Heatmap: Cluster_106 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.21 0.18 0.39 0.25 0.21 0.18 0.34 0.31 0.22 0.34 0.38 0.29 0.21 0.29 0.15 0.29 0.14 0.41 0.44 0.31 0.37 0.31 0.82 1.0 0.4 0.35
0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.04 0.04 0.02 0.01 0.15 0.01 0.25 0.08 0.16 0.27 0.29 0.45 0.09 0.51 1.0 0.19 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.23 0.34 0.3 0.23 0.13 0.09 0.15 1.0 0.37 0.33 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.13 0.24 0.3 0.21 0.19 0.1 0.2 1.0 0.21 0.52 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.11 0.26 0.35 0.39 0.44 0.34 0.13 0.5 1.0 0.39 0.5 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.15 0.22 0.32 0.38 0.41 0.38 0.12 0.2 1.0 0.57 0.61 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.18 0.29 0.44 0.36 0.43 0.46 0.19 0.33 1.0 0.56 0.48 0.57
0.0 0.03 0.01 0.03 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.39 0.35 0.46 0.35 0.35 0.51 0.51 0.34 0.06 0.96 0.52 0.76 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.2 0.0 0.14 0.05 0.0 0.28 0.0 0.86 1.0 0.44 0.66
0.15 0.07 0.06 0.13 0.11 0.07 0.1 0.17 0.13 0.16 0.29 0.25 0.22 0.26 0.26 0.39 0.09 0.22 0.34 0.39 0.33 0.35 0.71 1.0 0.36 0.42
0.03 0.06 0.03 0.02 0.02 0.0 0.03 0.06 0.07 0.06 0.1 0.11 0.03 0.19 0.22 0.19 0.21 0.34 0.52 0.37 0.63 0.05 1.0 0.97 0.18 0.44
0.05 0.02 0.04 0.09 0.09 0.04 0.13 0.06 0.14 0.11 0.1 0.07 0.03 0.13 0.42 0.25 0.15 0.4 0.36 0.25 0.45 0.27 1.0 0.63 0.63 0.26
0.14 0.1 0.11 0.16 0.14 0.11 0.11 0.1 0.12 0.18 0.19 0.18 0.08 0.3 0.32 0.33 0.24 0.36 0.35 0.28 0.34 0.32 0.65 1.0 0.46 0.35
0.11 0.23 0.24 0.4 0.36 0.18 0.25 0.32 0.33 0.32 0.29 0.3 0.03 0.31 0.44 0.4 0.42 0.33 0.4 0.32 0.04 0.28 0.71 1.0 0.84 0.54
0.04 0.07 0.07 0.07 0.09 0.31 0.38 0.37 0.45 0.4 0.28 0.26 0.04 0.48 0.63 0.54 0.48 0.81 0.66 0.51 0.17 0.52 1.0 0.24 0.33 0.28
0.04 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.04 0.05 0.05 0.06 0.02 0.2 0.11 0.2 0.06 0.26 0.28 0.27 0.35 0.12 0.31 1.0 0.25 0.47
0.0 0.01 0.0 0.07 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.09 0.03 0.03 0.07 0.41 0.18 0.09 0.32 0.43 0.08 0.19 0.1 1.0 0.48 0.17 0.27
0.11 0.11 0.11 0.11 0.19 0.2 0.25 0.19 0.18 0.21 0.15 0.1 0.12 0.3 0.43 0.28 0.38 0.38 0.4 0.4 0.21 0.08 1.0 0.44 0.65 0.68
0.03 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.16 0.17 0.11 0.21 0.2 0.15 0.18 0.08 0.23 1.0 0.48 0.64 0.38
