1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_213 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - 2.58 2.64 - - 2.44 - - 2.5 - - - - - - - - 1.45 - - - - -
0.99 1.54 - 1.37 - 2.43 1.5 - - 1.21 - 1.4 1.73 - - - - - - - - 1.04 - - - -
- 2.66 - - 1.01 - - 2.74 0.25 0.09 2.79 - - - - - - - - - - - - - 0.85 -
- - - - - - - 3.99 - - - - - - - - - 2.12 2.52 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.19 -1.22 -2.16 - -1.42 1.95 2.07 1.52 1.65 -1.47 0.13 1.3 -0.17 0.13 -0.6 - -2.16 0.27 -0.01 - - - - - - -0.38
- - - - - 2.03 3.22 - 2.14 - - 2.13 - - - - - - - 1.93 - - - - - -
0.26 0.52 - - - 0.28 - - 1.93 - 1.24 2.38 - 0.11 0.02 2.95 - - - -0.05 - - - - - -
- 2.51 - - - - 2.46 - 2.38 - - 2.37 2.15 - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.94 - - - - - 1.75 - 2.97 - 1.7 1.78 - 2.1 - - - - - - - - -
0.52 0.72 -0.2 - 0.87 -1.3 - 1.18 - 0.78 2.2 2.18 -1.42 - - - - - -0.35 -1.64 0.16 - - 1.56 - 0.18
- - - 2.37 - 2.3 - - - - - 3.4 - - - 2.43 - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.78 - 3.62 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.91 - - - - - 2.98 1.82 - 1.78 2.88 - - - - - - - - - - - - - -
1.81 - - - - - 2.32 2.0 3.16 - - 2.2 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.13 2.91 3.58 1.11 - 1.13 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.07 2.92 - 2.88 - - - - - - - 1.42 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.67 0.76 - - - - 2.33 0.66 0.45 2.08 0.63 - - 1.44 - 0.51 - - - 0.09 - - - - 1.11
- - - 1.33 -0.44 - -0.33 1.3 - 0.56 -0.41 - 1.14 - - - - 2.46 1.71 -0.71 - - - 0.96 0.57 1.16
- - - 2.61 - - - 2.87 - - - 2.76 2.55 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.79 - - - 2.78 - - 1.0 - 0.48 2.87 - - 0.56 - - - - - - -
- - - - - - 3.2 - 3.04 - - 3.1 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -0.84 2.62 3.12 2.55 1.38 0.66 -0.74 - - - - - - - - - - - - - -
-0.55 - - - - 1.55 2.7 2.19 1.58 1.01 1.84 0.55 -1.65 - - - -1.31 -2.08 -1.55 - - - - - - -
0.24 - - - -2.85 1.86 2.21 2.4 0.56 0.81 0.45 0.54 -2.12 -2.72 - - - 0.12 -0.24 - - - -3.22 - 1.41 -
- - - - - 2.25 2.44 - - - - 2.34 3.43 - - - - - - - - - - - - -
- 1.16 - - - 0.92 2.64 2.03 1.04 - 0.84 2.59 - 0.75 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.42 1.78 - - - 2.86 - - - - - 2.21 - - - - - - - -
- - - - - 1.38 3.12 3.13 1.33 1.14 - 0.35 - - - - - - - - - - - - - -
0.06 - - - - 2.5 2.18 3.04 0.2 - 0.0 1.17 - -0.09 - - 0.27 - - - - - - - - -
-0.09 0.17 0.92 - - - 0.12 -0.19 0.94 - -0.15 2.35 - 1.63 0.83 -0.1 - 0.57 0.75 -0.46 -1.02 - - - -0.76 0.5
0.5 -0.17 1.58 0.33 0.07 -1.42 -1.31 -0.95 -2.51 -2.67 -0.58 -0.46 0.15 -0.81 -1.06 -0.57 -0.16 1.72 -0.91 -0.06 -0.11 -2.95 -2.93 0.67 -0.02 1.63
- - 2.17 - - - - 2.39 - - - 3.61 - - - - - 2.03 - - - - - - - -
- - - - - - 3.65 - - - - 3.75 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.26 - - - - 3.16 - - - - - 2.9 - - - - - - - -
1.35 - - - - - - 1.86 - - 2.64 2.76 - - - - 1.88 - 1.64 - - - - - - -
1.81 - - - - 2.78 2.03 - - 1.71 - - 2.26 - - 1.8 - - - - - - - - - -
- 3.2 3.07 - - - - - - - 3.07 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.53 1.16 -1.51 -0.66 - 0.02 -1.28 -0.61 -0.72 -0.85 0.55 2.54 2.04 1.27 -1.82 - - 0.03 -0.29 -1.11 - -0.55 -0.81 - - -1.16
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.08 - 2.1 2.1 2.02 - - - 1.78 - - - - - 1.54 - - 1.49 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.47 0.08 - 0.85 0.03 - 1.08 0.72 1.47 0.72 1.39 -0.07 - 1.18 -0.42 1.4 - -0.91 - -0.49 - 1.12 - - -0.84 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.7 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.04 - - - - 3.25 - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.44 -0.1 -0.65 -0.1 -0.16 -0.29 0.27 0.53 0.01 0.11 0.15 0.17 0.56 -1.46 -1.21 -1.57 -0.98 0.72 0.29 -0.45 -0.2 -0.81 -0.19 0.23 0.13 1.11
- 1.58 - 1.52 - - 1.65 - 1.57 - 1.37 3.13 - - - - - - 1.43 - - - - - - -
- - - 3.13 - - 3.06 - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - -
1.52 - - - - - - 3.27 1.66 - - 1.64 1.43 - - - - - 2.18 - - - - - - -
-0.5 -0.5 - - - - 2.82 3.1 2.03 0.28 0.91 - 0.84 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.19 - - - - - - 3.1 - 3.06 - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.