1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_8 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.08 0.06 0.03 0.01 0.02 0.06 0.14 0.17 0.19 0.24 0.2 0.15 0.08 0.2 0.03 1.0 0.08 0.08 0.06 0.12 0.0 0.0 0.04 0.04 0.07 0.04
0.16 0.27 0.31 0.34 0.32 0.27 0.28 0.31 0.26 0.29 0.25 0.26 0.16 0.29 0.21 1.0 0.2 0.31 0.2 0.22 0.19 0.1 0.28 0.16 0.29 0.2
0.03 0.03 0.03 0.03 0.05 0.08 0.13 0.11 0.1 0.1 0.07 0.05 0.02 0.06 0.04 1.0 0.06 0.07 0.06 0.08 0.0 0.02 0.03 0.03 0.05 0.03
0.16 0.35 0.51 0.4 0.29 0.28 0.34 0.36 0.33 0.34 0.37 0.42 0.1 0.37 0.48 1.0 0.36 0.45 0.42 0.39 0.37 0.18 0.51 0.49 0.36 0.52
0.05 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.05 0.18 0.01 1.0 0.03 0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.06 0.11 0.11 0.07 0.06 0.07 0.1 0.06 0.05 0.04 0.04 0.01 0.04 0.07 1.0 0.05 0.08 0.07 0.06 0.0 0.02 0.02 0.04 0.1 0.09
0.07 0.05 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.05 0.01 0.01 1.0 0.01 0.03 0.02 0.03 0.0 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02
0.04 0.05 0.05 0.06 0.07 0.1 0.1 0.1 0.13 0.12 0.11 0.11 0.04 0.32 0.13 1.0 0.11 0.1 0.11 0.1 0.01 0.06 0.05 0.05 0.06 0.07
0.05 0.06 0.07 0.08 0.08 0.09 0.15 0.14 0.18 0.16 0.15 0.12 0.05 0.3 0.11 1.0 0.11 0.11 0.09 0.09 0.01 0.09 0.07 0.08 0.12 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.03 0.0 0.05 0.03 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.02
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.06 0.1 0.11 0.05 0.03 0.05 0.05 0.02 0.03 0.03 0.05 0.06 0.04 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.18 0.01 0.02 0.09 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.33 0.2 1.0 0.35 0.15 0.11 0.13 0.42 0.25 0.7 0.63 0.42 0.39
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.34 0.21 1.0 0.38 0.22 0.15 0.13 0.36 0.18 0.54 0.51 0.34 0.38
0.03 0.06 0.09 0.12 0.17 0.18 0.22 0.22 0.17 0.17 0.16 0.13 0.04 0.12 0.1 1.0 0.25 0.12 0.1 0.09 0.0 0.07 0.11 0.08 0.09 0.08
0.0 0.01 0.03 0.04 0.04 0.06 0.05 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.0 0.22 0.03 1.0 0.03 0.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 1.0 0.03 0.08 0.05 0.02 0.11 0.02 0.01 0.0 0.02 0.04
0.24 0.31 0.33 0.33 0.33 0.34 0.37 0.36 0.41 0.41 0.36 0.35 0.26 0.26 0.23 1.0 0.23 0.33 0.22 0.31 0.15 0.25 0.3 0.23 0.26 0.23
0.01 0.03 0.07 0.1 0.15 0.2 0.19 0.19 0.27 0.2 0.19 0.15 0.01 0.1 0.16 1.0 0.1 0.11 0.1 0.09 0.01 0.2 0.21 0.12 0.17 0.13
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.25 0.18 0.12 0.12 0.15 0.18 0.31 0.3 0.34 0.32 0.26 0.21 0.22 0.18 0.19 1.0 0.2 0.33 0.24 0.19 0.07 0.1 0.24 0.24 0.2 0.16
