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Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.25 -0.08 0.3 0.41 0.33 -0.21 0.53 0.75 0.91 1.11 0.89 0.63 -0.05 -0.02 1.12 0.16 -0.84 -1.47 -0.87 - - - -0.76 -1.07 - 1.29 -0.0 -0.31 -0.59 -0.58 -0.62 -0.08
-0.16 -0.3 -0.52 -0.18 -0.12 -0.08 -0.07 0.37 0.34 0.33 0.3 0.16 0.3 0.32 0.72 0.45 -0.54 -0.89 0.26 -1.73 0.04 -1.83 -0.34 -0.0 -0.32 0.91 0.41 0.39 -0.27 -0.24 -0.4 -0.61
-0.07 0.21 0.41 0.42 0.06 -0.07 0.21 0.67 0.79 0.92 0.73 0.58 -0.01 0.81 1.82 0.01 -0.98 -2.25 -0.85 -4.06 -4.03 -1.19 -1.77 -1.69 -2.16 0.71 -0.56 -0.86 -1.03 -0.93 -0.15 -0.03
-0.04 0.2 0.08 0.21 0.16 0.11 0.04 0.23 -0.03 0.28 0.02 0.02 -0.38 -0.21 0.11 0.12 -0.52 -1.17 0.63 -1.12 -0.02 -2.05 -0.07 0.15 0.28 0.4 0.38 0.52 -0.14 -0.12 -0.02 -0.43
-0.05 0.09 0.46 0.38 0.14 -0.1 0.22 0.65 0.7 1.09 0.76 0.72 0.02 0.49 1.31 -0.11 -1.2 -2.66 -0.81 -3.01 -4.93 -2.48 -1.85 -1.88 -3.66 1.48 -0.07 -0.37 -1.19 -1.23 0.04 0.09
0.19 0.12 -0.61 -0.33 0.13 -0.12 0.34 0.01 0.36 0.22 0.5 0.36 -0.19 0.38 -0.01 -0.1 -0.68 -1.81 0.09 -1.58 0.87 -0.21 0.21 0.18 0.48 0.62 -0.16 -0.38 -0.69 -0.36 -0.58 -0.25
-0.39 -0.38 -0.15 0.1 0.13 -0.01 -0.01 0.41 0.17 0.33 0.34 -0.08 0.19 0.94 0.93 0.69 -0.79 -1.22 0.26 -1.29 -2.03 -2.58 0.41 0.51 -0.75 1.08 -0.42 -0.45 -0.36 -0.35 -0.34 -0.8
-0.33 -0.01 0.32 0.17 0.32 -0.05 0.18 0.24 0.38 0.78 0.59 0.03 0.43 0.09 1.09 0.49 -0.3 -0.24 -0.26 - - - -0.24 -0.28 - 1.12 -0.39 -0.15 -0.26 0.01 -0.27 0.19
-0.05 -0.05 0.07 0.2 0.16 0.11 0.21 0.51 0.63 0.9 0.86 0.73 -0.07 0.55 0.77 -0.07 -0.77 -1.25 -0.47 -1.49 -0.87 -2.84 -0.51 -0.41 -1.01 0.82 -0.17 0.0 -0.73 -0.67 -0.44 -0.34
0.09 -0.08 -0.29 -0.03 0.13 0.05 0.22 0.35 0.25 0.21 0.08 0.09 -0.09 -0.51 0.72 0.14 -0.26 -0.63 0.15 -1.06 -0.83 -2.37 -0.07 -0.08 0.78 0.68 0.12 0.06 -0.08 -0.02 -0.25 -0.24
0.02 -0.21 -0.14 -0.12 0.1 0.2 0.09 0.08 0.25 0.4 0.16 0.05 -0.15 -0.1 0.47 0.04 -0.04 -0.52 0.04 -1.47 0.07 -0.92 0.03 0.05 0.25 0.05 0.17 0.19 -0.17 -0.11 -0.08 0.13
