Heatmap: Cluster_147 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G01040 (CAF)
2.7 1.22 -2.14 -0.98 -1.52 -1.5 -1.2 -2.53 -3.18 -4.31 -4.6 -2.93 -2.74 0.41 0.43 0.05 -0.17 -0.53 -0.77 0.71 -0.05 0.05 0.31 -0.51 -1.5 -0.23 0.48 -0.21 1.2 -2.06 0.37 -0.28 -0.35 -0.3 0.07 0.18 1.21 0.03 1.78 -0.76 -0.42 0.12 -0.37 -0.73 -0.36 -0.08 -0.65 -1.47
2.18 1.19 0.33 -0.24 -0.48 -1.8 0.21 -2.81 -4.34 -4.12 -4.43 -5.31 0.84 0.25 -0.84 0.04 -0.16 -0.6 -1.69 0.72 -0.6 0.01 0.1 -0.2 -0.11 0.3 -0.74 0.13 -0.27 -0.33 -0.19 -0.24 -0.38 0.63 -0.67 -0.12 0.45 0.17 1.39 -0.64 0.9 0.5 -0.25 0.65 -0.92 0.46 -7.58 -1.02
2.61 1.4 1.47 1.36 1.56 0.47 1.15 -4.66 -4.64 -5.49 -4.11 - -4.4 0.17 0.67 -0.59 -0.12 -0.73 -2.42 0.57 0.21 -0.29 -0.2 -0.17 -7.28 -0.54 -1.26 -5.17 1.41 - 0.38 -3.08 -1.34 -3.73 -0.27 -0.33 1.39 0.2 0.63 -6.68 - -0.66 -0.8 -3.2 -1.17 - 1.18 -2.63
AT1G04050 (SDG13)
4.15 0.88 0.31 0.33 -0.64 -2.49 -0.24 -3.88 -4.85 -4.5 -4.51 -0.22 -4.03 -0.67 -0.92 -2.72 -2.23 -2.91 -0.24 0.74 -0.59 -1.15 -0.07 -1.02 -4.66 -1.4 -3.36 0.27 -1.74 -4.53 0.49 -1.95 -2.08 -1.92 1.27 -0.54 -0.89 -0.84 -3.62 -5.2 - -1.75 -2.06 0.67 -1.07 -7.77 2.22 -0.81
1.42 0.55 0.48 1.14 0.52 -0.58 0.9 -4.15 -4.06 -5.39 -5.3 -1.31 -3.32 0.16 0.42 0.15 0.25 0.01 -1.16 0.48 0.45 0.02 0.49 0.08 -1.78 -0.05 -0.17 0.62 0.51 -2.09 0.33 0.23 -0.28 -0.13 0.43 0.24 0.05 0.29 -0.23 -0.31 -1.76 0.16 0.2 0.63 -0.27 -0.36 -0.85 -0.05
0.91 0.64 -0.94 2.08 -0.58 -1.54 2.08 -3.13 -1.09 -4.4 -1.79 -4.88 -3.76 0.35 1.19 -0.08 0.34 -0.83 -0.98 0.54 0.26 -0.05 0.13 -0.33 -0.28 -0.24 0.13 0.38 -1.66 -0.01 -0.08 -0.36 -0.4 -0.24 -0.2 -0.27 1.55 0.41 1.2 -1.43 - -0.49 -0.53 0.25 -0.73 - -7.26 -0.54
2.08 0.32 -0.76 -1.97 -0.58 -0.99 -1.87 -0.56 -1.3 -1.35 -1.24 -5.62 -6.86 0.08 0.56 0.09 -0.0 -1.31 0.02 0.52 0.03 -0.1 0.38 -0.26 -0.99 0.23 -0.34 -0.5 0.67 -0.28 -1.01 -0.22 -0.23 0.36 -1.05 0.35 1.44 0.14 1.92 -1.3 2.44 -1.04 -1.27 -0.41 -1.69 -4.11 -2.62 -1.85
3.72 -0.95 0.39 -0.15 -0.93 -1.69 -0.35 -0.57 -0.14 -1.72 -0.56 2.48 -0.4 -2.82 -2.44 -5.58 -5.46 -5.61 -1.83 -1.78 -2.17 -3.67 -2.51 -2.52 -1.02 -3.56 -3.76 -0.88 1.27 -1.86 -1.25 -2.6 -3.09 -1.3 -2.31 -3.22 -3.54 -2.78 -3.79 -0.7 0.11 1.23 -1.17 -1.61 -0.53 2.56 1.49 -2.95
