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Heatmap: Cluster_180 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.45 -0.61 -0.63 -0.28 -0.07 0.15 0.23 0.19 0.28 -0.03 -0.01 -0.17 -0.33 -0.0 -0.1 0.02 -0.34 0.07 -0.12 -0.37 -0.85 0.91 0.82 0.31 0.02 -0.06
-1.81 -1.18 -1.29 -0.49 -0.04 -0.15 0.43 0.11 0.43 0.58 0.71 0.37 -1.32 0.45 -0.42 -0.22 -0.36 -0.27 -0.26 -0.34 -2.38 0.77 1.18 0.41 0.13 -0.17
-4.6 -4.84 -4.54 -3.0 -2.83 -3.96 -3.06 -3.46 -3.54 -3.0 -2.63 -3.5 -3.49 1.08 0.67 0.67 0.33 0.41 0.1 -0.18 1.38 1.47 1.67 1.45 0.96 0.79
-1.14 -0.99 -0.7 -0.7 -0.68 -1.04 -0.55 -1.1 -0.61 -0.51 -0.46 -0.68 -2.1 0.64 0.54 0.01 0.32 0.51 0.57 0.02 0.69 0.42 0.9 0.71 0.59 0.55
-1.75 -0.94 -1.21 -0.63 -0.26 -0.72 -0.09 -0.47 0.16 -0.14 -0.02 -0.27 -1.51 0.74 -0.04 0.3 -0.06 0.36 0.23 -0.23 -2.33 0.86 1.38 0.84 -0.01 0.35
-1.63 -1.1 -0.46 -0.23 -0.21 0.16 0.36 0.23 0.37 -0.2 -0.45 -0.66 -1.33 0.4 -0.13 0.48 -0.07 0.22 -0.1 -0.05 -0.77 0.95 0.82 -0.31 0.43 0.25
-0.89 -0.46 -0.55 -0.3 -0.26 -0.5 0.07 0.08 0.31 0.27 0.39 0.15 -0.76 0.23 -0.05 0.16 -0.33 -0.2 -0.21 -0.57 -0.74 0.51 0.94 0.63 0.2 0.05
-1.9 -1.26 -0.93 -0.57 0.05 0.28 0.18 -0.08 0.19 -0.2 -0.41 -0.62 -1.63 0.79 0.23 0.59 0.19 0.35 0.23 0.14 -0.58 0.07 0.58 0.38 0.29 0.25
-0.86 -0.73 -0.68 -0.53 -0.29 -0.58 -0.36 -0.68 -0.4 -0.05 0.06 -0.03 -0.77 0.79 -0.2 0.58 -0.15 0.46 0.13 -0.26 -0.79 0.64 0.87 0.65 0.08 0.48
-1.9 -0.76 -0.69 -0.31 -0.36 -0.62 -0.53 -0.46 -0.79 -0.86 -0.84 -0.96 -1.84 0.15 0.28 0.28 0.04 0.67 0.45 -0.31 0.24 0.93 1.42 0.26 0.9 0.29
-0.68 -1.04 -1.25 -0.44 -0.42 -0.85 -0.36 -0.61 -0.4 -0.7 -0.59 -0.77 -1.02 -0.07 0.17 -0.05 -0.63 0.35 0.1 -0.44 0.8 1.14 1.09 0.96 0.79 0.46
-2.52 -3.2 -2.92 -2.27 -2.26 -2.56 -2.53 -3.24 -1.66 -2.02 -2.17 -1.71 -2.16 1.42 0.94 1.44 0.85 0.98 0.58 1.12 -2.72 -1.43 -0.15 1.08 1.27 1.42
-0.62 -1.04 -0.94 -0.55 -0.35 -0.53 -0.26 -0.19 -0.48 -0.48 -0.42 -0.87 -0.73 0.36 0.13 0.41 -0.02 0.79 0.27 -0.11 0.11 0.59 0.96 0.23 0.66 0.36
-1.08 -1.37 -1.37 -0.52 -0.54 -0.71 -0.1 0.01 0.18 -0.01 -0.18 -0.86 -1.41 0.31 -0.21 0.33 -0.23 0.53 0.02 -0.71 0.32 1.03 0.79 0.48 0.9 0.4
-1.12 -0.74 -0.67 -0.25 -0.04 -0.48 0.05 -0.18 0.14 -0.33 -0.28 -0.62 -1.35 -0.05 -0.03 -0.11 0.03 0.71 0.7 0.21 -0.98 0.82 0.97 0.3 0.11 0.32
-0.96 -0.67 -0.81 -0.45 0.04 -0.17 -0.01 0.11 0.34 0.24 0.24 -0.05 -0.82 0.38 -0.02 0.09 -0.32 0.05 -0.08 -0.52 -1.42 0.8 1.09 0.3 0.14 0.0
