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Heatmap: Cluster_218 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.02 0.09 -0.06 -0.09 0.09 0.1 0.69 0.64 0.19 0.25 0.03 -0.45 0.65 -0.54 -1.25 -1.12 -0.54 0.47 0.02 -0.2 -4.16 -1.2 -0.49 0.05 0.15 0.23
0.89 0.7 0.09 0.05 -0.04 -0.25 -0.29 -0.31 -0.07 0.06 0.33 0.43 0.3 -1.22 -0.98 -1.67 -0.44 0.08 -0.17 -0.08 -2.37 0.43 0.26 0.5 0.17 0.02
0.35 0.54 0.52 0.37 0.23 -0.23 0.01 0.23 0.1 -0.17 -0.05 -0.16 0.26 -0.65 -0.02 -0.7 -0.41 0.43 0.17 0.0 -2.03 0.37 -0.97 -0.32 -0.1 0.09
0.87 0.97 0.87 0.59 0.17 -0.44 -0.52 -0.35 -0.23 -0.03 0.32 0.68 0.76 -0.64 -1.43 -0.82 -0.46 -0.88 -1.1 -0.3 -3.22 0.16 -1.23 0.46 0.16 -0.14
-0.03 -0.1 -0.11 0.19 0.3 0.16 0.4 0.47 0.32 0.13 0.13 -0.09 -0.08 -0.68 0.08 -0.39 -0.12 0.69 0.31 0.03 -4.19 0.81 -0.77 -0.74 -0.41 -0.58
0.42 0.74 0.44 0.24 -0.28 -0.7 -0.53 -0.24 -0.01 0.07 0.3 0.43 0.25 -0.27 -0.44 0.51 -0.25 -0.1 -0.13 -0.25 -1.71 0.3 -0.09 0.15 -0.29 -0.41
0.48 1.0 0.19 -0.12 -0.27 -0.46 -0.56 -0.62 -0.26 -0.13 -0.18 -0.35 -0.23 -1.02 -0.58 -1.38 -0.22 0.37 -0.0 -0.1 -1.84 1.16 0.76 0.25 0.55 -0.16
0.53 0.87 0.45 0.02 -0.61 -1.04 -0.78 -0.31 0.0 0.2 0.58 0.78 -0.08 -0.95 -0.77 -1.07 -0.25 -0.04 -0.38 -0.2 -1.32 0.5 0.12 0.86 -0.04 -0.35
0.31 0.21 0.11 0.19 0.19 -0.01 0.1 -0.08 -0.2 -0.27 -0.6 -0.17 0.24 0.06 -0.5 -0.01 -0.61 0.18 0.11 -0.33 -2.17 0.54 -0.41 0.43 0.31 0.47
0.34 0.01 0.12 1.89 1.0 -0.17 -0.59 -0.73 -0.64 -0.02 -0.71 0.17 -0.07 -2.84 -2.5 -1.23 -0.53 -0.53 -1.46 -0.22 -1.43 1.53 -2.91 -2.35 0.69 0.93
0.35 0.12 0.22 0.23 0.1 -0.41 -0.05 0.09 -0.35 0.09 0.02 0.06 0.29 -0.51 -0.78 -0.46 -0.13 0.28 0.37 0.11 -3.25 0.66 -0.92 0.19 0.08 0.48
1.37 1.47 1.43 1.4 0.97 0.12 -0.05 0.1 -3.49 -2.08 -1.71 -1.17 1.39 -3.43 -4.36 -3.34 -4.1 -3.87 -2.93 -0.56 -1.98 0.94 -3.88 -1.34 0.6 0.26
-0.26 0.47 0.27 0.18 0.3 0.07 0.14 0.19 0.27 0.41 0.19 0.24 -0.47 -0.92 -0.69 -0.62 -0.05 0.43 0.32 0.09 -4.55 0.26 -0.51 -0.35 0.35 -0.16
-0.12 0.05 -0.41 0.36 0.42 0.26 0.54 0.86 0.58 0.39 -0.04 -0.73 -0.96 -1.7 -0.97 -1.14 -0.72 0.95 0.18 -0.06 -3.88 0.13 -0.27 -0.26 0.78 -0.23
