Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.48 0.45 0.0 1.0 0.61 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.1 0.38 0.12 0.34 1.0 0.51 0.0 0.0 0.36 0.08 0.14 0.28
0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.14 0.33 0.57 0.39 0.35 1.0 0.35 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.04
0.22 0.31 0.05 0.15 0.22 0.35 0.2 0.09 0.21 0.29 0.19 0.27 0.18 0.24 0.52 0.5 0.45 0.76 1.0 0.16 0.73 0.45 0.19 0.28 0.52 0.68
0.0 0.07 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 0.47 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.3 0.4 0.55 0.22 0.76 1.0 0.53 0.0 0.15 0.07 0.0 0.0 0.16
0.17 0.0 0.0 0.9 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.18 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.27 0.0 0.13 0.44 0.49 0.0 0.26 0.49 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.56 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.27 0.49 0.65 0.36 1.0 0.39 0.07 0.0 0.0 0.1 0.07 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.8
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.36 0.0 0.0 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.1 0.07 0.06 0.04 0.14 0.17 0.09 0.1 0.06 0.11 0.04 0.08 0.09 0.81 0.87 1.0 0.77 0.59 0.86 0.86 0.11 0.04 0.01 0.02 0.16 0.21
0.56 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.4 0.24 0.12 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.49 0.0 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.54 0.0 0.31 0.0 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.07 0.12 0.0 0.34 0.0 0.14 0.0 0.1 0.0 0.2 0.11 0.0 0.25 0.37 0.1 0.0 0.24 1.0 0.0 0.52 0.23 0.0 0.0 0.19 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.34 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0
0.38 0.12 0.21 0.06 0.08 0.23 0.33 0.17 0.24 0.42 0.25 0.22 0.18 0.61 0.61 1.0 0.42 0.64 0.77 0.47 0.09 0.36 0.03 0.15 0.35 0.38
0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.67 0.79 1.0 0.34 0.6 0.78 0.78 0.06 0.0 0.12 0.33 0.12 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.78 0.74 0.54 0.62 1.0 0.32 0.07 0.35 0.01 0.08 0.1 0.36
0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.75 0.97 0.65 0.4 0.38 1.0 0.59 0.09 0.2 0.04 0.17 0.22 0.11
0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.02 0.02 0.0 0.93 0.96 0.66 0.68 0.61 1.0 0.52 0.1 0.11 0.08 0.17 0.11 0.13
0.0 0.28 0.25 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.32 0.48 0.0 0.39 0.0 0.52 0.0 0.81 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.77 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.0 0.12 0.0 0.14 0.0 0.14 0.28 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.21 0.89 0.57 0.16 0.81 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.25 0.07 0.05 0.0 0.05 0.1 0.0 0.07 0.39 0.47 0.9 0.43 0.21 0.83 1.0 0.09 0.08 0.17 0.05 0.07 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.33 0.09 1.0 0.23 0.14 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0
0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.28 0.23 0.86 0.27 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.17 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.3 0.44 0.0 0.02 0.07 0.03 0.04 0.05 0.02 0.05 0.01 0.05 0.09 1.0 0.89 0.06 0.11 0.11 0.02 0.03 0.05 0.05 0.01 0.04 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.0 0.09 0.2 0.0 0.21 0.0 0.0 0.23 0.09 0.0 0.0 0.72 0.74 0.44 0.11 0.35 1.0 0.78 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.33
0.0 0.0 0.0 0.87 0.17 1.0 0.21 0.24 0.56 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.0 0.51 0.0 0.23 0.0 0.24 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.99 0.0 0.22 0.15 0.0
0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.09 0.0 0.14 0.51 1.0 0.32 0.14 0.5 0.33 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.05 0.0 0.0 0.12 0.14 0.03 0.0 0.03 0.06 0.09 0.0 0.12 0.82 0.56 0.75 0.21 0.38 1.0 0.68 0.13 0.02 0.04 0.12 0.06 0.69
0.18 0.26 0.27 0.3 0.24 0.11 0.15 0.65 0.63 0.14 0.14 0.1 0.13 0.41 0.09 1.0 0.34 0.07 0.52 0.44 0.15 0.12 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.59 0.83 0.0 0.66 0.69 0.0 0.1 0.0 0.18 0.0 0.24
0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 0.69 0.56 0.4 0.1 0.09 0.09 0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.0 0.06 0.07 0.07 0.34 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.41 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.0 0.44 0.26 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.12 0.0 0.0 0.56 0.0 0.08 0.0 0.0 0.27 0.33 0.0 0.36 0.0 1.0
0.0 0.96 0.0 0.0 1.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.59
0.0 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.28 0.0 0.04 0.0 0.1 0.13 0.03 0.0 0.09 0.0 0.51 0.68 0.25 0.34 0.15 0.21 0.0 0.73 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.13 0.0 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 1.0
0.34 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.34 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
0.0 0.0 0.53 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.61 0.0 0.0 1.0 0.28 0.44 0.0 0.0 0.0 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.2 0.0 0.2 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.19 1.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.25 0.19 0.23 0.07 0.27 0.0 0.18 0.11 0.12 0.06 0.13 0.46 0.62 0.26 0.45 0.44 1.0 0.52 0.0 0.25 0.08 0.34 0.15 0.44
0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.34 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.6 0.0 1.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.43 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.87 0.0 0.4 0.0 0.0 0.65 0.0 0.68 1.0 0.0 0.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)