Heatmap: Cluster_106 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.17 0.14 0.31 0.2 0.17 0.14 0.27 0.25 0.18 0.27 0.3 0.23 0.17 0.23 0.12 0.23 0.11 0.33 0.35 0.25 0.29 0.24 0.65 0.79 0.32 0.28
0.64 0.26 0.14 0.09 0.18 0.28 0.76 0.13 0.09 0.68 0.62 0.33 0.21 2.43 0.16 3.94 1.33 2.51 4.16 4.51 7.04 1.39 8.04 15.7 2.92 6.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.6 0.89 0.78 0.61 0.35 0.24 0.38 2.63 0.97 0.87 0.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.14 0.39 0.72 0.91 0.64 0.58 0.3 0.59 3.02 0.65 1.56 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.38 0.88 1.17 1.33 1.49 1.13 0.44 1.7 3.38 1.31 1.67 1.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 0.75 1.05 1.55 1.81 1.97 1.85 0.6 0.96 4.82 2.75 2.92 2.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 1.12 1.78 2.71 2.18 2.66 2.83 1.15 2.04 6.12 3.44 2.91 3.5
0.0 0.08 0.04 0.09 0.12 0.04 0.05 0.04 0.04 0.08 0.08 0.0 0.0 1.27 1.13 1.49 1.13 1.15 1.65 1.66 1.1 0.21 3.12 1.68 2.48 3.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.06 0.02 0.0 0.12 0.0 0.36 0.41 0.18 0.27
0.42 0.19 0.18 0.35 0.31 0.21 0.27 0.46 0.36 0.45 0.81 0.7 0.63 0.73 0.72 1.08 0.26 0.62 0.95 1.09 0.94 0.99 2.01 2.81 1.01 1.17
0.18 0.41 0.22 0.11 0.11 0.02 0.16 0.35 0.43 0.39 0.66 0.68 0.18 1.24 1.38 1.21 1.35 2.16 3.29 2.37 4.01 0.34 6.36 6.18 1.15 2.82
0.65 0.32 0.55 1.22 1.2 0.6 1.79 0.79 1.92 1.43 1.33 0.91 0.36 1.75 5.69 3.32 1.99 5.46 4.88 3.33 6.02 3.58 13.5 8.56 8.46 3.52
0.32 0.22 0.25 0.38 0.33 0.25 0.26 0.24 0.29 0.41 0.45 0.42 0.19 0.71 0.75 0.76 0.56 0.83 0.82 0.64 0.8 0.76 1.5 2.32 1.07 0.82
0.26 0.54 0.55 0.92 0.82 0.42 0.58 0.75 0.76 0.74 0.68 0.7 0.08 0.73 1.03 0.92 0.96 0.75 0.94 0.75 0.09 0.65 1.64 2.32 1.94 1.26
1.3 2.43 2.4 2.27 2.91 10.31 12.66 12.25 14.93 13.25 9.49 8.75 1.25 16.2 21.02 18.23 16.15 27.08 22.29 17.1 5.65 17.37 33.52 8.19 11.01 9.45
0.24 0.0 0.04 0.04 0.08 0.02 0.18 0.05 0.2 0.25 0.25 0.3 0.13 1.09 0.58 1.1 0.33 1.43 1.52 1.47 1.9 0.65 1.69 5.48 1.36 2.56
0.0 0.03 0.0 0.21 0.09 0.05 0.09 0.0 0.0 0.15 0.26 0.09 0.1 0.2 1.23 0.53 0.26 0.95 1.3 0.25 0.58 0.29 2.99 1.43 0.52 0.79
1.03 0.97 0.97 0.96 1.71 1.79 2.26 1.7 1.66 1.85 1.32 0.86 1.11 2.73 3.91 2.51 3.45 3.42 3.65 3.58 1.92 0.74 9.03 4.01 5.91 6.11
0.17 0.07 0.11 0.04 0.1 0.05 0.05 0.09 0.13 0.19 0.15 0.19 0.13 0.92 0.96 0.65 1.21 1.15 0.88 1.03 0.44 1.3 5.7 2.73 3.65 2.17