0.86 -0.07 -0.42 0.48 -0.17 -0.07 -1.1 -0.22 -0.14 0.89 0.23 0.83 0.66 -0.83 -1.65 -1.23 -0.8 -0.69 -1.0 -0.09 -3.51 -0.28 -0.08 0.0 0.72 1.13
0.7 0.64 0.09 -0.5 -0.98 -0.94 -0.31 0.16 0.05 0.23 0.11 0.13 0.43 -0.78 -1.06 -0.36 -0.34 0.27 0.02 -0.03 -1.58 0.57 -0.68 0.7 0.74 -0.33
0.42 0.26 0.09 0.18 0.11 -0.19 0.02 0.28 -0.3 0.1 0.2 0.22 0.1 0.11 -0.19 -1.04 -0.16 0.18 0.74 -0.01 -3.1 0.16 -0.96 -0.35 -0.25 0.38
0.3 -0.06 -0.14 0.06 0.27 -0.36 0.06 -0.05 -0.44 -0.01 -0.27 -0.07 0.14 0.36 -0.51 -0.43 -0.22 0.52 0.6 0.16 -2.33 -0.15 -0.95 0.48 0.17 0.53
0.72 0.37 -0.26 -0.08 -0.29 -0.38 0.37 0.57 0.5 0.48 0.53 0.17 0.17 -0.5 -0.66 -1.31 -0.28 0.14 0.03 0.04 -2.56 -0.23 -1.31 -0.27 0.44 0.13
0.8 0.33 -0.32 -0.48 -0.81 -0.75 -0.34 0.18 0.17 0.26 0.38 0.36 0.43 -1.92 -0.37 -1.79 -0.22 -0.01 0.1 -0.11 -4.14 0.98 -0.48 0.21 0.71 0.5
0.49 0.33 -0.3 -0.04 0.25 0.28 0.53 0.5 0.13 0.06 -0.09 -0.13 0.4 -0.98 -0.84 -1.12 -1.06 0.73 -0.09 -0.78 -2.19 0.33 -0.12 -0.02 0.69 -0.32
0.19 0.4 -0.12 -0.14 0.06 0.27 0.13 0.29 0.4 0.34 0.26 0.2 0.07 -0.44 0.1 -0.42 -0.13 0.48 0.26 -0.03 -2.89 -0.15 -1.35 -0.38 -0.02 -0.08
0.15 -0.02 -0.22 -0.14 0.18 0.22 0.29 0.4 0.35 0.17 0.06 -0.06 -0.06 -0.24 -0.12 -0.16 -0.23 0.62 0.31 -0.07 -2.58 0.23 -0.23 -0.1 -0.13 -0.56
-0.22 -0.04 0.05 0.39 0.59 0.63 0.75 0.39 0.05 -0.18 -0.38 -0.21 -0.14 -0.49 -0.89 -0.62 -0.37 0.89 0.4 0.49 -2.86 1.01 -1.4 -1.76 -0.73 -0.62
0.33 -0.05 -0.12 -0.34 -0.15 -0.22 -0.83 -0.63 -1.35 -0.64 -0.94 -0.68 -0.22 0.16 -1.07 -1.93 -0.61 0.65 0.45 -0.52 -1.9 1.04 0.06 0.99 0.93 1.41
0.57 0.8 0.34 0.09 -0.44 -1.18 -0.65 -0.22 -0.2 0.07 0.19 0.34 0.0 -0.38 -0.83 -0.76 -0.12 0.32 0.12 0.06 -3.82 0.84 -0.89 0.33 0.33 0.39
0.34 0.16 -0.01 0.34 0.37 0.12 0.26 0.28 0.18 0.22 0.14 -0.16 -0.11 -1.22 -0.3 -1.01 -0.21 0.7 0.32 0.14 -3.66 0.38 -0.74 -0.49 0.16 -0.07
-0.41 -0.18 -0.01 0.47 0.67 0.18 0.39 0.4 0.27 0.16 -0.02 -0.14 -1.28 -0.57 -0.4 -0.43 -0.51 0.44 0.17 -0.41 -0.84 0.24 -0.43 0.43 0.19 -0.09
