1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_129 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.65 0.58 0.47 0.42 0.45 0.4 0.4 0.56 0.69 0.76 0.84 1.0 0.33 0.19 0.32 0.44 0.32 0.26 0.65 0.15 0.64 0.42 0.42 0.51 0.6 0.56 0.52 0.51 0.69 0.73 0.42 0.41
1.0 0.89 0.67 0.65 0.62 0.6 0.57 0.57 0.61 0.68 0.72 0.81 0.16 0.29 0.18 0.34 0.58 0.52 0.47 0.41 0.81 0.11 0.47 0.39 0.61 0.28 0.32 0.38 0.57 0.59 0.7 0.76
0.64 0.93 0.94 0.76 0.6 0.57 0.66 0.67 0.68 0.86 0.83 1.0 0.14 0.06 0.04 0.21 0.52 0.45 0.59 0.03 0.62 0.0 0.16 0.1 0.27 0.28 0.39 0.43 0.47 0.44 0.3 0.13
0.58 0.38 0.25 0.26 0.23 0.23 0.26 0.35 0.47 0.48 0.56 0.59 0.19 0.12 0.15 0.32 0.14 0.04 0.37 0.45 0.34 0.01 0.18 0.22 0.47 1.0 0.46 0.34 0.21 0.24 0.37 0.52
1.0 0.55 0.27 0.3 0.19 0.26 0.21 0.28 0.33 0.43 0.64 1.0 0.05 0.05 0.15 0.23 0.22 0.17 0.52 0.0 0.34 0.26 0.11 0.07 0.51 0.75 0.68 0.58 0.43 0.51 0.24 0.39
0.51 0.45 0.37 0.36 0.38 0.34 0.38 0.42 0.44 0.52 0.47 0.58 0.3 0.21 0.15 0.35 0.3 0.35 0.49 0.56 1.0 0.45 0.33 0.31 0.61 0.4 0.13 0.16 0.35 0.37 0.2 0.19
0.6 0.49 0.45 0.48 0.08 0.3 0.29 0.2 0.34 0.51 0.42 0.62 0.4 0.39 0.3 0.55 0.36 0.41 0.44 1.0 0.08 0.36 0.44 0.45 0.18 0.27 0.15 0.52 0.26 0.26 0.19 0.16
1.0 0.95 0.78 0.61 0.5 0.44 0.45 0.47 0.54 0.56 0.65 0.73 0.4 0.35 0.27 0.39 0.4 0.43 0.59 0.01 0.45 0.03 0.24 0.25 0.23 0.52 0.48 0.51 0.43 0.41 0.37 0.38
1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.13 0.0 0.34 0.0 0.03 0.02 0.06 0.0 0.06 0.05 0.09 0.08 0.12 0.07
0.32 0.29 0.31 0.31 0.33 0.42 0.44 0.53 0.44 0.46 0.42 0.41 0.24 0.38 0.15 0.32 0.25 0.23 0.32 0.46 1.0 0.19 0.22 0.24 0.69 0.26 0.25 0.24 0.34 0.36 0.56 0.49
0.94 1.0 0.93 0.71 0.6 0.52 0.5 0.5 0.58 0.68 0.79 0.98 0.3 0.43 0.3 0.34 0.36 0.31 0.31 0.16 0.6 0.1 0.32 0.24 0.15 0.61 0.36 0.42 0.47 0.46 0.42 0.4
0.92 0.5 0.33 0.37 0.35 0.34 0.35 0.48 0.55 0.59 0.74 0.98 0.26 0.37 0.25 0.33 0.37 0.42 0.48 0.14 0.67 0.17 0.3 0.27 0.7 1.0 0.6 0.58 0.62 0.61 0.69 0.82
0.79 0.75 0.67 0.66 0.69 0.57 0.61 0.7 0.79 0.75 0.77 0.9 0.03 0.19 0.13 0.25 0.54 0.32 0.72 0.24 0.75 0.14 0.23 0.21 1.0 0.77 0.61 0.65 0.61 0.62 0.53 0.47
1.0 0.24 0.13 0.14 0.11 0.11 0.13 0.13 0.13 0.21 0.38 0.78 0.12 0.1 0.1 0.12 0.09 0.14 0.35 0.51 0.43 0.23 0.14 0.11 0.11 0.11 0.07 0.06 0.28 0.29 0.26 0.21