-0.13 -0.18 -0.18 -0.08 -0.06 -0.12 -0.07 0.19 0.37 0.44 0.36 0.34 -0.03 0.26 0.52 0.11 -0.55 -0.86 -0.29 -0.15 -0.42 -0.65 -0.5 -0.39 0.28 1.03 0.17 0.18 -0.57 -0.45 -0.3 -0.05
-0.47 -0.45 -0.37 -0.26 -0.12 -0.03 0.12 0.41 0.32 0.42 0.5 0.32 0.16 0.61 1.02 0.12 -0.88 -0.74 -0.11 -0.21 -1.48 -1.61 -0.26 0.18 -1.07 1.55 0.12 0.06 -0.69 -0.57 -0.74 -0.71
0.1 -0.01 -0.0 0.03 0.12 -0.07 0.05 0.27 0.35 0.31 0.29 0.24 0.14 0.16 0.52 0.23 -0.78 -0.98 -0.1 -2.1 -0.28 -0.61 -0.29 -0.1 -0.04 0.99 0.36 0.34 -0.68 -0.61 -0.37 -0.25
0.2 -0.06 -0.1 0.08 0.02 -0.09 0.5 0.45 0.37 0.45 0.43 0.4 -1.03 -0.5 0.55 -0.26 -0.32 -0.03 0.29 0.08 0.05 -1.88 -0.42 -0.34 0.22 -0.33 0.48 0.34 -0.36 -0.23 -0.81 -0.73
0.09 0.12 0.05 0.25 0.27 0.27 0.15 0.34 0.29 0.29 0.27 0.28 -0.19 0.35 -0.18 0.44 -0.66 -1.22 0.19 -2.27 -0.81 -2.32 -0.51 -0.34 0.35 0.6 0.77 0.62 -0.36 -0.29 -0.6 -0.64
-1.09 -0.97 -0.56 -0.19 -0.58 -0.57 0.32 1.15 0.62 1.21 0.96 0.64 0.56 0.84 1.29 0.34 -1.06 -0.96 -0.31 -1.3 -2.73 -1.15 -1.1 -0.91 -1.02 1.32 -1.17 -1.52 -0.87 -0.91 -0.32 -0.2
-0.36 -0.52 -0.53 -0.38 -0.4 -0.34 0.12 0.47 0.4 0.39 0.28 0.01 0.18 -0.16 0.76 0.35 -0.48 -0.93 0.4 -1.55 -0.99 -0.92 0.07 0.67 0.12 0.96 0.07 0.14 -0.16 0.08 -0.44 -0.43
-0.07 -0.26 -0.38 -0.12 -0.18 -0.02 0.46 0.68 0.52 0.46 0.08 0.14 -0.67 0.23 0.66 -0.06 -1.02 -2.08 0.31 -0.95 0.35 -2.03 -0.97 -0.42 0.59 0.39 0.47 0.22 -0.45 -0.29 0.24 0.0
-0.11 -0.1 -0.1 0.06 0.22 0.18 0.18 0.7 0.61 0.65 0.54 0.27 0.3 -0.26 -0.08 0.3 -0.95 -1.38 -0.19 -1.52 -1.85 -1.38 -0.22 -0.04 -0.01 1.03 0.35 0.36 -0.46 -0.45 -0.55 -0.37
-0.13 -0.21 -0.14 0.11 0.02 -0.01 -0.04 0.34 0.29 0.34 0.36 0.04 0.28 1.14 0.59 0.47 -0.9 -1.24 0.04 0.17 -1.58 -2.13 -0.35 -0.22 -0.11 0.95 0.04 -0.11 -0.72 -0.73 -0.54 -0.24
0.17 -0.28 -0.44 -0.37 -0.29 -0.37 -0.35 0.25 0.5 0.52 0.53 0.35 0.62 0.51 1.08 0.14 -0.95 -1.04 -0.25 -0.74 -0.46 -0.99 -0.57 -0.11 -0.55 1.26 -0.08 -0.21 -0.49 -0.43 -0.37 -0.21
0.0 0.02 0.05 0.02 0.15 0.01 0.28 0.27 0.23 0.26 0.2 0.14 -0.04 0.29 0.44 0.12 -0.42 -0.78 0.02 -0.26 -0.22 -0.78 -0.29 -0.16 0.1 0.47 0.15 0.14 -0.38 -0.26 -0.32 -0.46