1.49 0.6 0.5 1.13 0.49 0.63 1.15 -0.93 -1.39 -4.39 -3.63 -2.89 -2.65 0.22 0.23 -0.34 -0.28 -0.57 -1.4 0.6 0.2 -0.21 0.16 -0.23 -1.12 -0.27 -0.18 0.13 0.59 -1.32 0.43 -0.03 -0.52 -0.15 -0.13 0.11 0.42 0.02 0.28 -0.86 -0.16 -0.75 0.31 0.25 0.01 0.82 -1.26 -0.42
1.35 -0.35 1.28 1.57 1.47 1.66 1.47 -0.05 -0.28 -1.85 -1.27 -1.71 -3.17 -0.71 0.78 -1.32 -0.67 -0.87 -1.7 -0.43 -0.34 -1.17 -0.81 -0.82 -1.56 -1.1 -1.47 -1.03 0.8 -1.06 -0.56 -0.67 -0.86 -0.33 -0.73 -0.49 -0.29 -0.41 0.25 0.08 -2.64 0.2 0.57 0.38 -0.64 1.28 -0.85 -0.03
1.12 0.6 -3.47 -2.93 -3.22 -5.08 -3.47 -9.96 - -10.19 -10.08 - -10.88 0.23 1.01 0.35 0.9 -0.17 -1.9 0.79 -0.27 0.29 0.14 0.18 -1.54 0.26 -1.77 0.21 2.28 -1.93 0.73 0.48 0.26 -0.0 -0.03 -0.18 1.38 0.14 1.27 -1.43 -1.92 -0.85 -0.34 -0.11 0.01 2.15 -4.02 -0.74
AT1G31280 (AGO2)
3.5 0.45 -0.71 -0.08 -0.58 -1.43 -0.31 -5.88 -5.08 -7.65 -4.94 -8.53 -8.87 -0.23 -0.82 -0.98 -0.61 -1.22 -0.76 0.05 -0.63 -1.43 -0.64 -0.28 -0.19 -0.77 -0.29 -0.18 2.61 -1.25 1.08 -0.91 -1.52 -1.09 -0.42 -0.63 -0.32 -0.98 -0.36 -2.76 0.79 -0.39 -1.15 -0.82 -1.14 -4.76 1.84 -1.49
AT1G50300 (TAF15)
1.81 0.58 0.99 -0.11 0.51 -0.44 -0.31 -3.83 -3.67 -4.37 -3.91 -5.5 -5.29 -0.16 0.08 -0.57 -0.58 -0.96 -1.01 0.89 -0.54 0.02 0.52 -0.51 -1.24 -0.64 -1.21 0.88 2.0 -1.25 0.34 0.24 -0.11 -0.17 0.61 -0.23 0.29 0.1 0.28 -1.74 -1.85 -0.57 0.02 1.5 -0.01 -7.87 0.71 0.21
1.39 0.89 -0.27 -0.83 -0.36 -0.39 -0.42 -0.03 -0.59 -1.76 -1.13 1.28 -1.89 0.26 -0.96 -0.39 -0.02 -0.68 -0.72 0.64 -0.24 -0.37 -0.29 -0.5 -0.81 -0.46 0.2 -0.0 0.11 -0.15 -0.15 -0.39 -0.5 0.28 -0.29 -0.32 0.49 0.33 1.43 -2.78 -1.12 0.92 0.53 -0.05 -0.21 1.5 -2.68 -0.77
0.66 0.8 1.22 1.44 1.42 0.43 1.47 -5.62 -4.05 -6.17 -3.71 -6.39 -8.73 0.14 -0.32 -0.58 -0.47 0.02 -1.5 0.59 -0.12 -0.13 0.32 -0.35 -0.81 -0.51 -0.88 0.29 1.34 -0.33 0.28 0.01 -0.68 -0.4 0.58 -0.69 0.29 -0.21 0.02 -4.66 -1.8 -0.33 -0.26 0.82 -0.41 0.95 -12.15 0.05
1.71 1.03 -0.27 1.45 -0.04 -0.51 0.92 -1.82 -2.4 -5.13 -4.36 - -3.15 0.59 0.42 -0.05 0.11 -0.46 -1.47 0.5 -0.1 0.25 0.27 -0.07 -2.12 0.25 0.28 -0.21 1.87 -3.57 0.42 -0.07 -0.56 -0.65 -0.02 0.39 0.46 -0.06 0.77 -0.56 -1.84 -0.22 0.14 0.46 0.17 - - -0.69
