0.15 0.34 0.86 0.86 0.84 0.14 -0.04 -0.03 -1.47 -0.82 -0.86 -0.34 -1.31 -1.05 -0.87 -1.33 0.25 0.86 -0.14 1.07 1.02 0.12
-3.52 -1.3 -0.69 -0.29 0.21 0.74 0.79 0.7 0.82 0.6 0.48 0.43 -2.23 -1.81 -0.65 -1.22 -0.28 0.76 0.38 0.1 1.05 -0.98 -0.21 -0.23 -0.62 -1.12
-4.04 -3.39 -2.12 -0.13 0.93 0.72 0.78 0.36 1.63 1.41 1.05 0.36 -3.48 -2.29 -0.71 -2.44 -0.74 0.29 0.25 0.74 -0.3 -3.39 -0.14 -0.21 -1.57 -1.98
-1.35 -1.45 -0.11 0.09 0.11 0.54 1.03 0.98 0.84 0.07 -0.68 -1.32 -2.02 -0.7 -0.8 -0.44 -0.27 -0.08 -0.11 -0.08 0.8 -1.03 0.69 -0.71 0.34 0.39
-1.7 -2.42 -1.99 -1.15 -0.5 -0.12 0.43 0.08 0.98 0.93 1.02 0.6 -1.43 0.19 0.0 0.3 -0.15 0.01 -0.99 -0.67 0.21 0.74 0.31 0.23 -0.71 -0.47
- - -2.31 1.89 1.9 1.79 -0.65 -2.29 -1.22 -1.4 -0.02 -1.22 -2.42 - - -2.17 -2.34 -2.06 - - 2.18 -0.71 -1.82 1.63 0.95 -0.89
0.67 0.12 -0.31 0.85 0.26 -0.45 0.3 0.45 0.47 0.2 0.46 -0.21 0.22 -1.57 -1.21 -1.26 -0.82 -0.07 -0.19 -1.26 0.19 -1.01 0.01 -0.9 0.88 0.31
-1.23 -0.57 0.17 0.26 0.64 0.25 0.38 0.41 0.59 0.71 0.75 0.45 -0.68 0.28 -0.27 0.4 0.16 -0.16 -0.41 -0.52 -1.18 -0.99 -1.58 -0.54 -0.58 -0.1
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-0.47 -0.06 0.02 0.31 0.51 0.56 0.5 0.38 -0.16 -0.68 -1.11 -1.23 -0.78 -1.22 -1.19 -0.8 0.1 0.18 0.18 0.45 1.04 -1.25 1.1 -0.35 0.39 -0.75
-0.44 -0.29 -0.03 0.26 0.59 0.7 0.68 0.45 0.78 0.55 0.68 0.51 -0.76 -0.07 -0.22 -0.03 -0.29 -0.07 -0.28 -0.57 -0.43 -1.62 -1.33 -0.82 -0.57 -0.7
-1.95 -0.05 -0.61 -0.18 0.74 0.91 0.63 0.21 0.79 0.53 0.8 0.3 -3.23 -1.84 -0.37 -0.93 -0.93 0.42 0.18 -0.47 -0.31 -0.65 -0.78 0.26 0.58 -0.47
-3.19 -4.43 -2.93 -3.72 -0.61 1.47 1.82 0.83 1.46 0.93 0.42 -0.26 -2.02 1.05 -2.23 -1.55 -1.15 -2.38 -1.09 -2.83 0.52 -2.24 0.92 0.25 -1.62 -0.21
-0.31 -0.1 0.31 0.6 1.4 1.26 0.64 0.39 -1.12 0.05 -1.45 -1.96 -1.06 -1.0 -0.62 -1.04 -0.61 0.73 0.27 0.82 -1.53 -2.68 -2.2 -0.94 0.66 0.32
0.66 0.38 -0.7 -0.58 -0.23 -0.37 0.5 0.47 0.44 0.08 0.39 -0.37 -0.11 -1.13 -0.81 -1.26 -0.42 0.11 -0.24 -0.65 -0.03 -0.61 0.46 0.54 0.89 -0.13
