1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.15 0.05 0.14 0.4 0.21 0.0 0.0 0.15 0.03 0.06 0.11
0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.22 0.51 0.88 0.6 0.54 1.56 0.55 0.0 0.03 0.0 0.02 0.07 0.07
0.1 0.13 0.02 0.07 0.1 0.15 0.08 0.04 0.09 0.13 0.08 0.12 0.08 0.1 0.22 0.22 0.2 0.33 0.43 0.07 0.32 0.19 0.08 0.12 0.22 0.3
0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.22 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.14 0.19 0.26 0.1 0.35 0.47 0.25 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.07
0.04 0.0 0.0 0.23 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.07 0.0 0.03 0.11 0.12 0.0 0.07 0.12 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.16 0.29 0.39 0.22 0.6 0.24 0.04 0.0 0.0 0.06 0.04 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
0.11 0.08 0.07 0.04 0.17 0.19 0.1 0.11 0.07 0.12 0.04 0.09 0.1 0.92 0.99 1.14 0.88 0.67 0.98 0.98 0.13 0.05 0.02 0.02 0.18 0.24
0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.05 0.03 0.21 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.02 0.03 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.06 0.08 0.02 0.0 0.05 0.22 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.04 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.52 0.16 0.29 0.09 0.11 0.33 0.46 0.24 0.33 0.58 0.34 0.3 0.26 0.85 0.84 1.39 0.58 0.9 1.08 0.65 0.13 0.5 0.05 0.21 0.49 0.53
0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.55 0.64 0.81 0.27 0.49 0.63 0.63 0.04 0.0 0.1 0.27 0.1 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.85 1.99 1.91 1.38 1.58 2.56 0.81 0.18 0.89 0.03 0.2 0.25 0.92
0.05 0.0 0.03 0.05 0.09 0.02 0.02 0.08 0.02 0.08 0.02 0.09 0.02 3.5 4.55 3.05 1.87 1.76 4.7 2.76 0.4 0.94 0.21 0.82 1.05 0.5
0.0 0.15 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.04 0.04 0.05 0.0 1.82 1.88 1.29 1.33 1.2 1.96 1.02 0.19 0.22 0.16 0.33 0.22 0.26
0.0 0.07 0.07 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.08 0.12 0.0 0.1 0.0 0.13 0.0 0.21 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.24 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.05 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 0.32 0.21 0.06 0.29 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.03 0.16 0.19 0.37 0.18 0.09 0.34 0.41 0.04 0.03 0.07 0.02 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.02 0.22 0.05 0.03 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.04 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 1.99 2.95 0.0 0.16 0.44 0.19 0.29 0.36 0.16 0.36 0.09 0.31 0.62 6.75 6.02 0.43 0.71 0.75 0.16 0.18 0.3 0.37 0.08 0.24 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.33 0.33 0.2 0.05 0.16 0.45 0.35 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.18 0.04 0.21 0.04 0.05 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.02 0.01 0.0
0.04 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 0.14 0.0 0.22 0.79 1.56 0.5 0.22 0.77 0.51 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.08 0.0 0.0 0.2 0.23 0.04 0.0 0.05 0.11 0.15 0.0 0.19 1.34 0.91 1.23 0.35 0.62 1.63 1.11 0.22 0.03 0.07 0.2 0.1 1.12
0.16 0.23 0.24 0.27 0.22 0.1 0.13 0.58 0.56 0.12 0.13 0.09 0.11 0.36 0.08 0.89 0.3 0.06 0.47 0.39 0.13 0.1 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 0.11 0.15 0.0 0.12 0.12 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.16 0.13 0.09 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.24 0.0 0.02 0.02 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.07 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.06 0.0 0.17
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.02 0.0 0.05 0.06 0.01 0.0 0.04 0.0 0.23 0.31 0.12 0.16 0.07 0.1 0.0 0.34 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.03 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.12
0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.12 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.19 0.14 0.17 0.05 0.2 0.0 0.14 0.08 0.09 0.05 0.1 0.34 0.46 0.19 0.33 0.32 0.74 0.38 0.0 0.19 0.06 0.25 0.11 0.32
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.1 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)