0.27 0.17 0.08 0.06 0.1 0.2 0.27 0.29 0.35 0.29 0.24 0.18 0.23 0.15 0.17 1.0 0.17 0.23 0.2 0.18 0.06 0.06 0.18 0.18 0.16 0.11
0.07 0.08 0.11 0.1 0.06 0.04 0.06 0.08 0.09 0.09 0.1 0.11 0.05 0.08 0.05 1.0 0.05 0.05 0.04 0.05 0.01 0.2 0.04 0.09 0.1 0.12
0.02 0.02 0.04 0.06 0.05 0.03 0.03 0.04 0.02 0.03 0.04 0.07 0.03 0.18 0.03 1.0 0.06 0.05 0.03 0.05 0.71 0.04 0.21 0.18 0.24 0.18
0.03 0.01 0.02 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.59 0.08 1.0 0.05 0.13 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.1 0.07
0.14 0.19 0.14 0.1 0.05 0.05 0.1 0.15 0.17 0.19 0.18 0.16 0.13 0.15 0.12 1.0 0.09 0.11 0.11 0.12 0.03 0.06 0.15 0.1 0.1 0.1
0.06 0.04 0.06 0.06 0.08 0.08 0.09 0.1 0.08 0.1 0.11 0.13 0.05 0.24 0.13 1.0 0.1 0.13 0.15 0.11 0.07 0.03 0.14 0.13 0.12 0.12
0.16 0.14 0.18 0.21 0.26 0.29 0.25 0.23 0.21 0.21 0.2 0.16 0.15 0.12 0.09 1.0 0.13 0.17 0.17 0.2 0.04 0.11 0.11 0.12 0.21 0.18
0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.04 0.01 0.33 0.12 1.0 0.07 0.1 0.04 0.05 0.01 0.03 0.01 0.02 0.06 0.04
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.02 0.02
0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.0 0.01 0.02 1.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.05 0.04 0.03 0.06 0.03
0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02
0.13 0.13 0.21 0.27 0.31 0.26 0.25 0.18 0.22 0.33 0.36 0.46 0.18 0.5 0.28 1.0 0.34 0.25 0.29 0.49 0.01 0.29 0.05 0.43 0.29 0.61
0.06 0.09 0.17 0.05 0.07 0.04 0.13 0.05 0.07 0.07 0.04 0.16 0.01 0.14 0.19 1.0 0.02 0.22 0.21 0.56 0.02 0.13 0.15 0.3 0.13 0.23
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.55 0.35 0.12 0.0 0.0 0.49 0.73 0.53 0.23 0.09 0.09 0.18 0.14 1.0 0.87 0.34 0.77
0.14 0.0 0.01 0.03 0.04 0.03 0.06 0.06 0.06 0.24 0.44 0.29 0.13 0.07 0.24 0.61 0.34 0.02 0.03 0.04 0.34 0.16 0.77 1.0 0.47 0.5
0.23 0.01 0.01 0.03 0.05 0.09 0.09 0.1 0.14 0.42 0.57 0.52 0.25 0.13 0.52 1.0 0.51 0.04 0.04 0.04 0.27 0.17 0.81 0.93 0.55 0.7
0.05 0.0 0.01 0.03 0.03 0.05 0.05 0.03 0.06 0.14 0.18 0.14 0.02 0.12 0.08 1.0 0.04 0.02 0.0 0.02 0.04 0.01 0.06 0.05 0.03 0.1
0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.03 0.02 0.06 0.1 0.07 0.03 0.11 0.05 1.0 0.1 0.0 0.03 0.01 0.03 0.01 0.05 0.06 0.02 0.05
0.14 0.19 0.16 0.15 0.14 0.12 0.14 0.16 0.18 0.16 0.16 0.16 0.14 0.17 0.14 1.0 0.14 0.19 0.13 0.11 0.09 0.1 0.19 0.11 0.2 0.11
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.51 0.05 0.24 0.0 0.06 0.12