-0.25 -0.77 -0.62 -0.42 -0.75 -0.59 -0.24 0.86 0.66 1.06 0.73 0.72 0.71 -0.57 0.63 0.1 -1.21 -0.97 0.65 -0.05 1.29 -2.3 -1.34 -1.34 -0.87 0.93 0.42 0.37 -0.97 -0.98 -2.51 -2.59
-0.49 -0.39 -0.66 -0.42 -0.03 0.1 0.23 0.32 0.44 0.11 0.06 0.07 -0.2 -0.31 0.66 -0.25 0.17 0.06 -0.18 -4.74 -0.46 -2.76 0.09 0.31 0.93 0.63 0.32 -0.14 0.14 -0.08 0.23 -0.03
-0.04 -0.31 -0.04 -0.24 -0.15 -0.18 0.02 0.33 0.08 0.25 0.13 0.08 -0.42 0.03 0.57 -0.09 -0.45 -1.78 0.37 -0.82 0.67 -1.61 -0.21 -0.07 0.63 0.81 0.49 0.28 -0.24 -0.25 -0.37 -0.4
-0.04 -0.31 -0.04 -0.24 -0.15 -0.18 0.02 0.33 0.08 0.25 0.13 0.08 -0.42 0.03 0.57 -0.09 -0.45 -1.78 0.37 -0.82 0.67 -1.61 -0.21 -0.07 0.63 0.81 0.49 0.28 -0.24 -0.25 -0.37 -0.4
0.05 0.12 -0.21 -0.18 -0.16 -0.22 -0.16 -0.17 0.1 0.32 0.32 0.07 -1.45 -0.25 0.19 -1.11 -0.25 0.37 -0.35 0.34 0.9 -2.13 0.04 -0.13 1.21 -0.21 0.47 0.34 -0.75 -0.58 -0.2 -0.01
-0.58 -0.43 -0.24 -0.1 -0.01 -0.08 0.04 0.11 0.18 0.09 0.07 -0.17 -0.23 0.12 0.34 -0.01 -0.24 0.06 0.48 -0.75 -0.91 -0.67 0.47 0.22 0.2 0.84 0.06 0.15 -0.14 0.0 -0.25 -0.03
-0.24 -0.27 -0.26 -0.04 -0.03 0.11 0.4 0.31 0.56 0.81 0.49 0.42 -0.28 0.87 1.02 -0.31 -0.59 -1.69 -1.09 -2.26 0.73 -2.73 -1.15 -0.8 -0.45 1.39 0.07 0.27 -0.47 -0.42 -1.11 -1.18
-0.03 -0.39 -0.15 0.08 0.01 0.01 0.2 0.34 0.62 0.56 0.58 0.28 -0.41 0.06 1.53 -0.12 -0.34 -1.03 -0.11 -4.02 -0.85 -0.39 -1.11 -1.3 -1.64 0.71 0.51 0.68 -0.63 -0.45 -0.44 0.0
0.18 -0.73 0.13 -0.65 -1.15 -0.75 -0.84 -0.28 0.14 0.58 0.24 0.63 -3.84 0.87 -3.05 -2.2 -1.99 1.29 0.17 1.09 1.5 - -1.58 -1.64 0.24 0.94 -0.04 0.27 -0.12 -0.58 -0.05 0.37
-0.47 -1.0 -0.82 -0.46 -0.55 -0.17 0.19 0.6 0.62 0.77 0.74 0.22 0.28 0.44 0.54 0.27 -1.16 -1.17 0.34 -0.06 -0.59 -1.37 -0.38 -0.13 -0.85 1.1 0.05 -0.13 -0.56 -0.54 -0.1 0.21
-0.37 -0.61 -0.54 -0.3 -0.03 0.21 0.27 0.44 0.3 0.46 0.41 -0.24 0.23 0.89 0.78 0.27 -0.96 -2.53 -0.15 -2.5 -1.33 -0.33 -0.33 -0.22 -0.66 1.51 0.7 0.57 -0.91 -0.77 -0.7 -0.52