1.56 1.85 -0.26 0.52 0.49 0.86 0.2 -2.24 -2.62 -5.51 -5.49 - -3.01 1.34 -0.05 -0.23 0.24 -1.15 -2.43 0.57 -0.91 0.12 -0.06 -0.15 -4.85 0.16 0.0 -0.08 -0.88 -2.39 0.05 -0.32 0.16 -0.05 -0.75 -0.12 0.49 0.77 1.56 - - 0.41 1.26 1.21 -1.55 - -7.4 0.5
2.39 0.81 0.69 0.25 0.05 -1.4 -0.0 -4.03 -3.09 -5.01 -3.85 -7.79 -3.9 0.09 -0.79 -0.33 -0.24 -0.82 -1.05 0.49 -0.29 -0.42 0.12 -0.57 -0.87 -0.52 0.44 0.35 1.65 -0.75 0.14 -0.42 -0.51 -0.47 0.07 -0.67 0.4 -0.19 0.61 -0.81 0.83 -0.04 -0.7 0.49 -0.33 -0.29 1.33 -0.66
AT1G74180 (RLP14)
2.87 1.75 0.09 -0.36 -0.15 -1.65 -0.13 -4.0 -3.56 -6.6 -4.1 -3.19 -3.87 0.65 -0.5 0.33 -0.08 -0.32 -1.38 1.23 -0.19 0.8 0.79 -0.54 -1.97 -0.32 -0.07 0.41 0.77 -2.23 0.26 -0.42 -0.36 -0.06 0.24 0.23 0.59 0.16 0.65 -0.53 -2.95 -0.74 -1.03 0.46 -0.8 - - -0.88
1.56 1.45 -2.3 -2.23 -1.95 -3.02 -2.16 -4.04 -3.5 -6.04 -4.8 -1.73 -2.88 0.41 -1.49 0.07 0.08 -0.02 -1.57 0.71 0.37 -0.13 -0.4 0.44 -1.53 0.41 -0.6 -0.79 0.71 -1.17 0.41 -0.62 0.29 1.3 -1.06 0.77 0.75 0.39 2.12 -0.01 0.95 1.01 -0.08 -0.31 -0.36 0.36 -1.4 -1.79
1.26 0.41 0.52 0.3 0.29 0.06 0.23 0.03 -0.13 -0.47 -0.31 -5.37 -1.51 0.13 -0.37 -0.11 0.37 -0.09 -0.13 0.46 0.16 -0.21 0.35 -0.12 -0.33 -0.18 0.75 -0.17 -1.01 -0.62 0.42 0.11 -0.79 -0.55 -0.1 0.36 0.33 -0.15 0.06 -1.91 -2.03 0.23 0.27 0.26 0.13 1.19 -3.41 -0.32
1.11 0.36 1.2 1.27 1.14 0.58 1.17 -0.72 -1.42 -2.54 -2.29 -0.41 -1.92 -0.03 -1.02 -0.03 0.47 0.21 -0.69 0.33 -0.05 -0.3 0.04 0.06 -1.4 0.07 0.21 -0.72 -0.66 -1.91 0.36 0.15 -0.92 -0.32 0.0 0.31 0.53 0.12 -0.13 -2.29 -1.56 0.03 0.76 -0.04 0.32 -1.21 -1.83 0.14
1.37 0.95 -0.34 -0.45 -0.4 -1.2 -0.63 -2.94 -3.09 -4.49 -4.46 -1.08 -2.75 0.59 1.19 0.08 -0.25 -0.64 -1.47 0.86 -0.26 0.11 0.26 -0.09 -0.56 -0.13 0.34 0.1 0.95 -0.64 -0.08 -0.08 -0.43 -0.15 0.15 0.05 0.45 0.38 1.46 -0.81 -0.01 0.24 0.14 0.2 -0.47 0.21 0.44 -0.37
0.45 1.0 0.54 0.79 0.75 0.32 0.63 -2.98 -5.41 -5.57 -6.14 - - 0.58 -0.54 -0.11 0.16 -0.43 -1.5 0.89 -0.23 0.29 0.42 -0.21 -1.74 -0.26 0.3 0.69 -0.02 -1.6 0.4 0.36 -0.39 -0.03 0.58 -0.39 0.48 0.28 1.09 -1.21 0.09 0.0 0.29 1.34 0.06 - - 0.5