0.51 0.4 0.36 0.41 0.39 0.4 0.42 0.38 0.56 0.59 0.49 0.68 0.02 0.1 0.04 0.05 0.49 0.33 0.12 0.53 1.0 0.11 0.19 0.12 0.7 0.34 0.32 0.28 0.43 0.37 0.45 0.47
0.64 0.56 0.52 0.52 0.52 0.56 0.6 0.63 0.67 0.62 0.67 0.67 0.05 0.15 0.07 0.09 0.46 0.44 0.22 0.61 1.0 0.44 0.25 0.22 0.52 0.58 0.62 0.63 0.43 0.4 0.38 0.39
0.78 0.67 0.58 0.58 0.56 0.51 0.58 0.82 0.79 0.86 0.81 0.94 0.02 0.05 0.01 0.06 0.37 0.26 0.3 0.19 0.69 0.09 0.25 0.16 1.0 0.33 0.38 0.39 0.46 0.42 0.24 0.19
0.38 0.32 0.28 0.27 0.23 0.22 0.21 0.22 0.25 0.26 0.3 0.38 0.0 0.04 0.01 0.03 0.23 0.22 0.08 0.42 1.0 0.04 0.16 0.13 0.72 0.23 0.19 0.2 0.2 0.17 0.21 0.22
0.86 0.78 0.69 0.59 0.57 0.62 1.0 0.74 0.86 0.85 0.87 0.85 0.09 0.34 0.37 0.21 0.61 0.4 0.34 0.37 0.82 0.42 0.18 0.21 0.71 0.87 0.44 0.53 0.59 0.68 0.31 0.33
1.0 0.46 0.36 0.25 0.19 0.15 0.14 0.17 0.25 0.4 0.54 0.77 0.41 0.08 0.02 0.3 0.24 0.42 0.26 0.18 0.64 0.06 0.31 0.33 0.43 0.3 0.12 0.13 0.31 0.36 0.3 0.27
0.61 0.47 0.44 0.56 0.47 0.47 0.53 0.42 0.59 0.59 0.61 0.69 0.46 0.3 0.25 0.47 0.35 0.27 0.45 0.47 0.19 0.66 0.48 0.38 1.0 0.7 0.37 0.41 0.37 0.39 0.31 0.27
1.0 0.59 0.52 0.48 0.52 0.54 0.6 0.8 0.87 0.91 0.98 0.87 0.14 0.21 0.13 0.42 0.47 0.5 0.91 0.44 0.54 0.38 0.52 0.52 0.61 0.96 0.48 0.48 0.69 0.67 0.51 0.5
0.88 1.0 0.83 0.76 0.75 0.62 0.62 0.56 0.61 0.72 0.68 0.81 0.26 0.32 0.13 0.32 0.29 0.35 0.48 0.26 0.6 0.13 0.34 0.25 0.49 0.37 0.31 0.33 0.47 0.5 0.37 0.41
0.61 0.52 0.57 0.53 0.52 0.61 0.54 0.51 0.56 0.54 0.54 0.55 0.29 0.39 0.32 0.29 0.58 0.65 0.41 0.53 1.0 0.36 0.45 0.4 0.94 0.27 0.41 0.52 0.55 0.57 0.35 0.35
0.91 0.76 0.57 0.45 0.33 0.31 0.35 0.52 0.61 0.73 0.81 1.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.54 0.37 0.43 0.39 0.68 0.04 0.33 0.29 0.96 0.49 0.19 0.23 0.83 0.79 0.74 0.67
0.85 0.57 0.51 0.52 0.52 0.47 0.51 0.6 0.76 0.89 0.88 1.0 0.08 0.06 0.05 0.17 0.44 0.36 0.29 0.49 0.93 0.3 0.31 0.26 0.77 0.89 0.42 0.45 0.56 0.55 0.46 0.53
0.78 0.45 0.44 0.59 0.45 0.52 0.47 0.61 0.63 0.71 0.61 0.79 0.1 0.15 0.07 0.2 0.58 0.22 0.88 0.09 0.79 0.0 0.45 0.42 0.63 0.83 1.0 0.9 0.55 0.67 0.6 0.86
1.0 0.53 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.4 0.1 0.09 0.04 0.03 0.03 0.04 0.06 0.05 0.14 0.62 0.12 0.09 0.25 0.21 0.12 0.09 0.19 1.0 0.13 0.03 0.06 0.05 0.02 0.03 0.05 0.06 0.12 0.13 0.11 0.13
0.58 0.44 0.27 0.19 0.06 0.18 0.09 0.27 0.22 0.19 0.61 0.73 0.01 0.08 0.32 0.04 0.14 0.15 0.63 1.0 0.33 0.3 0.07 0.02 0.46 0.22 0.27 0.42 0.07 0.07 0.1 0.06