0.02 0.03 0.0 0.1 0.05 0.08 0.09 0.07 0.1 0.09 0.1 0.13 0.0 0.14 0.18 0.15 0.16 0.23 0.29 0.23 0.33 0.35 1.0 0.15 0.46 0.28
0.04 0.02 0.02 0.05 0.05 0.07 0.09 0.05 0.09 0.09 0.11 0.19 0.02 0.19 0.16 0.2 0.17 0.31 0.27 0.15 0.25 0.07 1.0 0.34 0.67 0.41
0.1 0.04 0.05 0.06 0.08 0.06 0.03 0.04 0.08 0.1 0.13 0.09 0.07 0.19 0.63 0.23 0.05 0.2 0.14 0.08 0.49 0.35 1.0 0.99 0.46 0.51
0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.07 0.0 0.05 0.03 0.1 0.07 0.04 0.23 0.13 0.0 0.4 0.25 1.0 0.84 0.68 0.45
0.17 0.1 0.04 0.06 0.15 0.23 0.18 0.12 0.29 0.17 0.06 0.19 0.1 0.49 0.44 0.42 0.35 0.37 0.56 0.41 0.21 0.12 1.0 0.39 0.52 0.37
0.02 0.02 0.05 0.06 0.08 0.15 0.16 0.14 0.2 0.15 0.14 0.16 0.02 0.25 0.35 0.27 0.58 0.51 0.66 0.35 0.22 0.14 1.0 0.56 0.77 0.61
0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.04 0.04 0.02 0.2 0.52 0.38 0.73 0.24 0.15 0.17 0.37 0.04 1.0 0.41 0.31 0.31
0.12 0.26 0.25 0.31 0.23 0.28 0.37 0.47 0.35 0.46 0.4 0.36 0.23 0.82 0.39 0.77 0.5 0.85 0.51 0.71 0.29 0.83 1.0 0.66 0.62 0.98
0.04 0.06 0.06 0.02 0.09 0.06 0.05 0.07 0.25 0.23 0.17 0.21 0.11 0.32 0.51 0.27 0.45 0.61 0.6 0.26 0.18 0.09 1.0 0.8 0.23 0.44
0.04 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.03 0.04 0.1 0.1 0.05 0.07 0.22 0.18 0.63 0.2 0.88 1.0 0.7 0.32
0.09 0.06 0.07 0.1 0.1 0.11 0.18 0.19 0.22 0.34 0.35 0.25 0.11 0.42 0.29 0.32 0.39 0.35 0.29 0.23 0.27 0.33 1.0 0.61 0.58 0.65
0.04 0.03 0.0 0.09 0.04 0.04 0.0 0.04 0.09 0.17 0.08 0.09 0.06 0.14 0.04 0.13 0.04 0.15 0.2 0.07 0.04 0.17 0.96 0.41 1.0 0.36
0.02 0.03 0.03 0.13 0.11 0.13 0.2 0.17 0.41 0.31 0.34 0.1 0.02 0.21 0.23 0.13 0.17 0.2 0.27 0.15 0.12 0.16 0.53 1.0 0.71 0.4
0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.05 0.06 0.06 0.06 0.03 0.18 0.15 0.19 0.17 0.34 0.29 0.18 0.28 0.42 1.0 0.6 0.51 0.43
0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.02 0.05 0.04 0.04 0.07 0.09 0.05 0.23 0.27 0.29 0.09 0.35 0.31 0.31 0.49 0.15 1.0 0.42 0.53 0.38
0.04 0.0 0.07 0.06 0.06 0.02 0.15 0.11 0.24 0.14 0.04 0.17 0.0 0.12 0.46 0.43 0.33 0.42 0.39 0.4 0.09 0.28 1.0 0.83 0.03 0.17
0.15 0.05 0.13 0.07 0.09 0.18 0.34 0.13 0.26 0.27 0.2 0.28 0.03 0.15 0.19 0.17 0.17 0.54 0.63 0.19 0.04 0.48 0.99 1.0 0.37 0.25
0.05 0.04 0.05 0.04 0.03 0.06 0.02 0.05 0.07 0.06 0.11 0.08 0.01 0.36 0.35 0.38 0.33 0.61 0.34 0.39 0.09 0.54 0.62 1.0 0.68 0.38