0.02 0.03 0.0 0.09 0.05 0.07 0.08 0.06 0.09 0.08 0.09 0.12 0.0 0.12 0.16 0.13 0.14 0.2 0.25 0.2 0.29 0.3 0.88 0.13 0.4 0.25
0.42 0.22 0.2 0.51 0.48 0.71 0.88 0.52 0.86 0.84 1.08 1.87 0.2 1.84 1.53 1.9 1.67 3.0 2.54 1.4 2.4 0.66 9.57 3.25 6.45 3.94
0.28 0.12 0.13 0.16 0.21 0.18 0.08 0.1 0.22 0.27 0.36 0.26 0.2 0.52 1.75 0.65 0.14 0.55 0.4 0.22 1.36 0.99 2.8 2.77 1.29 1.43
0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.03 0.01 0.06 0.04 0.03 0.13 0.08 0.0 0.23 0.14 0.57 0.48 0.39 0.26
0.33 0.19 0.07 0.11 0.3 0.45 0.35 0.23 0.56 0.33 0.11 0.37 0.19 0.95 0.85 0.83 0.69 0.72 1.1 0.8 0.41 0.23 1.96 0.77 1.01 0.73
0.7 0.82 2.1 2.61 3.47 6.39 6.79 5.61 8.45 6.22 5.63 6.84 0.72 10.25 14.43 11.39 24.11 21.01 27.48 14.55 9.15 5.82 41.47 23.13 31.81 25.17
0.37 0.2 0.09 0.32 0.35 0.1 0.28 0.19 0.82 0.63 0.77 0.77 0.45 4.03 10.51 7.78 14.8 4.81 2.99 3.5 7.62 0.8 20.32 8.41 6.22 6.4
0.18 0.39 0.37 0.47 0.34 0.41 0.56 0.7 0.52 0.68 0.6 0.54 0.35 1.23 0.59 1.15 0.75 1.27 0.77 1.06 0.44 1.25 1.5 0.99 0.93 1.47
0.12 0.19 0.2 0.07 0.3 0.18 0.15 0.24 0.8 0.74 0.55 0.68 0.37 1.02 1.63 0.87 1.45 1.95 1.91 0.83 0.59 0.28 3.2 2.56 0.74 1.4
0.07 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.02 0.06 0.08 0.19 0.21 0.1 0.14 0.43 0.37 1.27 0.4 1.76 2.0 1.39 0.65
10.7 7.62 9.26 11.85 12.37 14.24 22.09 23.41 27.96 41.87 42.93 31.34 13.99 52.65 35.79 39.52 47.91 43.28 36.27 28.87 33.6 40.51 124.38 75.53 71.66 80.57
0.02 0.02 0.0 0.04 0.02 0.02 0.0 0.02 0.04 0.08 0.04 0.05 0.03 0.07 0.02 0.07 0.02 0.08 0.1 0.03 0.02 0.09 0.49 0.21 0.5 0.18
0.07 0.09 0.09 0.43 0.36 0.4 0.64 0.55 1.29 0.97 1.07 0.3 0.06 0.66 0.75 0.43 0.55 0.65 0.86 0.47 0.39 0.52 1.69 3.19 2.28 1.29
24.47 19.83 18.6 20.14 16.08 12.46 20.72 25.63 32.17 34.97 40.37 34.42 19.38 114.02 90.53 116.55 107.41 209.67 182.53 113.64 174.5 260.48 621.94 371.72 315.26 269.02
0.66 0.3 0.34 0.35 0.22 0.98 0.31 0.63 0.52 0.49 1.02 1.26 0.64 3.18 3.76 4.07 1.32 4.92 4.3 4.37 6.78 2.09 13.94 5.89 7.33 5.23
0.17 0.0 0.32 0.28 0.29 0.1 0.69 0.49 1.11 0.66 0.17 0.77 0.0 0.56 2.15 1.99 1.53 1.95 1.83 1.85 0.41 1.32 4.67 3.89 0.13 0.81
1.22 0.43 1.02 0.61 0.73 1.5 2.77 1.07 2.1 2.17 1.66 2.31 0.27 1.19 1.59 1.39 1.37 4.38 5.12 1.55 0.34 3.91 8.09 8.17 3.04 2.03
0.31 0.23 0.3 0.25 0.16 0.37 0.09 0.28 0.4 0.35 0.62 0.47 0.07 2.08 2.02 2.2 1.92 3.59 1.99 2.28 0.53 3.16 3.62 5.85 3.96 2.19