0.41 0.15 -0.37 -0.44 -0.66 -0.76 -0.62 -0.52 -0.26 0.27 0.38 0.43 0.9 -0.5 -1.09 -1.01 -0.38 0.39 0.08 -0.27 -1.37 0.59 -1.35 1.27 0.49 0.25
1.41 0.43 -0.12 -0.28 -1.61 -1.23 0.38 0.99 0.51 0.43 0.43 -0.5 0.68 -1.9 -1.17 -2.0 -1.35 0.82 -0.03 -0.22 -6.63 -0.93 -1.15 -0.43 1.14 -0.14
0.26 -0.07 -0.34 -0.13 0.06 -0.1 0.4 0.6 0.14 0.36 0.31 -0.16 0.3 -0.86 -0.53 -0.65 -0.72 0.62 0.06 -0.35 -3.13 0.22 -0.67 0.94 0.22 -0.43
0.68 0.48 0.29 0.32 0.05 -0.47 -0.02 0.05 -0.12 0.22 0.24 0.15 0.05 -1.3 -0.29 -1.29 -0.32 0.52 0.25 0.28 -5.89 0.99 -1.93 -0.23 0.08 -0.16
0.27 0.27 0.5 0.54 0.54 0.59 0.16 0.05 -0.06 -0.32 -0.33 -0.06 0.15 -0.46 -0.32 -0.5 -0.33 -0.03 -0.0 -0.29 -2.42 0.49 -0.73 -0.61 0.29 0.13
0.37 -0.13 0.13 0.27 -0.04 -0.13 -0.35 -0.29 0.06 0.36 0.37 0.57 0.24 -1.36 -1.32 -1.95 -0.6 -0.59 -0.4 0.34 -2.54 0.47 0.56 0.64 0.38 0.52
0.55 0.19 0.08 0.05 0.77 0.84 0.35 -0.26 -0.25 -0.73 -0.91 -0.66 0.69 -0.5 -0.01 -0.2 0.04 -0.12 0.5 -0.74 -3.14 0.77 -0.63 -1.45 0.44 -0.39
0.05 -0.33 -0.16 -0.07 -0.09 -0.46 0.11 0.19 -0.09 0.2 0.2 0.43 0.28 -0.07 -0.64 -0.31 -0.14 0.7 0.24 0.12 -3.08 0.54 -0.82 -0.76 0.33 0.54
-1.11 0.24 -0.15 0.78 0.68 -0.06 0.08 0.72 0.56 0.39 0.63 -0.24 -2.4 -1.77 -1.71 -1.91 -0.66 0.82 0.46 0.16 -2.19 -0.97 -1.7 0.86 0.86 -0.61
0.61 0.07 -0.08 -0.28 -0.39 0.06 0.04 0.43 0.16 0.06 0.27 0.01 0.63 -0.42 -0.38 -0.38 -0.54 -0.25 -0.55 -0.39 -2.82 0.58 -0.24 0.09 0.5 0.42
0.32 -0.0 0.12 0.44 0.46 0.22 0.26 0.21 0.49 0.11 0.35 0.09 -0.05 -1.99 -1.69 -1.85 -1.75 -0.9 -1.34 -0.18 -0.89 0.25 0.52 0.02 0.75 0.86
-1.24 -0.65 -0.32 0.09 0.46 0.65 1.12 0.67 0.78 0.16 -0.35 -0.64 -1.42 -0.9 -0.53 -0.2 -0.08 1.0 0.48 -0.28 -2.19 -0.14 -0.34 -0.19 -0.13 -0.39
1.03 1.02 0.72 0.69 0.29 -0.48 -0.57 -0.35 -0.6 -0.42 -0.08 0.16 0.66 -0.91 -0.84 -1.12 -0.49 -0.31 -0.7 -0.21 -0.79 0.33 -0.57 0.06 0.12 0.03
0.03 -0.12 -0.07 0.05 0.26 0.31 0.55 0.39 0.43 0.34 0.29 -0.09 -0.03 -0.6 -0.12 -0.13 -0.13 0.55 0.31 -0.09 -1.31 -0.16 -0.4 -0.64 -0.56 -0.56
0.33 -0.07 -0.16 -0.06 0.21 0.3 0.4 0.37 0.07 -0.02 -0.28 -0.4 0.28 -1.11 -0.23 -0.62 -0.05 0.98 0.48 0.29 -3.41 0.47 -0.7 -0.74 0.17 -0.41