0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.07 0.05 0.04 0.07 0.14 0.15 0.16 0.05 0.08 0.38 1.0 0.16 0.27 0.15 0.19 0.23 0.07 0.45 0.66 0.16 0.31
0.02 0.0 0.0 0.02 0.06 0.12 0.17 0.15 0.21 0.32 0.25 0.17 0.03 0.03 0.05 1.0 0.09 0.15 0.13 0.15 0.02 0.02 0.22 0.21 0.1 0.08
0.0 0.02 0.06 0.09 0.1 0.12 0.11 0.1 0.11 0.09 0.07 0.05 0.01 0.05 0.11 1.0 0.08 0.13 0.11 0.12 0.01 0.06 0.08 0.06 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.21 0.2 0.22 0.2 0.21 0.2 0.19 0.24 0.19 0.17 0.17 0.17 0.31 0.14 0.15 0.98 0.12 0.21 0.18 0.13 1.0 0.34 0.55 0.48 0.27 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0
0.25 0.2 0.18 0.29 0.34 0.28 0.26 0.31 0.39 0.28 0.3 0.23 0.2 0.45 0.36 1.0 0.16 0.37 0.4 0.14 0.66 0.52 0.38 0.34 0.34 0.38
0.14 0.1 0.13 0.15 0.14 0.13 0.15 0.17 0.15 0.17 0.2 0.21 0.18 0.17 0.28 1.0 0.13 0.15 0.12 0.11 0.08 0.17 0.19 0.16 0.23 0.19
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.18 0.0 1.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 0.0 0.02 0.04 0.08 0.06 0.11 0.04 0.05 0.21 0.11 1.0 0.03 0.05 0.03 0.03 0.02 0.01 0.04 0.0 0.08 0.06
0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03
0.06 0.05 0.07 0.1 0.09 0.1 0.1 0.08 0.11 0.09 0.14 0.12 0.08 0.14 0.28 1.0 0.19 0.23 0.23 0.26 0.18 0.13 0.25 0.42 0.13 0.24
0.4 0.24 0.2 0.17 0.48 0.2 0.35 0.36 0.3 0.36 0.15 0.17 0.32 0.1 0.24 1.0 0.07 0.39 0.11 0.02 0.5 0.15 0.63 0.18 0.59 0.37
0.02 0.06 0.12 0.16 0.21 0.21 0.25 0.24 0.22 0.24 0.2 0.18 0.04 0.08 0.26 1.0 0.07 0.1 0.11 0.08 0.01 0.08 0.05 0.12 0.13 0.08
0.14 0.14 0.16 0.17 0.14 0.11 0.15 0.15 0.19 0.2 0.22 0.24 0.16 0.41 0.29 1.0 0.18 0.19 0.2 0.15 0.09 0.2 0.2 0.21 0.17 0.2
0.08 0.07 0.07 0.08 0.06 0.06 0.1 0.11 0.09 0.08 0.09 0.08 0.11 0.22 0.09 1.0 0.08 0.08 0.08 0.09 0.05 0.06 0.07 0.06 0.14 0.16
0.09 0.12 0.14 0.12 0.07 0.07 0.08 0.09 0.09 0.08 0.08 0.09 0.08 0.09 0.12 1.0 0.1 0.15 0.16 0.13 0.32 0.33 0.3 0.17 0.25 0.18
0.22 0.18 0.19 0.14 0.11 0.08 0.06 0.1 0.15 0.19 0.25 0.27 0.21 0.21 0.27 1.0 0.24 0.19 0.27 0.19 0.87 0.18 0.67 0.58 0.16 0.21
0.19 0.09 0.07 0.05 0.04 0.05 0.08 0.11 0.08 0.08 0.1 0.09 0.2 0.05 0.03 1.0 0.05 0.06 0.06 0.06 0.0 0.05 0.05 0.04 0.13 0.12
0.07 0.06 0.07 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.05 0.06 0.07 0.06 0.05 0.08 1.0 0.06 0.1 0.09 0.05 0.24 0.09 0.25 0.13 0.06 0.06
0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.06 0.1 0.06 0.08 0.02 0.01 0.01 0.02 0.21 0.17 1.0 0.05 0.03 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01
0.06 0.04 0.04 0.04 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)