1.6 0.27 0.8 0.96 0.8 0.86 0.94 -0.41 -1.1 -3.63 -2.87 -6.97 -2.43 -0.15 -1.31 -0.06 0.31 0.16 -1.11 0.2 -0.15 -0.1 0.25 -0.27 -2.55 -0.22 -0.49 0.24 0.02 -3.22 0.27 -0.0 -0.75 -0.49 0.07 0.33 -0.33 -0.2 -0.81 -2.97 -3.12 0.48 0.68 -0.21 0.34 2.22 -13.18 -0.36
1.4 0.86 1.49 0.82 0.82 -0.65 0.83 -1.97 -4.0 -4.92 -4.72 - -8.54 0.06 -1.04 -0.56 -1.12 -1.51 -1.09 0.88 -0.89 -0.15 0.07 -0.03 -1.98 0.35 -1.75 0.74 -0.23 -1.29 0.47 0.17 -0.27 0.28 0.36 -0.24 0.71 0.24 1.6 -2.77 -5.83 -1.01 -0.5 1.31 -0.26 1.07 -0.82 -0.01
AT2G26350 (PEX10)
-1.52 0.66 0.62 0.65 0.39 -0.17 0.8 -1.7 -2.42 -3.84 -3.35 -6.83 -6.42 0.31 -0.78 0.22 0.28 -0.43 -0.81 0.58 -0.05 -0.01 0.14 -0.22 0.93 -0.09 0.66 -0.05 -0.7 0.88 0.17 0.82 -0.42 0.09 0.03 -0.01 1.0 0.24 0.89 -1.22 -1.29 0.79 0.19 0.48 -0.38 -0.84 -0.35 -0.74
AT2G30910 (ARPC1)
0.8 0.43 0.66 1.53 0.99 1.15 1.67 -0.06 -0.94 -2.96 -3.22 -3.49 -4.07 0.02 -0.95 -0.32 0.11 -0.22 -1.48 0.39 -0.58 -0.18 0.35 -0.27 -2.45 -0.32 -0.34 -0.44 -0.03 -2.92 -0.05 -0.04 -0.91 -0.35 -0.05 0.22 0.17 -0.06 -0.24 -1.96 -2.86 -0.55 0.77 0.74 0.21 1.45 -11.51 0.38
AT2G33540 (CPL3)
2.08 0.49 -0.34 -0.02 -0.38 -0.85 -0.03 -2.1 -2.4 -3.43 -3.38 -5.38 -3.51 0.33 0.38 0.05 0.08 -0.27 -1.13 0.11 0.2 0.1 0.51 -0.53 -2.31 -0.31 -0.47 0.64 1.5 -2.37 -0.26 -0.07 0.07 -0.09 0.0 0.82 0.5 -0.05 1.43 -1.27 1.41 0.28 -0.08 -0.26 0.41 -1.6 - -0.85
2.37 -0.28 -0.01 -0.32 -0.61 -0.41 -0.21 -0.01 0.07 0.07 0.17 1.13 -1.7 -0.03 -0.01 -0.35 -0.35 -0.68 -0.0 -0.53 -1.05 -0.73 -0.92 -1.23 -1.77 -0.98 0.74 0.24 0.19 -2.41 -1.02 -1.06 -0.46 -0.18 -1.48 -1.17 0.31 -0.57 1.1 0.27 0.31 -0.17 -0.66 -0.84 -1.06 0.86 1.86 -1.23
AT2G44750 (TPK2)
0.75 0.82 0.84 0.77 1.11 0.74 0.91 -0.23 0.11 -1.29 -0.4 1.56 -0.05 -0.02 -1.25 -0.14 0.32 -0.6 -0.46 0.3 0.03 -0.59 -0.56 -0.48 -0.91 -0.45 -0.12 -0.76 -0.33 -0.76 -0.42 0.15 -0.99 -0.81 -0.84 -0.28 0.89 0.03 1.35 -1.94 -1.22 -0.93 -0.68 0.66 -0.92 -1.51 -5.25 -0.26
2.37 0.58 -1.96 -2.27 -2.11 -3.57 -2.96 -7.46 -6.75 -7.57 - -9.04 -5.35 0.56 0.38 0.15 -0.13 0.19 -0.57 0.25 -0.82 0.03 0.29 -0.38 -1.12 -0.12 0.66 -0.42 -0.23 -1.05 -0.52 -0.2 0.4 0.7 0.74 0.09 1.42 0.75 1.72 -0.73 -4.19 -0.04 -0.11 0.25 -0.37 0.7 1.03 -0.2