-3.55 -4.26 -2.13 -0.81 -0.26 -0.03 -0.07 -0.23 0.6 0.47 0.29 -0.18 -2.96 0.34 -0.02 0.43 0.09 0.32 -0.43 -0.16 -0.48 0.76 0.91 0.69 0.5 0.52
-0.83 -0.82 -0.6 -0.39 -0.4 -0.62 -0.04 -0.02 0.64 0.49 0.44 0.32 -0.68 0.73 0.15 0.62 -0.63 -0.23 -0.71 -0.62 -2.91 0.53 1.21 0.01 0.0 -0.09
-0.65 -0.47 -0.5 -0.21 -0.11 -0.19 -0.04 -0.18 -0.02 -0.2 -0.1 -0.5 -1.05 -0.32 0.22 0.08 -0.06 0.48 0.39 -0.07 -1.02 1.14 1.24 0.0 -0.14 -0.26
-1.27 -2.53 -2.33 -3.19 -3.32 -2.5 -0.93 -0.38 -0.08 -0.31 -0.19 -0.77 -0.42 0.08 0.08 -0.43 0.56 1.22 0.15 -1.02 0.32 -1.1 1.57 1.44 1.54 0.02
-5.75 -4.64 -8.57 -5.92 -5.09 -6.87 -5.55 -8.92 -5.81 -5.68 -5.51 -6.7 -7.33 0.83 0.22 0.52 0.36 1.39 1.07 0.71 0.81 0.86 1.82 0.84 1.43 1.14
-1.25 -0.7 -0.81 -0.65 -0.24 -0.38 -0.07 -0.28 -0.18 -0.31 -0.35 -0.34 -1.65 0.27 0.06 0.23 -0.08 0.26 0.06 -0.44 0.57 1.03 0.99 0.38 0.55 0.21
-0.77 -0.39 -0.66 -0.57 -0.29 -0.07 -0.12 -0.55 -0.01 0.15 0.05 0.06 -1.12 -0.03 0.05 0.77 0.03 0.24 0.17 0.04 -2.12 0.43 1.11 0.79 -0.19 -0.16
-2.09 -2.38 -2.13 -2.01 -1.31 -1.46 -1.18 -1.53 -1.05 -1.09 -0.91 -0.97 -1.94 0.26 -0.3 0.52 -0.17 0.42 0.17 0.64 0.86 1.39 1.4 1.45 0.44 0.81
-0.86 -0.38 -0.32 -0.2 -0.15 -0.29 -0.07 -0.06 -0.01 0.0 0.15 0.05 -0.72 0.01 0.03 0.13 -0.29 0.4 0.13 -0.3 -0.39 0.73 0.78 0.15 0.03 0.26
-3.67 -0.82 -0.27 -0.02 -0.22 -0.33 -0.01 -0.13 -0.08 -0.06 -0.03 -0.34 -3.05 0.33 0.46 0.38 0.16 0.33 0.27 -0.2 -0.24 0.71 0.8 0.27 0.35 0.14
-2.01 -1.62 -0.96 -0.05 0.17 0.29 -0.03 -0.39 -1.15 -1.21 -0.81 -0.81 -1.28 0.82 -0.06 0.89 0.18 0.36 0.29 0.11 -0.51 0.35 1.64 -0.17 -0.65 0.59
-1.77 -1.74 -1.41 -0.63 -0.44 -0.64 -0.12 -0.34 -0.03 0.06 0.12 -0.14 -1.56 0.45 -0.17 0.45 -0.27 0.54 -0.33 -0.43 0.66 0.8 0.98 0.56 0.54 0.34
-2.53 -2.51 -2.16 -1.18 -0.8 -0.3 -0.96 -1.23 -0.28 -0.35 -0.7 -1.35 -2.45 0.44 0.62 0.59 -0.45 0.66 0.38 0.04 0.94 1.64 1.12 0.54 0.31 -0.13
-0.87 -0.96 -0.98 -0.91 -0.74 -0.6 -1.03 -1.1 -0.62 -0.46 -0.42 -0.3 -0.66 0.55 0.44 0.89 0.23 0.31 0.35 0.25 -0.77 0.5 1.18 0.54 0.4 0.62
-3.64 -4.13 -1.6 -0.52 -0.01 0.24 0.07 -0.33 0.53 0.31 0.1 -0.04 -3.48 0.08 0.39 0.31 0.25 0.26 0.05 0.37 -0.76 0.69 0.82 0.32 0.05 0.52
-3.29 -1.6 -0.9 -0.28 -0.1 -0.26 -0.06 -0.1 0.07 0.09 -0.05 -0.33 -2.95 -0.04 0.47 0.7 0.07 0.5 -0.1 -0.34 -0.83 0.88 1.01 0.31 0.74 0.08
0.27 -0.03 -0.18 -0.14 0.05 0.02 -0.0 0.02 -0.31 0.01 -0.19 -0.18 0.15 -0.07 -0.2 0.25 -0.08 0.65 0.11 -0.43 -1.55 -0.9 0.75 -0.03 0.68 -0.34