1.0 0.75 0.5 0.34 0.25 0.15 0.1 0.12 0.12 0.18 0.35 0.72 0.29 0.23 0.06 0.4 0.35 0.22 0.38 0.56 0.86 0.21 0.32 0.33 0.64 0.45 0.33 0.38 0.37 0.37 0.28 0.26
0.68 0.08 0.1 0.05 0.06 0.03 0.07 0.04 0.08 0.19 0.4 0.58 0.2 0.12 0.06 0.1 0.0 0.0 0.1 0.4 0.37 0.06 0.0 0.04 0.14 1.0 0.08 0.01 0.01 0.02 0.08 0.02
0.89 0.51 0.45 0.35 0.34 0.36 0.53 0.64 0.69 0.82 0.8 0.95 0.01 0.04 0.07 0.03 0.32 0.33 0.2 0.13 0.78 0.01 0.2 0.12 1.0 0.39 0.33 0.39 0.53 0.47 0.25 0.19
0.6 0.13 0.34 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.5 0.71 0.1 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.17 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.59 0.34 0.44 0.59 0.35 0.32 0.38 0.43 0.45 0.59 0.68 0.01 0.07 0.15 0.06 0.22 0.04 0.33 0.15 0.36 0.21 0.11 0.3 0.93 0.38 0.4 0.49 0.54 0.5 0.35 0.22
0.53 0.33 0.32 0.27 0.21 0.24 0.28 0.39 0.39 0.45 0.55 0.59 0.25 0.25 0.22 0.27 0.22 0.43 0.37 0.58 1.0 0.69 0.31 0.37 0.35 0.87 0.36 0.29 0.38 0.37 0.39 0.5
0.61 0.55 0.56 0.42 0.27 0.25 0.19 0.33 0.39 0.5 0.68 1.0 0.31 0.11 0.07 0.38 0.39 0.13 0.5 0.26 0.45 0.02 0.57 0.64 0.76 0.75 0.39 0.38 0.62 0.56 0.42 0.34
0.38 0.47 0.47 0.49 0.37 0.33 0.38 0.43 0.43 0.47 0.59 0.68 0.27 0.1 0.07 0.17 0.41 0.15 0.38 0.31 0.51 0.04 0.45 0.45 1.0 0.5 0.58 0.62 0.43 0.41 0.12 0.08
0.91 0.51 0.36 0.23 0.22 0.28 0.28 0.44 0.5 0.5 0.69 0.99 0.02 0.02 0.03 0.06 0.31 0.41 0.18 0.31 0.72 0.09 0.22 0.13 1.0 0.21 0.44 0.4 0.43 0.44 0.33 0.34
0.86 0.85 0.49 0.35 0.22 0.11 0.13 0.11 0.18 0.28 0.42 0.64 0.0 0.01 0.0 0.02 0.46 0.88 0.46 0.49 1.0 0.0 0.2 0.11 0.95 0.21 0.18 0.21 0.71 0.63 0.29 0.27
0.27 0.25 0.35 0.37 0.36 0.35 0.42 0.48 0.47 0.5 0.42 0.35 0.25 0.11 0.05 0.23 0.36 0.19 0.26 0.49 1.0 0.11 0.32 0.36 0.83 0.4 0.21 0.25 0.4 0.37 0.25 0.25
1.0 0.7 0.59 0.57 0.63 0.66 0.66 0.61 0.78 0.85 0.78 0.87 0.16 0.19 0.27 0.26 0.43 0.37 0.53 0.07 0.37 0.03 0.37 0.38 0.14 0.24 0.27 0.27 0.53 0.54 0.59 0.57
0.65 0.55 0.37 0.29 0.25 0.2 0.19 0.2 0.25 0.29 0.32 0.44 0.04 0.11 0.08 0.13 0.29 0.27 0.29 0.72 1.0 0.14 0.22 0.22 0.56 0.29 0.21 0.23 0.32 0.31 0.32 0.28
0.61 0.68 0.66 0.66 0.7 0.79 0.61 0.42 0.43 0.43 0.42 0.44 0.16 0.44 0.54 0.25 0.75 0.81 0.56 0.74 1.0 0.53 0.45 0.3 0.69 0.15 0.44 0.49 0.53 0.53 0.39 0.46