AT3G07740 (HXA2)
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AT3G28970 (AAR3)
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AT3G54230 (SUA)
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AT3G56450 (ALPHA-SNAP1)
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AT4G12570 (UPL5)
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AT4G15410 (PUX5)
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AT4G16280 (FCA)
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AT4G29860 (TAN)
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AT4G32850 (nPAP)
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AT5G45150 (RTL3)
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AT5G47080 (CKB1)
1.47 0.55 1.61 1.56 1.17 0.18 1.47 -1.86 -1.88 -3.83 -2.44 -10.24 -1.65 0.02 0.33 -0.75 -0.63 -1.25 -1.61 0.29 -0.62 -0.66 -0.03 -0.75 -0.15 -0.91 0.23 0.16 0.38 0.11 -0.41 0.06 -0.72 -0.45 -0.63 -0.78 0.55 -0.15 0.34 -1.43 -0.7 -0.1 -0.21 1.28 -0.13 -6.76 -0.87 0.43
2.07 0.49 1.21 0.94 0.44 -0.8 0.71 -2.27 -2.9 -4.93 -4.45 -1.77 -1.94 0.0 -0.52 -1.36 -1.25 -0.75 -0.2 0.48 -0.4 -0.81 0.01 -0.57 -0.59 -1.04 -1.69 1.27 1.12 0.22 0.82 0.06 -0.73 -0.59 0.89 -1.08 -0.42 -0.2 -0.29 -1.82 -0.85 -0.73 -0.65 1.05 0.23 -1.7 1.27 0.22
2.22 0.73 0.69 0.11 0.25 -0.62 0.04 -2.28 -2.5 -3.24 -2.93 -2.19 -5.57 0.12 -0.62 -0.28 -0.07 -0.55 -0.35 0.47 -0.09 -0.43 -0.05 -0.52 -0.38 -0.39 0.57 0.48 0.21 -0.39 0.04 0.02 -0.46 -0.0 -0.16 -0.24 0.73 -0.14 1.25 0.14 -0.7 -0.11 0.34 0.57 -0.06 -0.35 -0.39 -0.2
1.73 0.38 0.07 0.03 -0.28 -1.1 -0.17 -0.11 0.14 -0.24 0.15 -3.65 -1.81 0.21 -0.16 -0.16 -0.12 -0.37 0.06 -0.0 -0.44 -0.05 0.18 -0.53 -1.19 -0.19 0.64 0.66 0.35 -1.66 -0.39 -0.16 -0.39 -0.21 -0.56 -0.22 0.34 -0.09 0.46 -0.04 0.37 0.57 0.7 0.41 0.35 -0.61 -0.71 -0.17
AT5G61930 (APO3)
2.21 0.67 0.34 0.98 1.03 0.91 1.2 -2.58 -2.28 -4.46 -3.19 -6.12 - 0.2 0.47 0.25 -0.34 -0.37 -1.41 0.45 -0.37 0.07 0.62 -0.28 -0.96 -0.3 0.07 -0.17 0.82 -1.21 0.06 0.12 -0.49 -0.53 0.57 -0.42 0.78 0.15 0.55 -4.07 -2.86 -1.23 -0.14 0.54 -0.32 - -2.19 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.