1.22 1.12 0.41 1.76 0.62 0.86 0.66 0.68 1.12 1.07 1.63 1.59 1.4 0.8 0.55 0.88 0.63 0.93 1.17 0.38 0.2 0.81 2.67 4.03 2.23 2.95
12.26 5.24 3.77 6.31 9.86 12.47 15.3 18.03 15.72 24.39 22.1 22.24 12.57 30.39 20.24 18.44 17.44 22.33 21.57 19.26 18.64 30.16 37.09 27.55 35.46 31.79
0.16 0.13 0.16 0.33 0.36 0.27 0.43 0.59 0.45 0.6 0.62 0.56 0.1 3.72 4.27 2.47 2.22 2.71 2.84 2.96 3.82 0.58 7.9 9.07 5.15 2.49
20.72 13.12 9.08 13.82 18.0 15.4 20.65 25.93 26.51 45.84 45.52 48.4 28.95 53.22 50.95 34.2 44.26 43.78 39.88 33.85 33.22 41.38 60.11 90.69 50.39 42.21
0.09 0.02 0.13 0.07 0.22 0.17 0.18 0.42 0.16 0.02 0.08 0.07 0.04 1.27 1.39 1.04 1.87 1.78 1.91 0.57 1.17 0.72 4.17 2.64 3.55 2.36
0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.07 0.15 0.17 0.12 0.13 0.04 0.1 0.69 0.32 0.28 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.22 0.22 0.22 0.43 0.26 0.35 0.11 0.07 0.57 0.55 0.27 0.21
0.13 0.32 0.51 0.48 0.41 1.01 1.57 1.06 1.25 0.96 0.77 0.73 0.08 1.43 1.75 2.72 3.32 4.64 4.15 2.88 1.49 1.08 6.43 4.9 4.59 2.58
0.12 0.02 0.07 0.14 0.11 0.06 0.09 0.05 0.14 0.14 0.15 0.16 0.11 1.23 0.71 1.13 0.91 1.63 1.26 1.63 1.55 2.79 7.63 4.22 3.59 3.65
0.02 0.07 0.0 0.04 0.11 0.07 0.05 0.07 0.0 0.04 0.06 0.05 0.02 1.54 0.99 1.01 0.84 0.79 0.82 0.9 1.16 0.81 1.15 1.58 1.17 0.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.72 0.74 0.42 0.74 0.62 0.51 1.09 0.09 1.72 1.8 0.82 1.07
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.3 0.0 0.17 0.0 0.0 0.2 0.43 0.17 0.52 0.32 0.24 0.53 1.53 0.16 1.63 1.02 1.62 0.86
1.57 2.03 2.5 2.04 2.9 2.29 3.53 2.85 1.44 2.67 2.26 1.82 1.54 3.31 4.4 3.91 3.13 5.03 4.99 5.97 1.81 2.09 8.81 1.78 4.43 1.75
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.1 0.15 0.07 0.15 0.25 0.09 0.24 0.12 0.49 0.4 0.3 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.04 0.03 0.17 0.06 0.03 0.11 0.02 0.37 0.21 0.22 0.17
0.02 0.0 0.02 0.05 0.05 0.03 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.05 0.06 0.1 0.2 0.15 0.17 0.15 0.18 0.2 0.08 0.07 0.43 0.68 0.28 0.24
0.06 0.03 0.07 0.07 0.07 0.1 0.15 0.08 0.04 0.14 0.11 0.14 0.04 0.37 0.4 0.3 0.31 0.32 0.46 0.5 0.41 0.17 0.63 1.11 0.52 0.67
0.62 0.37 0.55 0.45 0.39 0.39 0.64 0.52 0.44 0.51 0.32 0.37 0.56 1.25 1.27 1.24 1.12 1.07 1.21 1.08 1.0 0.66 1.35 0.84 2.66 1.23
0.11 0.12 0.02 0.18 0.0 0.05 0.05 0.0 0.02 0.02 0.02 0.12 0.0 0.63 1.21 0.99 0.9 1.09 1.09 1.83 0.61 1.25 4.26 2.95 3.72 1.57

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)