-0.39 -0.17 0.04 -0.05 0.02 -0.0 0.06 0.24 0.23 0.26 0.41 -0.04 0.44 0.52 0.98 0.57 -0.57 -0.55 -0.09 -1.25 -2.11 -3.15 0.1 0.23 -1.26 1.12 0.14 0.46 -0.46 -0.18 -0.77 -0.69
0.17 0.1 0.05 0.15 -0.01 0.08 0.33 0.46 0.49 0.63 0.4 0.24 -0.58 0.15 0.28 -0.22 -0.97 -1.21 -0.13 -1.4 -2.48 -2.44 -0.72 -0.52 -0.12 1.27 0.72 0.63 -0.48 -0.4 -0.16 -0.2
-0.41 -0.3 -0.16 -0.35 0.07 -0.08 0.07 0.17 0.32 0.48 0.22 0.16 0.14 0.27 -0.0 0.21 -0.53 -3.47 0.15 -1.63 0.77 -3.81 -0.34 -0.1 0.73 0.72 0.36 0.67 -0.29 -0.06 -0.4 -0.39
-0.26 -0.42 -0.24 -0.06 0.01 -0.06 0.07 0.35 0.44 0.52 0.34 0.12 0.46 0.99 0.88 0.39 -0.82 -1.35 -0.03 -0.86 -1.21 -5.14 -0.17 0.09 -1.26 1.33 0.24 0.26 -0.84 -0.68 -0.69 -0.63
-1.22 -0.63 0.27 0.37 0.14 -0.21 1.03 1.24 0.98 1.07 0.74 0.21 0.96 1.46 1.18 -1.38 -1.7 -2.4 -1.5 -3.56 -3.97 -2.44 -1.72 -1.53 -1.98 1.21 -0.07 -0.98 -1.08 -1.13 -1.05 -0.91
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0.17 0.13 0.13 0.16 0.24 0.12 0.13 0.24 0.39 0.28 0.29 0.11 0.16 0.21 0.17 0.13 -0.6 -0.69 0.37 -2.36 -0.76 -1.49 -0.28 -0.24 0.1 0.73 0.54 0.48 -0.51 -0.51 -0.74 -0.42
-0.18 -0.01 -0.02 0.12 -0.0 0.07 0.29 0.24 0.13 0.19 0.06 -0.01 0.02 -0.05 0.57 0.44 -0.26 -1.04 0.32 -0.49 0.38 -0.39 -0.35 -0.23 -0.63 0.54 0.3 0.22 -0.16 -0.11 -0.65 -0.8
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-0.41 -0.48 -0.28 -0.11 0.3 0.33 0.19 0.48 0.29 0.26 0.01 -0.09 0.32 -0.75 0.54 0.41 -0.73 -0.96 0.29 -1.75 -0.38 -0.35 -0.02 0.25 0.75 0.89 -0.09 0.08 0.02 0.15 -1.43 -1.52
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0.32 0.15 0.42 0.29 0.23 0.09 0.07 0.54 0.36 0.36 0.35 0.23 -0.16 0.61 0.23 0.33 -0.86 -1.9 0.09 -3.65 -0.78 -2.5 -0.48 -0.22 0.46 0.84 0.29 0.47 -0.53 -0.71 -0.91 -0.81
0.11 0.1 0.58 0.03 0.21 0.17 -0.6 0.12 0.42 0.02 0.22 -0.32 -0.81 0.41 0.78 -0.39 -1.23 -5.99 -0.7 -2.38 1.32 -3.02 -0.94 -0.61 1.3 0.64 0.62 1.17 -1.07 -1.02 -1.47 -1.19
-0.15 -0.14 0.03 0.14 0.24 0.27 0.51 0.61 0.64 0.73 0.59 0.47 0.35 0.68 1.18 0.01 -0.58 -1.53 -0.49 -1.86 -0.99 -1.98 -0.59 -0.45 -1.51 0.19 0.13 -0.17 -0.87 -0.68 -0.32 -0.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.