-3.21 -1.33 -0.98 -0.16 0.05 0.55 1.46 0.92 0.63 -0.68 -1.36 -1.43 -2.7 -1.7 -0.48 -0.83 -1.04 -0.01 0.44 -0.38 1.68 -3.28 1.23 -1.0 0.55 0.09
-1.28 -1.07 -0.31 0.65 1.07 1.31 1.53 1.39 0.22 -0.46 -1.6 -2.46 -1.95 -1.95 -1.43 0.01 -0.57 -0.67 -0.33 -0.22 1.23 -2.33 -1.56 -2.0 0.49 -0.22
-3.75 -2.31 -0.43 0.35 0.72 0.99 1.58 1.49 0.92 -0.29 -0.91 -1.45 -5.15 -2.48 -1.28 -0.64 -0.32 0.16 -0.11 -0.12 0.98 -2.24 -1.15 -3.05 0.78 0.2
-1.81 -2.04 -0.8 -0.71 0.58 1.07 0.94 0.1 0.94 1.55 0.99 0.9 -0.59 -0.91 -1.69 -0.57 -4.12 -2.13 -2.41 -3.51 1.55 -2.51 -0.28 0.18 -0.63 -0.84
-1.74 -1.82 -3.2 -0.1 -0.39 0.86 0.94 0.34 1.37 1.21 1.04 0.61 -0.59 -2.59 -1.39 -0.97 -3.76 -2.2 -2.45 -3.63 1.86 -1.87 0.28 0.69 -1.2 -0.54
-4.74 -1.34 0.11 0.51 0.53 0.13 0.1 0.47 0.49 0.38 0.37 0.52 -4.29 -1.02 -0.55 -1.25 -0.42 -0.07 -0.05 -0.02 0.73 -0.79 0.02 -0.77 0.81 0.82
-0.42 -0.29 -0.22 -0.17 0.19 0.22 0.23 0.24 0.14 0.36 0.32 0.52 -0.35 -0.37 -0.71 -1.02 -0.44 0.18 -0.01 -0.17 0.43 0.07 -0.35 -0.06 0.09 0.43
-2.52 -2.11 -1.6 -2.42 -0.59 -1.09 0.12 -0.4 0.82 0.29 0.87 0.43 -2.24 -1.68 -1.5 -0.36 -1.53 -0.56 -0.95 -1.57 1.53 -0.6 1.05 1.59 0.22 1.4
0.36 0.28 -0.19 0.58 0.52 0.33 0.29 0.3 -0.25 -0.29 -0.29 -0.17 0.11 -1.18 -0.78 -0.64 -0.36 0.52 -0.05 -0.25 0.19 -0.7 -0.14 -0.39 0.46 0.08
-1.43 0.03 0.42 0.92 0.77 0.11 0.19 0.04 0.0 -0.2 -0.06 -0.29 -2.48 -1.03 -0.69 -0.89 -0.69 0.3 -0.15 -0.17 -0.51 -0.44 1.11 0.19 0.41 0.29
-0.53 0.0 -0.08 -0.11 0.21 0.2 0.26 0.29 0.24 0.38 0.49 0.28 -0.51 -0.4 -0.19 -0.37 -0.17 0.23 0.03 -0.41 -0.78 0.08 0.42 -0.13 -0.02 -0.41
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-1.1 -1.36 -1.12 -0.65 -0.18 0.1 0.35 0.72 0.74 0.62 0.17 0.07 -1.1 -0.18 -0.74 0.02 -0.43 -1.07 -0.39 -0.33 0.79 0.39 0.3 0.11 0.54 0.3
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-0.54 -0.19 0.09 0.67 0.82 1.0 1.09 0.9 0.96 0.64 0.24 0.04 -1.4 -1.42 -1.13 -0.97 -0.81 -0.39 -0.39 -0.39 -0.11 -1.43 -1.13 -1.1 -0.34 -0.47

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.