-0.07 -0.44 -0.38 -0.12 0.03 -0.49 0.08 0.04 0.11 -0.02 0.11 -0.21 0.14 0.17 0.19 -0.01 -0.39 0.33 -0.15 -0.29 -3.06 0.37 0.2 1.07 0.27 -0.28
0.35 0.07 -0.12 0.21 -0.06 -0.29 -0.25 -0.03 -0.12 -0.05 -0.05 0.15 0.28 -0.33 -0.14 -0.22 -0.2 0.64 1.43 -0.46 -2.71 -0.14 -0.8 -0.49 -0.08 0.17
0.37 0.29 0.2 0.15 -0.45 -0.71 0.01 0.29 0.23 -0.0 0.03 0.1 -0.15 -0.09 -0.16 -0.31 -0.21 0.24 0.46 -0.15 -3.09 -0.31 -0.16 -0.25 0.52 0.51
0.81 0.98 0.43 0.24 -0.06 -0.42 -0.27 -0.2 -0.14 -0.04 0.28 0.38 0.35 -0.98 -0.6 -1.36 -0.39 -0.33 -0.44 -0.11 -3.26 0.73 -0.61 0.29 0.34 -0.06
-0.97 0.08 0.18 0.57 0.57 0.17 0.32 0.45 0.3 0.2 0.08 -0.12 -1.32 -0.57 -0.09 -0.21 -0.18 0.67 0.29 -0.31 -3.88 0.82 -0.94 -0.59 -0.02 -0.27
-0.29 -0.81 0.32 0.98 0.37 -0.4 -0.09 0.36 0.44 0.51 0.56 0.3 -0.76 -1.2 -2.15 -1.2 -1.46 -0.81 -0.83 -0.21 -2.82 0.77 0.74 0.1 0.74 0.39
0.21 -0.54 -0.35 0.19 -0.2 -0.33 0.15 0.63 0.38 0.02 0.32 0.29 0.49 -0.49 -1.54 -0.24 -1.27 0.78 -0.37 -0.88 -1.57 0.66 0.21 -0.16 0.65 -0.28
0.26 -0.07 -0.15 -0.21 0.16 -0.03 0.18 0.09 0.19 0.41 0.46 0.37 0.23 -0.63 -0.32 -1.2 -0.51 -0.26 -0.3 -0.1 -1.07 0.56 -0.07 0.15 0.15 0.27
0.17 0.45 0.48 0.59 0.17 -0.0 0.0 0.05 -0.1 -0.09 -0.02 0.12 0.52 -0.58 -0.42 -0.57 -0.27 -0.06 -0.02 -0.72 -1.71 0.77 -0.48 -0.39 0.02 0.1
1.48 0.83 0.55 0.85 0.42 -0.98 -0.76 0.02 -0.92 -0.64 0.01 0.3 0.89 -2.75 -1.42 -3.01 -1.29 -0.36 -0.36 -0.52 -4.53 0.52 -2.83 0.48 0.44 0.83
0.18 0.43 0.51 0.43 0.56 0.3 0.33 0.22 0.05 0.28 0.01 0.04 -0.13 -0.33 0.08 -0.41 -0.29 0.7 0.63 -0.01 -3.72 -0.82 -1.5 -1.11 -1.16 -0.12
0.2 0.29 0.54 0.58 0.48 0.05 0.57 0.53 0.05 0.29 0.21 0.14 -0.09 -0.37 0.1 -0.35 -0.31 0.6 0.31 -0.19 -3.61 -0.84 -1.16 -1.3 -0.96 -0.34
-0.08 0.1 0.14 0.18 0.39 0.31 0.48 0.24 0.32 0.33 0.01 -0.03 -0.04 -0.3 -0.1 0.14 -0.14 0.66 0.42 -0.11 -3.14 0.51 -1.67 -0.98 -0.9 -0.6
1.01 0.29 0.14 0.25 -0.14 -0.21 -0.23 0.16 0.27 0.42 0.43 0.39 0.56 -0.83 -0.41 -0.33 -0.97 0.59 -0.4 -1.12 -3.72 -1.14 -1.65 -1.08 0.77 0.74