-3.96 -1.42 -0.75 -0.4 -0.48 -0.07 -0.02 -0.29 -0.43 -0.41 -0.63 -0.74 -3.61 0.73 0.63 0.75 0.18 0.55 0.41 -0.12 -0.27 0.55 0.98 0.77 0.11 0.17
-3.08 -1.62 -1.34 -1.13 -0.87 -0.74 -0.42 -0.54 -0.02 0.06 -0.14 -0.44 -3.02 -0.12 0.19 0.28 -0.31 0.48 0.19 -0.07 0.46 1.74 0.87 1.23 -0.14 -0.06
-1.87 -2.27 -1.22 -1.25 -0.9 -0.13 -0.62 -0.79 -0.55 -0.44 -0.86 -0.9 -2.36 0.37 0.18 1.59 -0.15 0.06 0.63 -0.48 -0.48 0.9 1.61 0.27 0.55 0.42
-2.3 -3.54 -3.28 -2.77 -2.11 -1.3 -1.5 -2.07 -1.67 -0.92 -0.76 -0.87 -2.17 1.66 1.26 1.81 0.78 0.15 0.86 0.68 -0.95 -0.92 0.21 0.9 0.08 0.67
-1.03 -0.68 -0.33 -0.16 0.27 0.46 -0.27 -0.37 -0.47 -0.5 -0.23 -0.1 -1.16 0.46 -0.03 0.44 -0.06 -0.18 0.16 0.0 -0.47 0.75 1.09 0.13 -0.18 0.21
-0.82 -0.64 -1.12 -0.86 -0.41 -0.81 -0.4 -0.53 -0.8 -0.69 -0.69 -0.61 -0.75 0.23 0.06 0.08 -0.28 0.7 -0.05 -0.37 0.57 1.09 1.14 0.72 0.81 0.34
-4.64 - -3.63 -4.68 - - -4.43 - - - -3.06 -4.54 -4.24 1.69 0.1 1.83 1.69 1.18 1.29 1.61 -1.27 0.07 -3.51 0.63 0.6 1.06
-0.64 -0.56 -0.53 -0.21 -0.08 -0.47 -0.16 -0.2 -0.22 -0.27 -0.35 -0.64 -0.96 0.14 0.27 0.35 -0.04 0.45 0.44 -0.18 -0.46 0.6 0.97 0.26 0.26 0.37
-2.06 -1.51 -0.78 -0.5 -0.17 -0.06 0.15 0.12 0.47 0.28 -0.04 -0.12 -1.59 0.19 -0.25 0.38 -0.36 0.2 -0.4 -0.14 -0.99 0.81 0.98 0.46 0.41 0.51
0.39 -0.26 -0.69 -0.93 -0.71 -0.63 -0.09 0.11 -0.72 -0.54 -0.58 -0.75 0.34 0.11 0.74 0.01 0.06 0.49 0.5 -0.45 -0.07 0.02 0.69 0.03 0.48 0.34
0.31 0.28 -0.2 -0.31 -0.57 -0.68 -0.12 -0.17 0.16 -0.11 0.12 -0.3 -0.18 0.37 0.01 0.36 0.03 0.33 0.19 -0.26 -1.63 -0.34 0.55 0.14 0.42 0.11
-1.83 -1.39 -1.06 -0.92 -0.59 -0.78 -1.0 -0.85 0.35 0.21 0.08 -0.09 -1.39 0.04 0.47 0.41 -0.13 0.77 0.14 -0.17 0.31 0.75 0.96 0.34 0.33 0.55
-2.24 -2.12 -2.2 -1.54 -0.88 -0.33 0.29 0.04 0.6 0.32 0.01 -0.57 -1.69 0.29 0.19 -0.05 -0.59 0.03 -0.87 -0.79 0.99 1.09 1.3 0.36 0.51 0.29
- -7.15 -6.73 -5.65 -7.03 - - -6.71 - -6.78 - - - 1.84 1.03 1.43 0.61 0.83 0.72 0.66 -0.52 -0.39 1.55 1.38 0.78 1.26
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-0.14 0.06 -0.6 -2.69 -0.46 - -1.66 -0.41 -0.74 -1.23 - -1.68 0.55 -1.62 -2.86 -0.79 -1.06 1.41 -0.73 -1.86 -0.62 0.32 1.87 1.34 2.18 -0.09
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0.33 0.0 -0.29 -0.23 -0.68 -0.93 -0.78 -0.75 -0.71 -0.51 -0.46 -0.32 0.4 0.39 0.36 0.78 0.53 0.59 0.56 -0.41 -0.84 -0.28 0.82 -0.13 -0.03 0.06