0.3 0.28 0.1 0.44 0.15 0.21 0.16 0.17 0.28 0.27 0.4 0.39 0.35 0.2 0.14 0.22 0.16 0.23 0.29 0.1 0.05 0.2 0.66 1.0 0.55 0.73
0.33 0.14 0.1 0.17 0.27 0.34 0.41 0.49 0.42 0.66 0.6 0.6 0.34 0.82 0.55 0.5 0.47 0.6 0.58 0.52 0.5 0.81 1.0 0.74 0.96 0.86
0.02 0.01 0.02 0.04 0.04 0.03 0.05 0.07 0.05 0.07 0.07 0.06 0.01 0.41 0.47 0.27 0.25 0.3 0.31 0.33 0.42 0.06 0.87 1.0 0.57 0.28
0.23 0.14 0.1 0.15 0.2 0.17 0.23 0.29 0.29 0.51 0.5 0.53 0.32 0.59 0.56 0.38 0.49 0.48 0.44 0.37 0.37 0.46 0.66 1.0 0.56 0.47
0.02 0.01 0.03 0.02 0.05 0.04 0.04 0.1 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.3 0.33 0.25 0.45 0.43 0.46 0.14 0.28 0.17 1.0 0.63 0.85 0.56
0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.1 0.21 0.24 0.18 0.19 0.06 0.14 1.0 0.46 0.41 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.38 0.38 0.38 0.76 0.45 0.61 0.19 0.12 1.0 0.97 0.47 0.37
0.02 0.05 0.08 0.08 0.06 0.16 0.24 0.17 0.2 0.15 0.12 0.11 0.01 0.22 0.27 0.42 0.52 0.72 0.65 0.45 0.23 0.17 1.0 0.76 0.71 0.4
0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.16 0.09 0.15 0.12 0.21 0.17 0.21 0.2 0.37 1.0 0.55 0.47 0.48
0.01 0.05 0.0 0.03 0.07 0.04 0.03 0.05 0.0 0.03 0.04 0.03 0.01 0.98 0.63 0.64 0.53 0.5 0.52 0.57 0.74 0.51 0.73 1.0 0.74 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.4 0.41 0.23 0.41 0.34 0.29 0.61 0.05 0.96 1.0 0.46 0.6
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.0 0.11 0.0 0.0 0.13 0.26 0.1 0.32 0.2 0.15 0.33 0.94 0.1 1.0 0.63 1.0 0.53
0.18 0.23 0.28 0.23 0.33 0.26 0.4 0.32 0.16 0.3 0.26 0.21 0.17 0.38 0.5 0.44 0.36 0.57 0.57 0.68 0.21 0.24 1.0 0.2 0.5 0.2
0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.2 0.31 0.14 0.3 0.51 0.18 0.48 0.25 1.0 0.81 0.6 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.21 0.12 0.07 0.47 0.16 0.09 0.29 0.04 1.0 0.58 0.6 0.45
0.03 0.0 0.03 0.07 0.08 0.04 0.0 0.07 0.03 0.0 0.03 0.07 0.09 0.15 0.3 0.23 0.25 0.23 0.27 0.3 0.12 0.11 0.63 1.0 0.41 0.36
0.05 0.02 0.06 0.06 0.06 0.09 0.13 0.08 0.04 0.13 0.1 0.13 0.04 0.34 0.36 0.27 0.28 0.29 0.41 0.45 0.37 0.15 0.56 1.0 0.47 0.6
0.23 0.14 0.21 0.17 0.14 0.15 0.24 0.19 0.16 0.19 0.12 0.14 0.21 0.47 0.48 0.47 0.42 0.4 0.45 0.41 0.38 0.25 0.51 0.32 1.0 0.46
0.03 0.03 0.01 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.28 0.23 0.21 0.26 0.26 0.43 0.14 0.29 1.0 0.69 0.88 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)