0.66 0.46 -0.16 0.44 -0.06 -0.5 -0.35 -0.02 0.32 0.15 0.38 0.13 0.45 -0.63 -0.61 -0.44 -1.14 0.72 -0.35 -1.24 -2.72 0.3 -1.71 -0.15 0.75 0.68
0.64 0.67 0.35 0.75 0.38 -0.2 -0.39 -0.18 -0.24 0.01 0.23 0.31 -0.24 -1.24 -1.78 -1.44 -0.72 0.54 -0.24 -0.29 -5.98 0.84 -1.47 -0.74 0.98 0.49
0.48 -1.43 -0.65 0.01 0.09 0.61 1.09 0.89 0.04 0.18 0.66 0.1 -0.48 -1.68 -1.49 - - 0.53 -1.52 -0.91 - 1.45 -2.69 0.68 1.03 -0.03
0.72 0.3 -0.02 -0.16 -0.25 -0.34 0.04 0.27 0.17 0.09 0.34 0.09 0.26 -0.64 -0.19 -0.79 -0.48 0.22 0.22 -0.13 -2.84 0.41 -0.75 -0.11 0.55 0.2
-0.02 0.69 0.27 0.82 0.11 -0.14 -0.08 0.06 -0.06 0.29 0.24 -0.1 -0.78 -0.75 -0.31 -0.67 -0.06 0.24 0.13 -0.26 -4.27 -3.67 -0.31 0.63 1.09 -0.22
0.3 0.76 0.3 0.14 0.25 -0.1 0.15 0.1 0.19 0.32 0.07 -0.01 -0.17 -0.53 -0.29 -0.42 -0.37 0.89 0.48 0.22 - 0.74 -1.39 -1.0 -0.64 -1.08
-0.7 -0.41 -0.21 0.09 -0.11 -0.12 0.42 0.01 0.22 0.53 0.22 0.05 -0.43 0.26 0.63 0.01 -0.24 0.86 0.7 0.1 -3.2 0.08 -3.13 -0.95 -0.03 0.08
-0.33 -0.44 -0.23 0.13 0.32 0.3 0.11 0.21 0.45 0.48 0.4 0.11 -0.04 0.07 0.21 -0.29 -0.63 0.62 0.53 -0.32 -3.14 0.27 -2.66 -1.1 0.05 0.32
0.47 0.81 0.52 0.46 0.18 0.21 0.14 0.2 0.15 0.15 0.13 0.23 0.41 -3.35 -2.44 -2.71 -0.81 0.71 -0.25 0.12 -2.9 0.36 -2.38 -0.64 0.99 -0.18
0.38 0.18 0.27 0.83 0.85 0.31 0.06 -0.05 -0.38 -0.56 -0.17 -0.28 0.47 -0.83 -0.97 0.4 -1.12 -0.26 -0.48 -1.09 -1.99 1.15 -0.15 -1.56 0.35 0.16
-0.45 -0.54 -0.68 -0.42 0.25 0.02 0.24 0.18 -0.17 0.06 0.18 -0.21 0.01 0.13 -0.2 0.15 0.26 0.67 0.25 -0.21 -2.34 -0.09 -0.23 1.02 0.28 -0.67
-0.18 -0.14 -0.35 0.26 0.66 0.53 0.81 0.81 0.61 0.53 0.28 -0.42 -0.22 -1.88 -0.89 -1.46 -0.59 1.11 0.32 -0.0 -6.46 -0.1 -1.29 -1.11 0.2 -0.55
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0.53 0.24 0.27 0.47 0.27 0.13 0.07 0.11 -0.23 -0.44 -0.3 -0.45 0.32 -0.48 -0.49 -0.25 -0.46 0.35 0.42 -0.45 -3.59 0.71 -0.5 -0.56 0.25 0.41
1.32 0.27 -0.3 -1.05 -0.41 -1.13 0.49 0.69 0.26 0.25 0.32 0.12 1.15 -1.06 -0.82 -1.97 -0.96 0.66 0.15 -0.75 -5.43 -0.78 -2.4 -1.78 1.51 -0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.