-0.08 -0.48 -0.41 -0.31 -0.63 -1.31 -0.38 -0.48 -0.26 -0.05 -0.09 -0.25 -0.11 0.52 0.06 0.97 -0.0 0.69 0.35 -0.18 -1.49 0.16 0.49 -0.18 0.53 0.39
0.1 -0.1 -0.28 -0.0 -0.31 -0.71 0.09 0.09 0.0 -0.13 -0.02 0.05 -0.08 0.31 -0.17 -0.07 -0.04 0.62 -0.2 -0.23 -2.38 -1.05 0.5 0.76 0.43 0.39
-3.81 -2.84 -2.6 -1.29 -1.43 0.11 -0.15 -1.0 -1.3 -1.4 -2.1 -2.52 - 0.25 0.72 1.06 0.4 0.68 0.89 1.0 0.08 1.03 1.33 0.26 0.63 0.17
-0.77 -0.45 -0.52 -0.29 -0.06 -0.06 0.21 0.03 0.15 0.36 0.16 0.14 -0.74 0.39 -0.15 0.19 -0.25 0.21 0.01 -0.32 -1.09 0.44 0.53 0.42 0.1 0.03
0.54 0.64 -0.7 -0.27 -0.54 -0.59 -1.17 -0.58 -0.65 0.08 -0.21 0.36 -0.08 0.84 -0.08 1.11 -0.82 0.51 -0.1 -0.75 -2.65 0.15 0.44 -0.2 0.09 0.41
-0.13 -0.01 -0.51 -0.59 -0.54 -1.07 -0.62 -0.52 -0.47 -0.2 -0.01 -0.17 -0.57 0.89 0.2 1.18 -0.45 0.66 0.03 -0.54 -1.91 0.25 0.81 0.09 0.47 0.15
-1.55 -1.04 -0.4 -0.34 0.05 0.04 0.4 0.02 0.37 0.19 -0.22 -0.17 -2.56 0.17 0.2 0.53 0.02 0.52 0.08 0.11 -0.59 0.41 0.41 0.39 -0.09 0.01
-0.68 -1.04 -1.15 -1.33 -0.63 -1.03 -0.85 -1.11 -0.6 -0.02 0.08 0.05 -0.72 -0.34 -0.29 -0.11 -0.18 0.17 0.52 -0.1 0.33 0.92 1.3 1.39 -0.06 0.51
-0.28 -0.16 -0.52 -0.48 -0.6 -0.69 -0.1 -0.42 -0.25 -0.15 -0.26 -0.04 0.01 0.29 -0.05 0.14 0.12 1.13 0.45 -0.15 -1.64 0.07 0.35 -0.27 0.82 0.36
-1.7 -2.12 -1.94 -0.92 -0.52 -0.62 -0.27 -0.34 -0.3 -0.4 -0.71 -1.21 -1.25 0.97 0.41 0.72 0.27 0.78 0.33 0.37 -0.5 -0.04 1.23 0.21 0.51 0.74
-1.08 -0.56 -0.91 -0.43 -0.45 -0.47 -0.13 0.12 0.19 0.42 0.41 0.32 -0.73 -0.05 -0.71 -0.42 -0.69 0.25 -0.25 -0.5 -0.88 0.63 1.43 0.83 0.29 -0.03
-1.5 -0.89 -0.91 -0.43 -0.2 0.36 -0.05 -0.27 0.07 -0.33 -0.3 -0.6 -1.54 1.17 0.51 1.04 0.43 0.4 0.35 0.34 -1.25 -0.21 0.25 -0.31 -0.1 0.09
-0.8 -0.56 -0.71 -0.45 -0.43 -0.76 -0.54 -0.48 -0.18 0.15 -0.04 -0.09 -0.79 0.19 0.03 0.17 -0.31 0.6 0.11 -0.37 0.14 0.83 0.53 0.63 0.33 0.69
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-1.17 -0.99 -1.11 -0.78 -0.88 -0.76 -0.84 -1.04 -0.64 -0.57 -0.42 -0.32 -1.16 0.38 -0.11 -0.05 -0.03 0.93 0.38 -0.43 0.51 0.93 1.26 0.88 0.46 0.53
-4.44 -2.44 -1.97 -0.83 -0.06 0.18 0.46 -0.02 0.46 0.32 0.11 -0.79 -4.0 0.57 0.14 0.24 -0.09 0.01 -0.43 -0.85 -0.49 0.69 1.15 0.96 0.6 0.18
-2.74 -0.8 -1.13 -0.84 -0.56 -0.9 -0.3 -0.48 -0.06 -0.17 -0.21 -0.3 -2.76 0.34 0.51 0.5 0.25 0.03 0.27 0.05 -0.92 0.63 1.42 0.62 0.48 0.69

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.