0.57 0.5 0.54 0.6 0.56 0.55 0.48 0.57 0.67 0.66 0.65 0.55 0.85 0.42 0.23 0.81 0.51 0.36 0.92 0.79 0.95 0.78 0.38 0.49 0.65 1.0 0.31 0.3 0.5 0.47 0.37 0.31
0.73 0.66 0.5 0.45 0.4 0.52 0.36 0.44 0.51 0.47 0.45 0.61 0.1 0.15 0.08 0.13 0.55 0.38 0.35 0.45 1.0 0.26 0.33 0.23 0.47 0.31 0.5 0.51 0.45 0.44 0.25 0.25
0.56 0.18 0.09 0.08 0.06 0.04 0.04 0.03 0.05 0.12 0.05 0.19 0.1 0.02 0.02 0.22 0.08 0.12 0.06 0.07 0.07 0.03 0.07 0.04 1.0 0.04 0.0 0.08 0.12 0.13 0.02 0.03
0.55 0.56 0.33 0.23 0.2 0.2 0.21 0.22 0.23 0.31 0.38 0.65 0.22 0.2 0.09 0.3 0.27 0.13 0.25 0.17 0.52 0.07 0.23 0.26 1.0 0.29 0.39 0.51 0.32 0.31 0.11 0.08
0.45 0.36 0.6 0.48 0.46 0.53 0.63 0.75 0.71 0.6 0.62 0.45 0.12 0.16 0.37 0.16 0.79 0.68 0.37 0.36 0.71 0.77 0.42 0.38 0.52 0.49 0.92 1.0 0.78 0.75 0.56 0.42
0.27 0.26 0.2 0.26 0.2 0.25 0.22 0.24 0.2 0.22 0.2 0.27 0.04 0.07 0.03 0.08 0.25 0.24 0.14 0.41 1.0 0.05 0.16 0.12 0.79 0.12 0.17 0.22 0.28 0.28 0.22 0.17
0.86 0.62 0.49 0.58 0.41 0.37 0.55 0.52 0.69 0.71 0.83 0.88 0.53 0.35 0.23 0.58 0.37 0.12 0.45 0.43 0.43 0.15 0.36 0.45 1.0 0.69 0.49 0.54 0.49 0.52 0.37 0.3
0.49 0.5 0.49 0.38 0.33 0.36 0.35 0.36 0.44 0.36 0.41 0.41 0.01 0.04 0.02 0.01 0.44 0.59 0.1 0.48 1.0 0.32 0.15 0.07 0.69 0.09 0.45 0.43 0.33 0.28 0.18 0.17
0.64 0.47 0.31 0.34 0.33 0.27 0.2 0.29 0.38 0.4 0.5 0.75 0.41 0.58 0.2 0.51 0.29 0.24 0.7 0.77 0.83 0.05 0.42 0.45 0.65 1.0 0.39 0.36 0.45 0.47 0.26 0.35
1.0 0.89 0.59 0.41 0.27 0.16 0.05 0.05 0.03 0.07 0.17 0.63 0.02 0.01 0.0 0.12 0.33 0.38 0.37 0.42 0.71 0.02 0.25 0.25 0.56 0.25 0.12 0.23 0.22 0.21 0.19 0.17
1.0 0.8 0.48 0.35 0.17 0.14 0.07 0.09 0.12 0.25 0.36 0.89 0.02 0.06 0.01 0.16 0.63 0.66 0.54 0.06 0.63 0.01 0.4 0.37 0.75 0.54 0.13 0.19 0.48 0.43 0.41 0.25
0.59 0.49 0.49 0.51 0.6 0.56 0.57 0.67 0.63 0.59 0.66 0.6 0.11 0.19 0.4 0.19 0.85 0.6 0.41 0.55 1.0 0.58 0.47 0.33 0.33 0.37 0.75 0.99 0.7 0.7 0.64 0.53
0.93 0.73 0.72 0.67 0.7 0.6 0.6 0.8 0.76 0.77 0.82 1.0 0.15 0.21 0.38 0.24 0.41 0.36 0.41 0.13 0.52 0.01 0.41 0.42 0.36 0.47 0.55 0.55 0.5 0.51 0.59 0.61
1.0 0.57 0.35 0.27 0.24 0.23 0.23 0.25 0.24 0.21 0.26 0.51 0.0 0.04 0.03 0.01 0.3 0.39 0.69 0.4 0.57 0.04 0.26 0.29 0.56 0.18 0.3 0.28 0.38 0.39 0.21 0.2
1.0 0.67 0.51 0.46 0.4 0.44 0.33 0.33 0.35 0.32 0.38 0.46 0.12 0.21 0.09 0.15 0.27 0.43 0.54 0.3 0.64 0.07 0.31 0.28 0.62 0.27 0.29 0.23 0.57 0.53 0.34 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)